More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_0479 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 265 aa  527  1e-149  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1711  GntR family transcriptional regulator  78.78 
 
 		 255 aa  346  2e-94  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.950871  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  55.96 
 
 		 228 aa  243  3e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 257 aa  180  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0763  GntR family transcriptional regulator  42.24 
 
 		 261 aa  174  9.999999999999999e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.661871  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6001  transcriptional regulator, GntR family  41.01 
 
 		 240 aa  158  1e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6491  transcriptional regulator, GntR family  41.47 
 
 		 239 aa  151  8e-36  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  39.61 
 
 		 229 aa  148  9e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4499  GntR family transcriptional regulator  38.32 
 
 		 239 aa  136  3.0000000000000003e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.928158  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1861  GntR family transcriptional regulator  38.91 
 
 		 264 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 227 aa  130  2.0000000000000002e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2639  transcriptional regulator, GntR family  35.92 
 
 		 228 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.995505  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5712  transcriptional regulator, GntR family  38.64 
 
 		 231 aa  130  2.0000000000000002e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.222073  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1047  transcriptional regulator, GntR family  36 
 
 		 230 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0978  transcriptional regulator, GntR family  38.53 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.134109  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6285  transcriptional regulator, GntR family  36.32 
 
 		 234 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1127  GntR family transcriptional regulator  36 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.345812 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0535  GntR family transcriptional regulator  37.56 
 
 		 237 aa  125  7e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.150614  normal  0.571261 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2107  GntR family transcriptional regulator  37.88 
 
 		 244 aa  125  8.000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0604546  normal  0.665186 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1266  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 228 aa  125  8.000000000000001e-28  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0806  transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 		 228 aa  124  1e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.459024  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1040  transcriptional regulator, GntR family  34.95 
 
 		 228 aa  124  2e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4469  GntR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 228 aa  123  3e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4726  transcriptional regulator, GntR family  37.14 
 
 		 277 aa  123  4e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0963465  normal  0.842406 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2752  GntR family transcriptional regulator  40.37 
 
 		 240 aa  122  7e-27  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.868488 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0909  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 212 aa  117  9.999999999999999e-26  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.730812  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5836  GntR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 230 aa  118  9.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 229 aa  118  9.999999999999999e-26  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3567  GntR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 228 aa  116  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3275  transcriptional regulator, GntR family  35.1 
 
 		 242 aa  116  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.906073 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1001  transcriptional regulator, GntR family  34.78 
 
 		 241 aa  116  5e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0721326 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2973  GntR family transcriptional regulator  38.46 
 
 		 248 aa  115  5e-25  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.010833  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5239  GntR family transcriptional regulator  35.75 
 
 		 227 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.624054 
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6243  transcriptional regulator, GntR family  29.95 
 
 		 234 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.794552 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5061  transcriptional regulator GntR family  31.19 
 
 		 234 aa  113  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  35.94 
 
 		 212 aa  112  5e-24  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5067  GntR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 226 aa  112  7.000000000000001e-24  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.722709 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  35.43 
 
 		 224 aa  112  7.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2122  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 241 aa  112  8.000000000000001e-24  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4056  transcriptional regulator, GntR family  27.04 
 
 		 231 aa  109  4.0000000000000004e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 229 aa  108  7.000000000000001e-23  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02430  transcriptional regulator, GntR family  32.74 
 
 		 237 aa  108  1e-22  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0732513  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3891  transcriptional regulator GntR family  31.8 
 
 		 231 aa  108  1e-22  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.556155  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4007  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 233 aa  107  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3213  GntR family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 284 aa  106  4e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  36.63 
 
 		 223 aa  105  5e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0489  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 238 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2552  GntR family transcriptional regulator  39.01 
 
 		 245 aa  105  6e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.00000205206  normal  0.288206 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2140  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 238 aa  105  6e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0432435  normal  0.768948 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2816  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 		 235 aa  105  7e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00368325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2413  GntR family transcriptional regulator  32.89 
 
 		 238 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224265  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5406  transcriptional regulator, GntR family  33.33 
 
 		 239 aa  105  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.723673  hitchhiker  0.00193724 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0513  transcriptional regulator, GntR family  35.26 
 
 		 238 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.332909  normal  0.319587 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0500  transcriptional regulator, GntR family  35.26 
 
 		 240 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.162166  normal  0.780963 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3193  transcriptional regulator, GntR family  30 
 
 		 225 aa  104  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.367816  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1938  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 228 aa  102  4e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0723  GntR family transcriptional regulator  35.68 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.214964  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5037  GntR family transcriptional regulator  34.9 
 
 		 216 aa  102  7e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.641243  hitchhiker  0.00313463 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1625  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 228 aa  102  8e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000899292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  32.09 
 
 		 222 aa  102  9e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4032  GntR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 234 aa  102  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01499  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.73 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000422433  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2105  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  1.45704e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1749  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000222448  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2118  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000151748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2156  transcriptional regulator, GntR family  30.73 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000000156729  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5350  transcriptional regulator, GntR family  32.88 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.588797 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  33.51 
 
 		 239 aa  101  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1630  GntR family transcriptional regulator  30.73 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  3.79226e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2970  GntR family transcriptional regulator  30.09 
 
 		 229 aa  101  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01510  hypothetical protein  30.73 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000749692  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1700  transcriptional regulator, GntR family  30.24 
 
 		 228 aa  99.8  4e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.00000000855657  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4161  GntR family transcriptional regulator  31.07 
 
 		 235 aa  99.4  6e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5133  GntR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 243 aa  98.6  9e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  28.99 
 
 		 227 aa  97.8  1e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  32.99 
 
 		 235 aa  97.8  1e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4600  GntR family transcriptional regulator  37.86 
 
 		 245 aa  98.2  1e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0583861  normal  0.697255 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2096  transcriptional regulator, GntR family  35.57 
 
 		 237 aa  97.8  2e-19  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1595  GntR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 231 aa  97.1  3e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000118605  normal  0.686931 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  31.61 
 
 		 230 aa  96.7  3e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0644  GntR family transcriptional regulator  34.03 
 
 		 244 aa  95.9  6e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.412108  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3795  transcriptional regulator, GntR family  31.05 
 
 		 229 aa  95.9  6e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.326665  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4046  GntR family transcriptional regulator  36.93 
 
 		 235 aa  95.5  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3878  transcriptional regulator, GntR family  31.05 
 
 		 229 aa  95.9  7e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.709818 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2698  GntR family transcriptional regulator  34.69 
 
 		 232 aa  95.5  8e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.132882 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0509  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 255 aa  95.1  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.223436  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4793  transcriptional regulator, GntR family  32.84 
 
 		 244 aa  94.7  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00330899  hitchhiker  0.000000951338 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 234 aa  94.7  1e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1848  transcriptional regulator, GntR family  35.08 
 
 		 211 aa  95.1  1e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1929  GntR family transcriptional regulator  31.73 
 
 		 249 aa  94.7  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 238 aa  95.1  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1747  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 226 aa  94.7  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0442594  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3298  GntR family transcriptional regulator  35.03 
 
 		 226 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.197273 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2127  transcriptional regulator, GntR family  33.17 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1700  GntR family transcriptional regulator  33.48 
 
 		 238 aa  94  2e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00690032  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2039  GntR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 211 aa  94  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5598  GntR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 253 aa  94.4  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2095  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2000  GntR family transcriptional regulator  36.89 
 
 		 241 aa  94  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0216224  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>