More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tpau_1940 on replicon NC_014158
Organism: Tsukamurella paurometabola DSM 20162



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014158  Tpau_1940  DEAD/DEAH box helicase domain protein  100 
 
 
706 aa  1381    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187923  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0827  DEAD/DEAH box helicase domain protein  67.77 
 
 
706 aa  880    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.493882  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4035  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  53.04 
 
 
679 aa  593  1e-168  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000527005  normal  0.0486665 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3301  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  48.18 
 
 
723 aa  548  1e-155  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03530  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.36 
 
 
734 aa  549  1e-155  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.76 
 
 
689 aa  548  1e-154  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3226  ATP-dependent DNA helicase RecQ family  49.86 
 
 
691 aa  543  1e-153  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225844  hitchhiker  0.0000186089 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4745  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.71 
 
 
691 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.865957 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5040  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.57 
 
 
691 aa  533  1e-150  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26563  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4657  ATP-dependent DNA helicase RecQ  48.71 
 
 
691 aa  534  1e-150  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06850  ATP-dependent DNA helicase RecQ  49.49 
 
 
713 aa  535  1e-150  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0672  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.28 
 
 
729 aa  529  1e-149  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20415  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  47.87 
 
 
724 aa  526  1e-148  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  0.167588 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0819  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  47.03 
 
 
745 aa  527  1e-148  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1626  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  47.51 
 
 
706 aa  524  1e-147  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.135098  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22560  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.78 
 
 
979 aa  520  1e-146  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188991  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  48.57 
 
 
691 aa  513  1e-144  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346189  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5233  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.96 
 
 
704 aa  512  1e-144  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.157625 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0677  ATP-dependent DNA helicase RecQ  45.14 
 
 
754 aa  509  1e-143  Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00766403  normal  0.0478204 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1524  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.58 
 
 
712 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1091  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.13 
 
 
788 aa  504  1e-141  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.305899  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5584  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  45.49 
 
 
718 aa  503  1e-141  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128967  normal  0.346665 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1612  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  46.96 
 
 
733 aa  502  1e-141  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.644858 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5950  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.36 
 
 
749 aa  504  1e-141  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0569292 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18920  ATP-dependent DNA helicase RecQ  46.31 
 
 
762 aa  499  1e-140  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275245  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1532  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.4 
 
 
697 aa  501  1e-140  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0447  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.91 
 
 
708 aa  499  1e-140  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0452326  decreased coverage  0.00000647403 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  45.76 
 
 
766 aa  498  1e-139  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.572742  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2394  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  46.86 
 
 
756 aa  498  1e-139  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396069  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.1 
 
 
708 aa  498  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.449772  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0376  ATP-dependent DNA helicase RecQ  47.21 
 
 
712 aa  491  1e-137  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1571  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.4 
 
 
693 aa  485  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.000060483  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0184  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  47.19 
 
 
741 aa  479  1e-134  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0133  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  50 
 
 
714 aa  470  1.0000000000000001e-131  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.931384  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0315  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  49.22 
 
 
698 aa  453  1.0000000000000001e-126  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1318  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.87 
 
 
756 aa  451  1e-125  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0376564  decreased coverage  0.0000000122508 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0673  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.22 
 
 
695 aa  425  1e-117  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.293047  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0559  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.43 
 
 
698 aa  421  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000154535  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0485  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.91 
 
 
697 aa  419  1e-116  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4347  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.2 
 
 
699 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0558193  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.57 
 
 
693 aa  408  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000979868  decreased coverage  0.000575313 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3718  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.92 
 
 
698 aa  407  1.0000000000000001e-112  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3804  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.82 
 
 
698 aa  404  1e-111  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00343497  decreased coverage  0.0000140841 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1436  DEAD/DEAH box helicase domain protein  37.43 
 
 
691 aa  371  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000631982  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1126  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.02 
 
 
691 aa  363  5.0000000000000005e-99  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.760992  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0495  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.35 
 
 
448 aa  208  3e-52  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264596  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.89 
 
 
543 aa  206  2e-51  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1151  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.85 
 
 
714 aa  205  3e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.68 
 
 
543 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.68 
 
 
543 aa  202  9.999999999999999e-51  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.6 
 
 
602 aa  201  3e-50  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4236  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.07 
 
 
535 aa  197  6e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.57 
 
 
562 aa  194  6e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5632  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.07 
 
 
545 aa  194  7e-48  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3200  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.81 
 
 
600 aa  193  1e-47  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.72 
 
 
1376 aa  192  2e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0900  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.76 
 
 
605 aa  192  2e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.586975  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1542  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.72 
 
 
592 aa  191  4e-47  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0838  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.35 
 
 
527 aa  190  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0884  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.08 
 
 
595 aa  188  2e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.385904  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0888  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.81 
 
 
595 aa  187  5e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0911  superfamily II DNA helicase  39.88 
 
 
621 aa  187  7e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.85 
 
 
606 aa  187  8e-46  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3305  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.3 
 
 
637 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.563115  normal  0.0132339 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.07 
 
 
593 aa  186  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.12 
 
 
707 aa  186  2.0000000000000003e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.07 
 
 
593 aa  186  2.0000000000000003e-45  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3025  ATP-dependent DNA helicase protein  39.39 
 
 
637 aa  185  3e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0062287  normal  0.0101494 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2958  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.48 
 
 
636 aa  184  5.0000000000000004e-45  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217223 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.61 
 
 
592 aa  184  6e-45  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.76 
 
 
630 aa  184  6e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554418  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4974  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  33.92 
 
 
568 aa  184  6e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581094  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.55 
 
 
615 aa  183  8.000000000000001e-45  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.75 
 
 
646 aa  183  1e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1667  ATP-requiring DNA helicase RecQ  38.23 
 
 
615 aa  182  1e-44  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1003  superfamily II DNA helicase  35.98 
 
 
597 aa  182  1e-44  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000133719  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3690  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.44 
 
 
599 aa  182  2e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.561714  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1335  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.06 
 
 
592 aa  182  2e-44  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.764051  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0898  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.2 
 
 
603 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.109686  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.69 
 
 
451 aa  181  2.9999999999999997e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412103  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0020  hypothetical protein  34.77 
 
 
493 aa  181  4e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0181  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.79 
 
 
705 aa  181  4.999999999999999e-44  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal  0.566747 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6924  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.12 
 
 
625 aa  180  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.286849 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3785  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.12 
 
 
599 aa  180  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0326  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.24 
 
 
626 aa  179  1e-43  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.149933  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4701  ATP-dependent DNA helicase, RecQ  39.35 
 
 
618 aa  179  1e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1249  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.36 
 
 
557 aa  179  1e-43  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2846  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.73 
 
 
615 aa  179  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.551557 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2064  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.93 
 
 
729 aa  179  2e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256854  normal  0.150426 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1914  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.55 
 
 
588 aa  179  2e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2398  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.81 
 
 
606 aa  179  2e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1229  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.44 
 
 
779 aa  178  3e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2363  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.16 
 
 
622 aa  178  3e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.659954  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  29.4 
 
 
716 aa  177  6e-43  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18280  predicted protein  32.43 
 
 
504 aa  177  7e-43  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.203939  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.76 
 
 
588 aa  177  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1171  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.25 
 
 
881 aa  176  9e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0321  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.03 
 
 
615 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0467683 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0243  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.39 
 
 
615 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.621272  normal  0.120365 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0342  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.03 
 
 
615 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>