More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cfla_1612 on replicon NC_014151
Organism: Cellulomonas flavigena DSM 20109



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012669  Bcav_2394  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  64.09 
 
 		 756 aa  815    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396069  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0376  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.77 
 
 		 712 aa  679    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0819  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  52.3 
 
 		 745 aa  647    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1626  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  59.89 
 
 		 706 aa  713    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.135098  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3301  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  59.11 
 
 		 723 aa  747    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5584  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  58.46 
 
 		 718 aa  710    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128967  normal  0.346665 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1524  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.38 
 
 		 712 aa  716    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  63.43 
 
 		 724 aa  805    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  0.167588 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1612  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  100 
 
 		 733 aa  1420    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.644858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0677  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.65 
 
 		 754 aa  675    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00766403  normal  0.0478204 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03530  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.91 
 
 		 734 aa  658    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06850  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.57 
 
 		 713 aa  640    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5040  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.69 
 
 		 691 aa  727    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  60.72 
 
 		 691 aa  722    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346189  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22560  ATP-dependent DNA helicase RecQ  65.08 
 
 		 979 aa  855    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188991  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4657  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.41 
 
 		 691 aa  724    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  63.12 
 
 		 766 aa  832    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.572742  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1091  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  54.87 
 
 		 788 aa  711    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.305899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5233  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.61 
 
 		 704 aa  738    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157625 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0447  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.45 
 
 		 708 aa  677    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0452326  decreased coverage  0.00000647403 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4745  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.41 
 
 		 691 aa  724    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.865957 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0672  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.12 
 
 		 729 aa  651    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20415  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5950  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.85 
 
 		 749 aa  647    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0569292 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3226  ATP-dependent DNA helicase RecQ family  56.1 
 
 		 691 aa  661    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225844  hitchhiker  0.0000186089 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.98 
 
 		 689 aa  709    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0133  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.05 
 
 		 714 aa  739    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.931384  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0184  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  54.35 
 
 		 741 aa  595  1e-169  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18920  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.81 
 
 		 762 aa  588  1e-166  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275245  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1318  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.12 
 
 		 756 aa  511  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0376564  decreased coverage  0.0000000122508 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0315  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  45.78 
 
 		 698 aa  503  1e-141  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0827  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.78 
 
 		 706 aa  499  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.493882  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1571  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.86 
 
 		 693 aa  496  1e-139  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.000060483  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1940  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.1 
 
 		 706 aa  494  9.999999999999999e-139  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187923  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.19 
 
 		 708 aa  492  1e-137  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.449772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1532  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.68 
 
 		 697 aa  481  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0673  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.2 
 
 		 695 aa  474  1e-132  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.293047  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3718  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.05 
 
 		 698 aa  463  1e-129  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3804  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.38 
 
 		 698 aa  466  1e-129  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00343497  decreased coverage  0.0000140841 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4347  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.39 
 
 		 699 aa  465  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0558193  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0559  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.29 
 
 		 698 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000154535  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4035  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  46.77 
 
 		 679 aa  459  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000527005  normal  0.0486665 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0485  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.47 
 
 		 697 aa  451  1e-125  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.28 
 
 		 693 aa  438  1e-121  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000979868  decreased coverage  0.000575313 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1436  DEAD/DEAH box helicase domain protein  40.77 
 
 		 691 aa  435  1e-120  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000631982  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1126  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.55 
 
 		 691 aa  431  1e-119  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.760992  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0495  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.33 
 
 		 448 aa  243  7e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264596  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.02 
 
 		 543 aa  237  5.0000000000000005e-61  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.02 
 
 		 543 aa  237  6e-61  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.02 
 
 		 543 aa  237  6e-61  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.03 
 
 		 1376 aa  231  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.77 
 
 		 588 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.33 
 
 		 603 aa  207  6e-52  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.9 
 
 		 708 aa  206  9e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2380  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.02 
 
 		 596 aa  204  6e-51  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000212665  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.57 
 
 		 593 aa  204  6e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.57 
 
 		 593 aa  204  6e-51  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.02 
 
 		 562 aa  204  6e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.87 
 
 		 602 aa  202  9.999999999999999e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6295  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.1 
 
 		 590 aa  203  9.999999999999999e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0020  hypothetical protein  32.99 
 
 		 493 aa  202  1.9999999999999998e-50  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  30.81 
 
 		 563 aa  202  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.1 
 
 		 633 aa  200  7.999999999999999e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2717  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.24 
 
 		 601 aa  199  1.0000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.58 
 
 		 626 aa  199  1.0000000000000001e-49  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2064  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.86 
 
 		 729 aa  198  3e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256854  normal  0.150426 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5632  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.87 
 
 		 545 aa  197  4.0000000000000005e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1229  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.7 
 
 		 779 aa  197  8.000000000000001e-49  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3529  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.26 
 
 		 620 aa  196  1e-48  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.600599  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1542  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.77 
 
 		 592 aa  196  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.82 
 
 		 716 aa  195  3e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4306  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.14 
 
 		 607 aa  194  5e-48  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.227101  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0332  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.28 
 
 		 613 aa  194  5e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2961  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.93 
 
 		 622 aa  193  9e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.303637 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.29 
 
 		 599 aa  193  1e-47  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0829  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.12 
 
 		 546 aa  192  2e-47  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.06 
 
 		 646 aa  192  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.35 
 
 		 725 aa  192  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3822  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.28 
 
 		 615 aa  192  2e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.94 
 
 		 736 aa  191  2.9999999999999997e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.765409 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.75 
 
 		 615 aa  191  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0252  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.33 
 
 		 602 aa  190  5.999999999999999e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.810621  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6077  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.35 
 
 		 618 aa  191  5.999999999999999e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.9148  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.36 
 
 		 599 aa  190  7e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3830  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.68 
 
 		 607 aa  190  8e-47  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.912589  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0514  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.98 
 
 		 599 aa  190  9e-47  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.08 
 
 		 617 aa  190  9e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.88 
 
 		 615 aa  189  1e-46  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0153  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.06 
 
 		 633 aa  189  1e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.11 
 
 		 625 aa  189  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  35.77 
 
 		 615 aa  189  1e-46  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30 
 
 		 451 aa  189  2e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412103  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4241  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.85 
 
 		 607 aa  189  2e-46  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4547  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.74 
 
 		 556 aa  189  2e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908744  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.79 
 
 		 737 aa  188  3e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0953  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.07 
 
 		 611 aa  188  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.07 
 
 		 611 aa  188  3e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00196  ATP-dependent DNA helicase  34.01 
 
 		 613 aa  188  3e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.94 
 
 		 607 aa  188  3e-46  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0366  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.94 
 
 		 607 aa  187  4e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0242  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.17 
 
 		 607 aa  187  5e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>