More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_4206 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_4206  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
275 aa  546  1e-155  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.381827  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4272  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
275 aa  546  1e-155  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.328456  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4433  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 
275 aa  546  1e-155  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0935  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.34 
 
 
370 aa  92.4  8e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41750  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  30.19 
 
 
370 aa  89  8e-17  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.942263  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10240  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.95 
 
 
370 aa  89  8e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0396  alpha/beta hydrolase fold protein  33.05 
 
 
255 aa  88.6  9e-17  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.075233 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  32.08 
 
 
277 aa  86.7  4e-16  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.47 
 
 
380 aa  80.9  0.00000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3758  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.87 
 
 
370 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.239484  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3040  alpha/beta fold family hydrolase  30.74 
 
 
258 aa  79.3  0.00000000000007  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3429  alpha/beta hydrolase fold protein  31.11 
 
 
270 aa  79  0.00000000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.210707 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0879  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
278 aa  78.6  0.0000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.101145 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3245  alpha/beta hydrolase fold  31.09 
 
 
271 aa  77  0.0000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3731  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.92 
 
 
372 aa  76.3  0.0000000000005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0565  alpha/beta hydrolase fold protein  31.75 
 
 
270 aa  74.7  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.441314  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.8 
 
 
368 aa  73.6  0.000000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0315  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.39 
 
 
370 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1402  alpha/beta hydrolase fold protein  29.79 
 
 
298 aa  72.8  0.000000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0653602  normal  0.476592 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0832  alpha/beta hydrolase fold  29.04 
 
 
266 aa  72.8  0.000000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.8 
 
 
368 aa  72.4  0.000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.8 
 
 
368 aa  72  0.00000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4043  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  24.44 
 
 
372 aa  71.2  0.00000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.140528  normal  0.0217743 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2964  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 
282 aa  70.9  0.00000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.80837 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2092  alpha/beta hydrolase fold  27.03 
 
 
275 aa  70.9  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.168465  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4115  alpha/beta hydrolase fold  36.72 
 
 
280 aa  70.1  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4026  alpha/beta hydrolase fold protein  24.34 
 
 
298 aa  70.1  0.00000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2691  3-oxoadipate enol-lactonase  40.68 
 
 
266 aa  69.3  0.00000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.000109702  normal  0.164043 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2410  alpha/beta hydrolase fold protein  26.97 
 
 
265 aa  68.9  0.00000000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.991498  normal  0.124354 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0475  alpha/beta hydrolase fold protein  25.29 
 
 
290 aa  68.2  0.0000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  29.41 
 
 
286 aa  68.2  0.0000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1778  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 
366 aa  68.2  0.0000000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0401666  normal  0.253947 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2629  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 
263 aa  68.6  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000000794828  hitchhiker  0.00279844 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3798  alpha/beta hydrolase fold protein  24.9 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  26.72 
 
 
284 aa  67  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  35.19 
 
 
252 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3527  alpha/beta hydrolase fold  32.35 
 
 
257 aa  66.6  0.0000000004  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.425595  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2101  alpha/beta hydrolase fold  27.2 
 
 
285 aa  66.6  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.715377  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1222  Alpha/beta hydrolase fold  21.48 
 
 
262 aa  66.6  0.0000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  28.37 
 
 
283 aa  66.6  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1600  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.91 
 
 
371 aa  66.6  0.0000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1436  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.28 
 
 
371 aa  66.6  0.0000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00517321 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1720  thioesterase, menaquinone synthesis protein  29.06 
 
 
265 aa  65.9  0.0000000007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3768  hydrolase, alpha/beta fold family  32.35 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000504294 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3601  alpha/beta fold family hydrolase  32.35 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3887  alpha/beta fold family hydrolase  32.35 
 
 
257 aa  65.5  0.0000000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  31.58 
 
 
276 aa  65.5  0.000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6938  alpha/beta hydrolase fold protein  25.91 
 
 
279 aa  65.5  0.000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.178748 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1227  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 
387 aa  65.1  0.000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0447  hydrolase  21.98 
 
 
269 aa  65.1  0.000000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3501  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.55 
 
 
374 aa  64.7  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0571139 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5918  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  23.62 
 
 
370 aa  64.7  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 
260 aa  64.7  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2404  alpha/beta hydrolase fold  27.57 
 
 
301 aa  64.7  0.000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00367269 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2103  alpha/beta hydrolase fold  28.67 
 
 
352 aa  63.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.225702  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0693  alpha/beta hydrolase fold  25 
 
 
258 aa  64.7  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6440  alpha/beta hydrolase fold  23.86 
 
 
268 aa  63.9  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.200854 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1234  alpha/beta hydrolase fold  25.59 
 
 
262 aa  63.2  0.000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3857  hydrolase, alpha/beta fold family  31.37 
 
 
257 aa  63.2  0.000000004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  25.44 
 
 
296 aa  63.5  0.000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2405  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.07 
 
 
369 aa  63.5  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0222007  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3642  alpha/beta fold family hydrolase  25.42 
 
 
262 aa  63.5  0.000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  26.49 
 
 
308 aa  63.2  0.000000005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2090  alpha/beta hydrolase fold  23.95 
 
 
267 aa  63.2  0.000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2086  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 
263 aa  63.2  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1142  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  38.74 
 
 
390 aa  62.8  0.000000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.152589  normal  0.697753 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2194  alpha/beta hydrolase fold protein  28.9 
 
 
350 aa  62.8  0.000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.984262  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0353  alpha/beta hydrolase fold  36.28 
 
 
256 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2631  alpha/beta hydrolase fold protein  26.01 
 
 
268 aa  62.8  0.000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.794805 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2674  3-oxoadipate enol-lactone hydrolase family protein  34.02 
 
 
282 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.373688  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0646  alpha/beta hydrolase fold protein  27.4 
 
 
265 aa  62.8  0.000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12729  hydrolase  32.04 
 
 
341 aa  62.8  0.000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2696  putative hydrolase  26.47 
 
 
387 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6242  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.84 
 
 
371 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1861  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  26.02 
 
 
371 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0337473  normal  0.0227354 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1837  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  25.84 
 
 
371 aa  62.4  0.000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.282403  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2172  alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 
340 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1681  alpha/beta hydrolase fold  34.51 
 
 
273 aa  62.4  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0641945  normal  0.147127 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2218  alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 
340 aa  62.4  0.000000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.158046  normal  0.0966577 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2024  alpha/beta hydrolase fold  38 
 
 
329 aa  62.4  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.44574 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2445  alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 
340 aa  62  0.000000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.54824  normal  0.191947 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2161  alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 
340 aa  62  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.170083  hitchhiker  0.00519685 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1025  alpha/beta hydrolase fold protein  40.4 
 
 
301 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1736  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.87 
 
 
320 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3719  alpha/beta hydrolase fold  37.61 
 
 
260 aa  61.6  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.815141  hitchhiker  0.00169195 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  34.86 
 
 
265 aa  61.6  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3399  alpha/beta hydrolase fold protein  26.57 
 
 
283 aa  61.6  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1310  alpha/beta hydrolase fold  32.81 
 
 
269 aa  62  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.557665  normal  0.708974 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1084  alpha/beta hydrolase fold  26.3 
 
 
387 aa  61.6  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3821  alpha/beta hydrolase fold  27.11 
 
 
256 aa  61.6  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3952  alpha/beta hydrolase fold  32.04 
 
 
340 aa  61.6  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.675872  normal  0.742045 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  31.48 
 
 
259 aa  60.8  0.00000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5939  3-oxoadipate enol-lactonase  25.97 
 
 
275 aa  61.2  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.178478 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5046  alpha/beta hydrolase fold protein  35.19 
 
 
281 aa  60.8  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.186398  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1152  alpha/beta hydrolase fold protein  31.61 
 
 
239 aa  60.8  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2165  alpha/beta hydrolase fold protein  25.14 
 
 
255 aa  60.8  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  31.19 
 
 
314 aa  60.8  0.00000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4523  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  24.9 
 
 
271 aa  61.2  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.104364  normal  0.231171 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2061  alpha/beta hydrolase fold  35.71 
 
 
368 aa  60.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.112445  normal  0.60255 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  23.44 
 
 
456 aa  61.2  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>