More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_0795 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



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Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_0795  TetR family transcriptional regulator  100 
 
 
199 aa  409  1e-113  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00985009  normal  0.205797 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1255  TetR family transcriptional regulator  62.63 
 
 
200 aa  254  6e-67  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0335  transcriptional regulator, TetR family  38.97 
 
 
197 aa  123  1e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0635756  normal  0.0355079 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3816  TetR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
201 aa  104  7e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0181155  normal  0.234249 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0127  transcriptional regulator, TetR family  34.97 
 
 
193 aa  101  8e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0803  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
196 aa  99.4  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0770  TetR family transcriptional regulator  32.97 
 
 
196 aa  98.2  6e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0436  TetR/AcrR family transcriptional regulator  36.02 
 
 
193 aa  97.1  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00014648  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2215  TetR family transcriptional regulator  33.88 
 
 
215 aa  96.7  2e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0480  transcriptional regulator, TetR family  32.24 
 
 
205 aa  93.6  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0888  TetR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
203 aa  93.6  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3088  transcriptional regulator of TetR family protein  29.26 
 
 
198 aa  93.2  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.119848 
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C37  transcriptional regulator  30.89 
 
 
191 aa  90.9  1e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3038  transcriptional regulator, TetR family  32.97 
 
 
209 aa  86.7  2e-16  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.051717 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1100  TetR family transcriptional regulator  31.32 
 
 
194 aa  83.6  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0669836  normal  0.61487 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0208  TetR family transcriptional regulator  30.32 
 
 
191 aa  83.2  0.000000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1025  transcriptional regulator, TetR family  30.73 
 
 
192 aa  80.9  0.00000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0162  TetR family transcriptional regulator  30.05 
 
 
201 aa  80.5  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3357  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
211 aa  79.3  0.00000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0594456 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0251  TetR family transcriptional regulator  33.52 
 
 
212 aa  78.6  0.00000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.714148  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0064  TetR family transcriptional regulator  30.94 
 
 
210 aa  78.6  0.00000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1045  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 
222 aa  78.2  0.00000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3409  TetR family transcriptional regulator  30.56 
 
 
212 aa  78.2  0.00000000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1137  transcriptional regulator, TetR family  33.71 
 
 
209 aa  77.8  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.13929  normal  0.961099 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4743  TetR family transcriptional regulator  33.53 
 
 
212 aa  77.4  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1201  transcription regulator protein  33.33 
 
 
209 aa  76.6  0.0000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.582864  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0287  TetR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
200 aa  76.6  0.0000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000147212 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2580  TetR family transcriptional regulator  31.28 
 
 
211 aa  76.3  0.0000000000003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.257801 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0268  TetR family transcriptional regulator  30.17 
 
 
202 aa  76.3  0.0000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.329049 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5462  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5400  TetR family transcriptional regulator  33.7 
 
 
212 aa  76.3  0.0000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00236367 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0479  TetR family transcriptional regulator  32.77 
 
 
207 aa  75.5  0.0000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2645  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
194 aa  74.7  0.0000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.154552  normal  0.491764 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0765  transcriptional regulator, TetR family protein  30.9 
 
 
222 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1527  TetR family transcriptional regulator  32.24 
 
 
212 aa  73.6  0.000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5288  TetR family transcriptional regulator  33.14 
 
 
186 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2304  transcriptional regulator, TetR family  30.56 
 
 
201 aa  72.8  0.000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4870  TetR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
186 aa  73.2  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.318456  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0476  TetR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
196 aa  72.4  0.000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.146337 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5089  transcriptional regulator, TetR family  27.81 
 
 
198 aa  72  0.000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1603  transcriptional regulator, TetR family  28.88 
 
 
213 aa  71.6  0.000000000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001314  transcriptional regulator  28.33 
 
 
199 aa  71.6  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1980  transcriptional regulator, TetR family  25.39 
 
 
206 aa  71.2  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0187  TetR family transcriptional regulator  24.87 
 
 
202 aa  71.6  0.000000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.458714  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4360  regulatory protein TetR  30.21 
 
 
200 aa  71.2  0.000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3076  transcriptional regulator, TetR family  30.98 
 
 
193 aa  69.7  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.192901  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25370  Transcriptional regulatory protein, TetR  31.52 
 
 
209 aa  69.7  0.00000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2933  regulatory protein, TetR  31.69 
 
 
193 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.316351  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2558  TetR family transcriptional regulator  29.07 
 
 
190 aa  69.3  0.00000000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0865  TetR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
211 aa  69.3  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0962  TetR family transcriptional regulator  27.81 
 
 
200 aa  68.9  0.00000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_36300  TetR family transcriptional regulator  28.57 
 
 
194 aa  68.9  0.00000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.564712  normal  0.0790295 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3353  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
195 aa  68.9  0.00000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2754  regulatory protein, TetR  29.94 
 
 
219 aa  68.6  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.396057  normal  0.0231562 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3721  transcriptional regulator, TetR family  29.14 
 
 
196 aa  68.6  0.00000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0437946 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2203  TetR family transcriptional regulator  30.65 
 
 
206 aa  68.6  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0627793  hitchhiker  0.000036044 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3100  putative transcriptional regulator  30 
 
 
194 aa  67.8  0.00000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.209779  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2426  TetR family transcriptional regulator  26.23 
 
 
205 aa  67.4  0.0000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5870  TetR family transcriptional regulator  30.35 
 
 
209 aa  66.6  0.0000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2488  TetR family transcriptional regulator  25.91 
 
 
201 aa  66.6  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0524247 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1493  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05195  transcriptional regulator  29.63 
 
 
195 aa  66.2  0.0000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1408  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1058  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2293  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
247 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.887651  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0809  transcriptional regulator, TetR family  29.94 
 
 
214 aa  66.2  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0974  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.543907  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0121  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3993  transcriptional regulator, TetR family protein  31.85 
 
 
194 aa  66.2  0.0000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000102791  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0527  TetR family transcriptional regulator  29.29 
 
 
200 aa  66.2  0.0000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.474473  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18450  transcriptional regulator, TetR family  31.29 
 
 
179 aa  65.9  0.0000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0268  transcriptional regulator, TetR family  26.37 
 
 
198 aa  65.5  0.0000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5341  transcriptional regulator, TetR family  29.08 
 
 
204 aa  65.5  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.087744  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2231  TetR family transcriptional regulator  28.21 
 
 
194 aa  65.5  0.0000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.558633  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2372  transcriptional regulator, TetR family  25.5 
 
 
193 aa  65.5  0.0000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.74201  normal  0.115149 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0264  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 
198 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0272  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 
198 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4476  TetR family transcriptional regulator  27.53 
 
 
220 aa  64.7  0.0000000008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000182515 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0272  TetR family transcriptional regulator  28.49 
 
 
198 aa  64.7  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4097  transcriptional regulator, TetR family  27.93 
 
 
194 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1606  TetR family transcriptional regulator  27.64 
 
 
206 aa  63.9  0.000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0686792  normal  0.0717181 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0083  TetR family transcriptional regulator  33.13 
 
 
219 aa  63.9  0.000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.201393  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1435  TetR family regulatory protein  33.13 
 
 
219 aa  63.9  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1702  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 
311 aa  63.2  0.000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0016  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
206 aa  63.2  0.000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.951687  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6109  TetR family transcriptional regulator  29.85 
 
 
209 aa  63.9  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0617571  normal  0.147608 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0541  TetR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
220 aa  63.9  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5954  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
206 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.419182  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3964  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
206 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1955  transcriptional regulator, TetR family  44.32 
 
 
202 aa  62.4  0.000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.22623  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4358  regulatory protein, TetR  26.04 
 
 
220 aa  62.4  0.000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4403  TetR family transcriptional regulator  28.64 
 
 
206 aa  62.4  0.000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.504175 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0275  TetR family transcriptional regulator  28.5 
 
 
193 aa  62  0.000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2638  TetR family transcriptional regulator  28.74 
 
 
210 aa  62.4  0.000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1388  regulatory protein, TetR  26.01 
 
 
196 aa  62  0.000000006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_008391  Bamb_3824  TetR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
206 aa  62  0.000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.472754 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1689  transcriptional regulator, TetR family  25.38 
 
 
199 aa  61.6  0.000000006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.403978 
 
 
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NC_009438  Sputcn32_0378  TetR family transcriptional regulator  25.82 
 
 
202 aa  61.2  0.000000008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
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NC_007974  Rmet_4102  TetR family transcriptional regulator  30 
 
 
211 aa  61.2  0.000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.680562  normal 
 
 
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NC_013517  Sterm_1582  transcriptional regulator, TetR family  24.31 
 
 
194 aa  61.2  0.000000009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000313158  n/a   
 
 
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