More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_1524 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009338  Mflv_1524  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 
712 aa  1414    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  59.66 
 
 
724 aa  750    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  0.167588 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2394  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  55.63 
 
 
756 aa  677    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396069  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1091  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  50.85 
 
 
788 aa  651    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.305899  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.69 
 
 
689 aa  781    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5584  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  60.2 
 
 
718 aa  775    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128967  normal  0.346665 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06850  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.26 
 
 
713 aa  702    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1612  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  58.38 
 
 
733 aa  721    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.644858 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5233  ATP-dependent DNA helicase RecQ  86.04 
 
 
704 aa  1202    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.157625 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0376  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.4 
 
 
712 aa  727    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4745  ATP-dependent DNA helicase RecQ  81.35 
 
 
691 aa  1125    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.865957 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0447  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.87 
 
 
708 aa  719    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0452326  decreased coverage  0.00000647403 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18920  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.69 
 
 
762 aa  669    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275245  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0133  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  58.17 
 
 
714 aa  726    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.931384  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0677  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.7 
 
 
754 aa  766    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00766403  normal  0.0478204 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03530  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.2 
 
 
734 aa  725    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0184  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  53.86 
 
 
741 aa  639    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  64.39 
 
 
691 aa  828    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346189  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5950  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.39 
 
 
749 aa  734    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0569292 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4657  ATP-dependent DNA helicase RecQ  81.35 
 
 
691 aa  1125    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5040  ATP-dependent DNA helicase RecQ  81.64 
 
 
691 aa  1131    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26563  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3301  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  59.52 
 
 
723 aa  798    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3226  ATP-dependent DNA helicase RecQ family  59.11 
 
 
691 aa  746    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225844  hitchhiker  0.0000186089 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1626  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  59.77 
 
 
706 aa  766    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.135098  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  56.1 
 
 
766 aa  710    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.572742  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22560  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.92 
 
 
979 aa  752    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188991  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0672  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.62 
 
 
729 aa  666    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20415  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0819  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  52.96 
 
 
745 aa  660    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0827  DEAD/DEAH box helicase domain protein  48.75 
 
 
706 aa  555  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.493882  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.11 
 
 
708 aa  533  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.449772  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1318  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.5 
 
 
756 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0376564  decreased coverage  0.0000000122508 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4035  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  48.12 
 
 
679 aa  519  1e-146  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000527005  normal  0.0486665 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1940  DEAD/DEAH box helicase domain protein  46.45 
 
 
706 aa  516  1.0000000000000001e-145  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187923  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1571  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.91 
 
 
693 aa  512  1e-144  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.000060483  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1532  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.5 
 
 
697 aa  510  1e-143  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3718  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.23 
 
 
698 aa  500  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4347  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.74 
 
 
699 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0558193  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0315  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.2 
 
 
698 aa  496  1e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3804  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.67 
 
 
698 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00343497  decreased coverage  0.0000140841 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0673  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.5 
 
 
695 aa  491  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.293047  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0559  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.95 
 
 
698 aa  491  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000154535  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0485  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.55 
 
 
697 aa  467  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.03 
 
 
693 aa  462  1e-129  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000979868  decreased coverage  0.000575313 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1436  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.49 
 
 
691 aa  452  1.0000000000000001e-126  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000631982  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1126  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.75 
 
 
691 aa  442  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.760992  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0495  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.82 
 
 
448 aa  246  9.999999999999999e-64  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264596  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.39 
 
 
543 aa  236  8e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.39 
 
 
543 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.39 
 
 
543 aa  236  1.0000000000000001e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.74 
 
 
588 aa  235  2.0000000000000002e-60  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5632  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.67 
 
 
545 aa  233  7.000000000000001e-60  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.06 
 
 
602 aa  231  3e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.87 
 
 
563 aa  223  9e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.48 
 
 
1376 aa  222  1.9999999999999999e-56  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.47 
 
 
607 aa  217  7e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138004  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.76 
 
 
646 aa  216  8e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4797  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.72 
 
 
590 aa  211  3e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1249  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.61 
 
 
557 aa  210  9e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4547  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.87 
 
 
556 aa  210  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908744  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3200  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.38 
 
 
600 aa  209  2e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4236  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.79 
 
 
535 aa  208  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.98 
 
 
552 aa  207  6e-52  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.54 
 
 
708 aa  206  8e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4974  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.68 
 
 
568 aa  205  3e-51  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581094  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6470  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.62 
 
 
624 aa  204  5e-51  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0566058 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1782  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.86 
 
 
646 aa  204  5e-51  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.12 
 
 
626 aa  204  6e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.25 
 
 
716 aa  202  1.9999999999999998e-50  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0326  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.82 
 
 
626 aa  201  3e-50  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.149933  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6295  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.1 
 
 
590 aa  201  3.9999999999999996e-50  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.12 
 
 
606 aa  200  7e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1542  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.43 
 
 
592 aa  200  7.999999999999999e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0884  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40 
 
 
595 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.385904  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.34 
 
 
599 aa  199  1.0000000000000001e-49  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833511  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.54 
 
 
562 aa  199  1.0000000000000001e-49  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4005  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.11 
 
 
630 aa  198  2.0000000000000003e-49  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0888  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.72 
 
 
595 aa  199  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2232  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.8 
 
 
634 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.319875  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.13 
 
 
602 aa  197  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.07 
 
 
617 aa  197  5.000000000000001e-49  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.41 
 
 
615 aa  197  7e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0838  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.13 
 
 
527 aa  196  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2984  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.4 
 
 
600 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.31482 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.3 
 
 
451 aa  196  2e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412103  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00903  RecQ domain protein  32.89 
 
 
679 aa  195  2e-48  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0170  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.97 
 
 
633 aa  195  2e-48  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2335  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.64 
 
 
593 aa  193  8e-48  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.699983  normal  0.515906 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1946  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.24 
 
 
658 aa  193  9e-48  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.937169  normal  0.260337 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.83 
 
 
607 aa  192  1e-47  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.38 
 
 
625 aa  192  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  36.72 
 
 
615 aa  193  1e-47  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2025  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.59 
 
 
659 aa  192  1e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.256994  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0114  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.47 
 
 
639 aa  192  1e-47  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.186389 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1229  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.17 
 
 
779 aa  192  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2030  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.07 
 
 
665 aa  192  2e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.371966 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1914  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.72 
 
 
588 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.9 
 
 
611 aa  192  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1545  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.57 
 
 
592 aa  191  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.82 
 
 
662 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1999  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.24 
 
 
658 aa  191  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.171649 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>