More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_0677 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_4305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  57.36 
 
 		 724 aa  748    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  0.167588 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0819  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  52.17 
 
 		 745 aa  682    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2394  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  53.44 
 
 		 756 aa  644    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396069  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5233  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.1 
 
 		 704 aa  765    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157625 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18920  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.24 
 
 		 762 aa  667    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275245  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1612  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  54.65 
 
 		 733 aa  676    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.644858 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06850  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.96 
 
 		 713 aa  730    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0376  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.49 
 
 		 712 aa  731    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5584  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  59.4 
 
 		 718 aa  776    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128967  normal  0.346665 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0677  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 		 754 aa  1470    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00766403  normal  0.0478204 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4745  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.12 
 
 		 691 aa  768    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.865957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  62.14 
 
 		 691 aa  810    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346189  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3301  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  57.56 
 
 		 723 aa  775    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  55 
 
 		 766 aa  687    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.572742  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03530  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.97 
 
 		 734 aa  706    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3226  ATP-dependent DNA helicase RecQ family  55.59 
 
 		 691 aa  730    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225844  hitchhiker  0.0000186089 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4657  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.12 
 
 		 691 aa  768    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22560  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.57 
 
 		 979 aa  670    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5950  ATP-dependent DNA helicase RecQ  73.35 
 
 		 749 aa  1056    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0569292 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1524  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.7 
 
 		 712 aa  757    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1626  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  62.01 
 
 		 706 aa  831    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.135098  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5040  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.12 
 
 		 691 aa  769    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26563  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0672  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.76 
 
 		 729 aa  679    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20415  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.94 
 
 		 689 aa  779    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0447  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.3 
 
 		 708 aa  732    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0452326  decreased coverage  0.00000647403 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0133  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  55.69 
 
 		 714 aa  706    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.931384  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0184  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  54.36 
 
 		 741 aa  634  1e-180  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1091  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  48.32 
 
 		 788 aa  635  1e-180  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.305899  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0827  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.59 
 
 		 706 aa  519  1.0000000000000001e-145  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.493882  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1318  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.81 
 
 		 756 aa  513  1e-144  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0376564  decreased coverage  0.0000000122508 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0315  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.95 
 
 		 698 aa  514  1e-144  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1571  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.11 
 
 		 693 aa  511  1e-143  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.000060483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.05 
 
 		 708 aa  512  1e-143  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.449772  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4035  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  46.71 
 
 		 679 aa  506  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000527005  normal  0.0486665 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1940  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.14 
 
 		 706 aa  503  1e-141  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187923  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1532  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.8 
 
 		 697 aa  497  1e-139  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3804  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.55 
 
 		 698 aa  480  1e-134  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00343497  decreased coverage  0.0000140841 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0485  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.68 
 
 		 697 aa  476  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0673  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.6 
 
 		 695 aa  474  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.293047  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0559  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.09 
 
 		 698 aa  470  1.0000000000000001e-131  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000154535  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3718  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.24 
 
 		 698 aa  472  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4347  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.74 
 
 		 699 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0558193  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.39 
 
 		 693 aa  427  1e-118  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000979868  decreased coverage  0.000575313 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1436  DEAD/DEAH box helicase domain protein  38.06 
 
 		 691 aa  416  9.999999999999999e-116  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000631982  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1126  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.97 
 
 		 691 aa  418  9.999999999999999e-116  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.760992  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0495  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.01 
 
 		 448 aa  251  3e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264596  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.45 
 
 		 543 aa  243  7.999999999999999e-63  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.25 
 
 		 543 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.25 
 
 		 543 aa  241  2.9999999999999997e-62  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35 
 
 		 1376 aa  233  7.000000000000001e-60  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6470  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36 
 
 		 624 aa  225  2e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0566058 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.86 
 
 		 602 aa  221  3.9999999999999997e-56  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1249  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.81 
 
 		 557 aa  220  7.999999999999999e-56  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.53 
 
 		 562 aa  213  1e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.33 
 
 		 588 aa  210  9e-53  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.44 
 
 		 626 aa  207  5e-52  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1542  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.42 
 
 		 592 aa  207  5e-52  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5632  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.81 
 
 		 545 aa  207  7e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.05 
 
 		 708 aa  206  1e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.94 
 
 		 625 aa  205  3e-51  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4547  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.83 
 
 		 556 aa  202  9.999999999999999e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908744  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1535  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.23 
 
 		 596 aa  202  1.9999999999999998e-50  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.297932  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.94 
 
 		 591 aa  201  3e-50  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1335  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.7 
 
 		 592 aa  199  1.0000000000000001e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.764051  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.45 
 
 		 724 aa  199  2.0000000000000003e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2232  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.15 
 
 		 634 aa  198  3e-49  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.319875  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.53 
 
 		 721 aa  198  3e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.71 
 
 		 615 aa  197  5.000000000000001e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0020  hypothetical protein  36.13 
 
 		 493 aa  197  6e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.13 
 
 		 563 aa  195  2e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0829  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.07 
 
 		 546 aa  195  3e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.13 
 
 		 607 aa  195  3e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138004  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4005  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.85 
 
 		 630 aa  195  3e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.7 
 
 		 451 aa  194  5e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412103  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  30.9 
 
 		 552 aa  194  6e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4236  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.43 
 
 		 535 aa  194  7e-48  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0911  superfamily II DNA helicase  37.1 
 
 		 621 aa  193  8e-48  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1229  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.76 
 
 		 779 aa  193  9e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1545  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.94 
 
 		 592 aa  193  1e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0884  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.67 
 
 		 595 aa  191  4e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.385904  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  32.88 
 
 		 705 aa  191  4e-47  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  29.63 
 
 		 793 aa  191  4e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.93 
 
 		 617 aa  191  5e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2961  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.17 
 
 		 622 aa  191  5e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.303637 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.43 
 
 		 707 aa  191  5.999999999999999e-47  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00903  RecQ domain protein  35.09 
 
 		 679 aa  190  7e-47  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  32.88 
 
 		 705 aa  190  7e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0888  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.39 
 
 		 595 aa  190  7e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1782  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37 
 
 		 646 aa  190  7e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.15 
 
 		 705 aa  190  7e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12343  putative ATP-dependent DNA helicase  36.31 
 
 		 734 aa  190  7e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.839573  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.88 
 
 		 705 aa  190  8e-47  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.61 
 
 		 705 aa  189  1e-46  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1914  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.99 
 
 		 588 aa  189  1e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.61 
 
 		 705 aa  189  1e-46  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2702  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.46 
 
 		 621 aa  189  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.34 
 
 		 593 aa  189  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0838  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.12 
 
 		 527 aa  189  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3200  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.01 
 
 		 600 aa  189  2e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.34 
 
 		 593 aa  189  2e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>