88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_0455 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_0455  pyrimidine 5'-nucleotidase  100 
 
 
240 aa  493  9.999999999999999e-139  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4559  pyrimidine 5'-nucleotidase  47.06 
 
 
222 aa  202  3e-51  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA1026  HAD superfamily hydrolase  47.32 
 
 
234 aa  199  1.9999999999999998e-50  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0382  pyrimidine 5'-nucleotidase  45.33 
 
 
232 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0582701  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0967  HAD superfamily hydrolase  47.32 
 
 
234 aa  198  6e-50  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0082  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.81 
 
 
235 aa  195  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723897  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0065  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.42 
 
 
237 aa  192  3e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.284923  decreased coverage  0.00705345 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0294  pyrimidine 5'-nucleotidase  41.7 
 
 
248 aa  189  4e-47  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3343  pyrimidine 5-nucleotidase  44.2 
 
 
238 aa  187  1e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1357  pyrimidine 5'-nucleotidase  46.43 
 
 
234 aa  184  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2390  putative pyrimidine 5'-nucleotidase  44.86 
 
 
215 aa  182  5.0000000000000004e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664306  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0071  pyrimidine 5'-nucleotidase  46.28 
 
 
237 aa  179  2.9999999999999997e-44  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142063  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3943  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.17 
 
 
228 aa  179  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0449  hydrolase  42.92 
 
 
250 aa  178  7e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2297  pyrimidine 5-nucleotidase  42.86 
 
 
214 aa  177  1e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0955  pyrimidine 5'-nucleotidase  42.59 
 
 
249 aa  174  9.999999999999999e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2296  pyrimidine 5'-nucleotidase  44.83 
 
 
243 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.310547 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0867  pyrimidine 5'-nucleotidase  42.86 
 
 
243 aa  172  2.9999999999999996e-42  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.652613  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3331  pyrimidine 5'-nucleotidase  42.29 
 
 
268 aa  172  5.999999999999999e-42  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.142582 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2912  pyrimidine 5'-nucleotidase  45.6 
 
 
280 aa  171  6.999999999999999e-42  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1385  pyrimidine 5'-nucleotidase  45.32 
 
 
243 aa  170  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0603953  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7331  HAD-superfamily hydrolase  40.45 
 
 
231 aa  169  3e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178908  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0631  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.91 
 
 
233 aa  169  4e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2341  pyrimidine 5'-nucleotidase  45.31 
 
 
248 aa  168  6e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2620  pyrimidine 5'-nucleotidase  45.31 
 
 
248 aa  168  6e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0626666 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1204  pyrimidine 5'-nucleotidase  40.09 
 
 
240 aa  168  7e-41  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00476471 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3070  pyrimidine 5-nucleotidase  38.64 
 
 
238 aa  168  8e-41  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0520  pyrimidine 5'-nucleotidase  42.47 
 
 
215 aa  166  2e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1870  hydrolase  42.47 
 
 
215 aa  166  4e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1243  pyrimidine 5-nucleotidase  42.08 
 
 
213 aa  166  4e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.882257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3699  pyrimidine 5-nucleotidase  36.29 
 
 
237 aa  165  5.9999999999999996e-40  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0657  pyrimidine 5'-nucleotidase  42.47 
 
 
215 aa  164  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.114356 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1899  pyrimidine 5'-nucleotidase  41.92 
 
 
249 aa  162  5.0000000000000005e-39  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.226115  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0074  pyrimidine 5-nucleotidase  37.12 
 
 
233 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0812  pyrimidine 5-nucleotidase  41.99 
 
 
235 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935066  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0678  pyrimidine 5-nucleotidase  40.11 
 
 
236 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2827  pyrimidine 5-nucleotidase  41.63 
 
 
237 aa  156  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112564  normal  0.0242793 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1836  pyrimidine 5-nucleotidase  37.56 
 
 
229 aa  153  2.9999999999999998e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00207221  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3072  HAD family hydrolase  38.2 
 
 
220 aa  146  3e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791447  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2256  pyrimidine 5-nucleotidase  36.67 
 
 
241 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  hitchhiker  0.0000228381 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1534  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.67 
 
 
216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.78669  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0628  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  37.57 
 
 
212 aa  121  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.821924  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2059  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.58 
 
 
214 aa  118  7.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288048  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2923  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.16 
 
 
220 aa  116  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724502  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0032  hypothetical protein  34.24 
 
 
287 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0010  pyrimidine 5'-nucleotidase  34.08 
 
 
221 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32249  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0541  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.65 
 
 
233 aa  108  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0181  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  31.72 
 
 
322 aa  107  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2986  pyrimidine 5'-nucleotidase  33 
 
 
217 aa  107  2e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0234941  hitchhiker  0.000703738 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3395  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.67 
 
 
281 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3718  pyrimidine 5'-nucleotidase  33.7 
 
 
285 aa  106  3e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0500  hypothetical protein  29.09 
 
 
243 aa  98.2  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3097  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.38 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143226  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2483  pyrimidine 5-nucleotidase  31.38 
 
 
263 aa  97.4  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0380059  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0337  pyrimidine 5'-nucleotidase  28.09 
 
 
267 aa  95.5  6e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3248  HAD-superfamily hydrolase  29.89 
 
 
267 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3439  HAD-superfamily hydrolase  29.89 
 
 
267 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0194  HAD-superfamily hydrolase  29.89 
 
 
267 aa  95.5  7e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0184  HAD-superfamily hydrolase  29.89 
 
 
267 aa  95.5  7e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610769  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3113  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.35 
 
 
263 aa  95.5  7e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2180  HAD-superfamily hydrolase  29.89 
 
 
267 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2909  HAD-superfamily hydrolase  29.89 
 
 
267 aa  95.5  7e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378471  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0141  pyrimidine 5-nucleotidase  30.77 
 
 
334 aa  95.5  7e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18726  predicted protein  30.17 
 
 
273 aa  95.1  8e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.245332 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0063  pyrimidine 5'-nucleotidase  29 
 
 
252 aa  94  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264362  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0159  HAD-superfamily hydrolase  29.35 
 
 
267 aa  93.2  3e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3093  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.89 
 
 
263 aa  92.8  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3144  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.89 
 
 
263 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3006  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.89 
 
 
263 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4386  HAD family hydrolase  29.28 
 
 
267 aa  89  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6448  HAD family hydrolase  28.8 
 
 
263 aa  89.4  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.895915  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7521  predicted protein  29.7 
 
 
212 aa  87  3e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0283312  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84214  suppressor of deletion of TFIIS  26.67 
 
 
287 aa  62.8  0.000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538947  normal  0.0127046 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15835  predicted protein  28.29 
 
 
190 aa  57.4  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0367369  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9879  predicted protein  27.41 
 
 
188 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.753142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0477  HAD superfamily hydrolase  27.04 
 
 
212 aa  53.1  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.992519  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1190  hypothetical protein  24.24 
 
 
228 aa  48.9  0.00007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.619731  normal  0.0510932 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0288  HAD family hydrolase  22.28 
 
 
203 aa  47.4  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06325  pyrimidine 5'-nucleotidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13470)  23.5 
 
 
223 aa  47.4  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.882261  normal  0.0669048 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0287  HAD family hydrolase  23.83 
 
 
205 aa  47  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.146619  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  28.95 
 
 
363 aa  46.6  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0806  HAD superfamily hydrolase  23.12 
 
 
208 aa  45.8  0.0005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0727233  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1417  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.67 
 
 
215 aa  45.4  0.0008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49722e-26 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1113  HAD family hydrolase  25.49 
 
 
228 aa  45.4  0.0009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.107985  hitchhiker  0.0043155 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2742  HAD family hydrolase  23.78 
 
 
218 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2602  HAD family hydrolase  22.11 
 
 
227 aa  43.5  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.852152 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2794  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.84 
 
 
210 aa  43.1  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0916243  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3811  haloacid dehalogenase, type II  27.97 
 
 
226 aa  43.1  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.277165  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>