273 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mhun_2940 on replicon NC_007796
Organism: Methanospirillum hungatei JF-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007796  Mhun_2940  DNA repair and recombination protein RadA  100 
 
 		 407 aa  836    Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00873973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0040  DNA repair and recombination protein RadA  78.88 
 
 		 327 aa  524  1e-148  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2099  DNA repair and recombination protein RadA  75.08 
 
 		 325 aa  518  1e-146  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0637  DNA repair and recombination protein RadA  74.23 
 
 		 329 aa  507  9.999999999999999e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1918  DNA repair and recombination protein RadA  72.9 
 
 		 324 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2338  DNA repair and recombination protein RadA  63.44 
 
 		 325 aa  419  1e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.901889  normal  0.0155582 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2033  DNA repair and recombination protein RadA  64.67 
 
 		 325 aa  417  9.999999999999999e-116  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.507845  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0885  DNA repair and recombination protein RadA  64.47 
 
 		 322 aa  397  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0211  DNA repair and recombination protein RadA  56.97 
 
 		 343 aa  394  1e-108  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1831  DNA repair and recombination protein RadA  56.68 
 
 		 343 aa  393  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0430  DNA repair and recombination protein RadA  58.36 
 
 		 324 aa  385  1e-106  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2624  DNA repair and recombination protein RadA  55.19 
 
 		 343 aa  378  1e-104  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.387482 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1185  DNA repair and recombination protein RadA  54.84 
 
 		 349 aa  379  1e-104  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1273  DNA repair and recombination protein RadA  55.59 
 
 		 348 aa  376  1e-103  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2310  DNA repair and recombination protein RadA  48.43 
 
 		 333 aa  308  9e-83  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.469487  hitchhiker  0.00856648 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0713  DNA repair and recombination protein RadA  46.75 
 
 		 330 aa  307  3e-82  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.33185 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0009  DNA repair and recombination protein RadA  46.95 
 
 		 324 aa  304  2.0000000000000002e-81  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.416037  normal  0.130845 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1118  DNA repair and recombination protein RadA  46.75 
 
 		 358 aa  303  5.000000000000001e-81  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1953  DNA repair and recombination protein RadA  47.47 
 
 		 330 aa  302  9e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2081  DNA repair and recombination protein RadA  46.86 
 
 		 332 aa  302  9e-81  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1226  DNA repair and recombination protein RadA  45.43 
 
 		 324 aa  293  5e-78  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0982  DNA repair and recombination protein RadA  47.85 
 
 		 322 aa  292  8e-78  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0368  DNA repair and recombination protein RadA  49.23 
 
 		 322 aa  288  2e-76  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1386  DNA repair and recombination protein RadA  46.11 
 
 		 388 aa  287  2e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1450  DNA repair and recombination protein RadA  48.77 
 
 		 322 aa  285  7e-76  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0942903  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0537  DNA repair and recombination protein RadA  48 
 
 		 322 aa  281  1e-74  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0469  DNA repair and recombination protein RadA  48.15 
 
 		 322 aa  281  1e-74  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1017  DNA repair and recombination protein RadA  46.86 
 
 		 358 aa  278  8e-74  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.103289  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09092  meiotic recombination protein (Dmc1), putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02200)  41.23 
 
 		 658 aa  239  5.999999999999999e-62  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.515485  normal  1 
 
 
-
 
NC_006682  CNM01780  meiotic recombination-related protein, putative  40.33 
 
 		 323 aa  223  4.9999999999999996e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.51774  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_54533  Rad51 DNA recombination/repair protein  38.99 
 
 		 350 aa  220  5e-56  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.724719  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_17346  predicted protein  38.61 
 
 		 358 aa  218  1e-55  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.908819  normal  0.780808 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01237  UvsC protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:P78579]  38.94 
 
 		 348 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.523208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_33041  predicted protein  38.78 
 
 		 343 aa  213  2.9999999999999995e-54  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.0526282 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06990  recombinase, putative  38.79 
 
 		 365 aa  204  3e-51  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.108784  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1023  Rad51-like  36.99 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.973197  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0743  Rad51-like  39.33 
 
 		 250 aa  131  2.0000000000000002e-29  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0486  Rad51-like protein  30.7 
 
 		 311 aa  125  2e-27  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.100378  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1396  Fis family transcriptional regulator  31.38 
 
 		 312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.358472  normal  0.485282 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1633  Rad51 domain-containing protein  28.93 
 
 		 307 aa  110  3e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.11008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_17626  predicted protein  26.55 
 
 		 358 aa  110  5e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0870528  hitchhiker  0.00372316 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_54137  Rad51 DNA recombination/repair protein  29.06 
 
 		 363 aa  103  7e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2031  Rad51-like protein  28.43 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000738645 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0762  Fis family transcriptional regulator  27.04 
 
 		 312 aa  99.4  9e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0530008 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0491  DNA repair and recombination protein RadB  30.71 
 
 		 227 aa  92  2e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0926  DNA repair and recombination protein RadB  28.93 
 
 		 221 aa  89  1e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0907  DNA repair and recombination protein RadB  29.47 
 
 		 227 aa  84  0.000000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1786  DNA repair and recombination protein RadB  29.41 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.729381  normal  0.0464986 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2158  DNA repair and recombination protein RadB  28.02 
 
 		 235 aa  83.6  0.000000000000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_50387  predicted protein  24.93 
 
 		 351 aa  83.2  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.142215  normal  0.0213314 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0260  DNA repair and recombination protein RadB  30.17 
 
 		 224 aa  82.8  0.00000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.92433 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0077  DNA repair and recombination protein RadB  25.83 
 
 		 275 aa  82.8  0.00000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.327122  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2159  DNA repair and recombination protein RadB  30.24 
 
 		 224 aa  82  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2123  DNA repair and recombination protein RadB  26.61 
 
 		 225 aa  82  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1272  hypothetical protein  32.13 
 
 		 224 aa  81.3  0.00000000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.998309 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2453  ATPase  30.74 
 
 		 234 aa  80.9  0.00000000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.695737 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1039  DNA repair and recombination protein RadB  28.1 
 
 		 243 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0087  RecA/RadA recombinase-like protein  26.97 
 
 		 217 aa  74.3  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.439691 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1629  DNA repair and recombination protein RadB  29.74 
 
 		 235 aa  71.6  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.554742  normal  0.462396 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2429  DNA repair and recombination protein RadB  30.67 
 
 		 226 aa  71.2  0.00000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1640  DNA repair and recombination protein RadB  27.23 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.301627  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10145  DNA repair protein (Rad57), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G12520)  28.31 
 
 		 554 aa  62.8  0.000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.263483 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0274  DNA repair and recombination protein RadB  26.64 
 
 		 215 aa  62  0.00000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.944285  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_58642  predicted protein  29.88 
 
 		 541 aa  62  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  hitchhiker  0.00988886  normal  0.20524 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1162  recA protein  23.45 
 
 		 356 aa  60.5  0.00000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.501327  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0523  recombinase A  25.79 
 
 		 362 aa  58.2  0.0000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000473291  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0988  DNA repair and recombination protein RadB  25.23 
 
 		 216 aa  57.8  0.0000003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0377224  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_26240  predicted protein  24.76 
 
 		 369 aa  57  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.00269696 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1490  DNA repair and recombination protein RadB  25.74 
 
 		 213 aa  56.2  0.000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.695224  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1949  recombinase A  23.74 
 
 		 376 aa  53.9  0.000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0074  recA protein  23.29 
 
 		 344 aa  54.3  0.000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22971  recombinase A  26.34 
 
 		 379 aa  53.9  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0381  recombinase A  26.03 
 
 		 374 aa  53.5  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.620471  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17531  recombinase A  25.33 
 
 		 365 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  unclonable  0.00363576  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1654  recombinase A  25.22 
 
 		 365 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17691  recombinase A  25.22 
 
 		 365 aa  53.5  0.000007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.757808  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_10322  Rad51 family DNA repair protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G14460)  25.41 
 
 		 422 aa  53.1  0.000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.177234 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2309  50S ribosomal protein L32e  27.88 
 
 		 335 aa  53.1  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0872  recombinase A  24.27 
 
 		 414 aa  52.4  0.00001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.396783  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2466  ski2-like helicase  30.22 
 
 		 799 aa  52.8  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000652564  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16811  recombinase A  23.21 
 
 		 367 aa  52.4  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17441  recombinase A  25 
 
 		 370 aa  52.8  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.633631  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1133  recombinase A  23.11 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20071  recombinase A  23.11 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2439  recA protein  22.83 
 
 		 347 aa  51.2  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000000566681  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0924  DNA recombination protein, RecA  22.61 
 
 		 342 aa  50.8  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0584  recombinase A  25 
 
 		 385 aa  51.2  0.00004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.000230133  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4194  recombinase A  22.17 
 
 		 358 aa  50.8  0.00005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0804  recA protein  22.97 
 
 		 389 aa  50.4  0.00005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1671  recombinase A  23.66 
 
 		 357 aa  50.4  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0938  recombinase A  25.25 
 
 		 356 aa  50.1  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000126109  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0960  recombinase A  25.25 
 
 		 356 aa  50.1  0.00008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00998532  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1592  recA protein  23.67 
 
 		 347 aa  49.7  0.00009  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1522  recombinase A  24.62 
 
 		 361 aa  49.7  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0075  recombinase A  23.41 
 
 		 357 aa  49.7  0.00009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.394042 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2448  recA protein  23.53 
 
 		 350 aa  48.9  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.276179  normal  0.953449 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4685  recA protein  23.12 
 
 		 377 aa  49.3  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  unclonable  0.0000000254393  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0886  recA protein  21.92 
 
 		 356 aa  49.3  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1338  recombinase A  22.71 
 
 		 364 aa  48.9  0.0001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.000000000000600753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3956  recA protein  23.3 
 
 		 384 aa  49.7  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.544899  normal  0.165355 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>