More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC5_0368 on replicon NC_009135
Organism: Methanococcus maripaludis C5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  100 
 
 		 322 aa  662    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  92.86 
 
 		 322 aa  604  9.999999999999999e-173  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  96.89 
 
 		 322 aa  601  1.0000000000000001e-171  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  96.58 
 
 		 322 aa  600  1e-170  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  82.61 
 
 		 322 aa  555  1e-157  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  51.72 
 
 		 324 aa  319  3.9999999999999996e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  50.61 
 
 		 325 aa  315  7e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  48.63 
 
 		 325 aa  303  3.0000000000000004e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  43.55 
 
 		 348 aa  297  1e-79  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  49.23 
 
 		 407 aa  297  2e-79  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  47.58 
 
 		 327 aa  290  3e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  44.03 
 
 		 324 aa  288  8e-77  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  43.59 
 
 		 343 aa  288  1e-76  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  47.6 
 
 		 325 aa  287  1e-76  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  48.48 
 
 		 322 aa  287  1e-76  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  42.33 
 
 		 349 aa  287  2e-76  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  47.59 
 
 		 329 aa  286  2e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  45.74 
 
 		 330 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  41.91 
 
 		 343 aa  286  2.9999999999999996e-76  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  46.06 
 
 		 332 aa  285  7e-76  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  44.94 
 
 		 324 aa  285  1.0000000000000001e-75  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  47.95 
 
 		 358 aa  285  1.0000000000000001e-75  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  45.43 
 
 		 330 aa  283  3.0000000000000004e-75  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  45.11 
 
 		 333 aa  281  1e-74  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2624  DNA repair and recombination protein RadA  41.67 
 
 		 343 aa  279  4e-74  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.387482 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  46.79 
 
 		 324 aa  279  5e-74  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  44.38 
 
 		 358 aa  264  2e-69  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  43.83 
 
 		 388 aa  259  5.0000000000000005e-68  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  39.44 
 
 		 350 aa  231  8.000000000000001e-60  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  40.45 
 
 		 348 aa  228  7e-59  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  41.25 
 
 		 658 aa  217  2e-55  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  39.88 
 
 		 343 aa  214  1.9999999999999998e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  37.54 
 
 		 323 aa  211  1e-53  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA06990  recombinase, putative  37.54 
 
 		 365 aa  197  2.0000000000000003e-49  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108784  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  35.91 
 
 		 358 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  36.88 
 
 		 315 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  35.51 
 
 		 250 aa  132  1.0000000000000001e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  31.45 
 
 		 307 aa  124  2e-27  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0486  Rad51-like protein  32.31 
 
 		 311 aa  123  4e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.100378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 312 aa  118  9.999999999999999e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  30.86 
 
 		 314 aa  118  1.9999999999999998e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0762  Fis family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 312 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0530008 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  28.57 
 
 		 358 aa  106  4e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  29.1 
 
 		 227 aa  85.5  0.000000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  30.45 
 
 		 243 aa  82.4  0.000000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  29.55 
 
 		 235 aa  78.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  28.4 
 
 		 227 aa  75.1  0.000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  32.53 
 
 		 224 aa  75.5  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  26.55 
 
 		 363 aa  74.7  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  28.57 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  27.76 
 
 		 224 aa  73.2  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  28.62 
 
 		 275 aa  73.6  0.000000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  26.83 
 
 		 225 aa  72  0.00000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  28.92 
 
 		 224 aa  71.6  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  26.59 
 
 		 351 aa  70.9  0.00000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  28.57 
 
 		 216 aa  70.9  0.00000000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  28.99 
 
 		 215 aa  68.6  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  28.15 
 
 		 215 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  24.8 
 
 		 221 aa  64.3  0.000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  26.11 
 
 		 217 aa  62.8  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  26.8 
 
 		 235 aa  61.2  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  28.75 
 
 		 213 aa  61.2  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  28.89 
 
 		 234 aa  60.8  0.00000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_40092  Rad51 DNA recombination/repair protein  26.98 
 
 		 456 aa  57.4  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  29.9 
 
 		 554 aa  57  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263483 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  30.05 
 
 		 226 aa  56.2  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0285  DNA repair and recombination protein RadB  22.27 
 
 		 213 aa  56.2  0.0000007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.652849  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1324  recombinase A  25.93 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.427425 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0597  recombinase A  25 
 
 		 356 aa  53.9  0.000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.408398  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0804  recA protein  26.92 
 
 		 389 aa  53.5  0.000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2105  recombinase A  24.54 
 
 		 357 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.577481 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0452  recombinase A  24.54 
 
 		 357 aa  53.5  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38560  recombinase A  23.11 
 
 		 349 aa  53.5  0.000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2373  recombinase A  24.55 
 
 		 357 aa  53.1  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.263861  normal  0.548421 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1643  recombinase A  24.19 
 
 		 355 aa  52.8  0.000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.883064  decreased coverage  0.00000000000602005 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  25.68 
 
 		 347 aa  52.4  0.00001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1732  recombinase A  24.21 
 
 		 352 aa  51.6  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0649106  normal  0.0921204 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1231  recombinase A  23.66 
 
 		 355 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00000000000176903 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1523  recombinase A  21.71 
 
 		 346 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0972  recombinase A  25.56 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000464693  normal  0.0586083 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0945  recombinase A  25.56 
 
 		 349 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1981  recombinase A  23.81 
 
 		 349 aa  51.2  0.00002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00686398 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0497  recombinase A  25.93 
 
 		 353 aa  51.2  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00187604 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17530  recombinase A  21.71 
 
 		 346 aa  52  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0727  recombinase A  26.69 
 
 		 347 aa  51.2  0.00002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.794192  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1629  recombinase A  23.75 
 
 		 355 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.849206  normal  0.20246 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4088  recombinase A  23.75 
 
 		 355 aa  50.8  0.00003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1392  recombinase A  26.7 
 
 		 356 aa  51.2  0.00003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.344472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1175  recombinase A  24.12 
 
 		 352 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214888 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0348  recombinase A  22.84 
 
 		 356 aa  50.8  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0886  recA protein  25.89 
 
 		 356 aa  50.8  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2824  recA protein  27.23 
 
 		 366 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.217843  normal  0.126726 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2601  recA protein  27.23 
 
 		 366 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.2342 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2014  recombinase A  24.6 
 
 		 352 aa  50.8  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.306298 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0872  recombinase A  24.07 
 
 		 414 aa  50.4  0.00004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.396783  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5195  recA protein  25.74 
 
 		 375 aa  50.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.415796  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1378  recombinase A  24.78 
 
 		 354 aa  50.4  0.00004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0217782  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0466  recombinase A  27.04 
 
 		 353 aa  50.4  0.00004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2228  recA protein  26.91 
 
 		 363 aa  50.4  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.522428  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4640  recA protein  24.47 
 
 		 354 aa  50.4  0.00004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>