More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1626 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009077  Mjls_5040  ATP-dependent DNA helicase RecQ  61.25 
 
 
691 aa  797    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26563  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1612  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  60.03 
 
 
733 aa  733    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.644858 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06850  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.49 
 
 
713 aa  752    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  70.14 
 
 
689 aa  935    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0376  ATP-dependent DNA helicase RecQ  61.24 
 
 
712 aa  770    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0819  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  54.52 
 
 
745 aa  696    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  59.04 
 
 
766 aa  742    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.572742  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1524  ATP-dependent DNA helicase RecQ  60.17 
 
 
712 aa  770    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18920  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.09 
 
 
762 aa  650    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275245  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5584  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  63.92 
 
 
718 aa  826    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128967  normal  0.346665 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0133  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  61.2 
 
 
714 aa  759    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.931384  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5233  ATP-dependent DNA helicase RecQ  60.64 
 
 
704 aa  789    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.157625 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4745  ATP-dependent DNA helicase RecQ  61.54 
 
 
691 aa  800    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.865957 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3301  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  66.95 
 
 
723 aa  897    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0677  ATP-dependent DNA helicase RecQ  62.28 
 
 
754 aa  843    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00766403  normal  0.0478204 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03530  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.72 
 
 
734 aa  723    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  69.04 
 
 
691 aa  882    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346189  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3226  ATP-dependent DNA helicase RecQ family  63.09 
 
 
691 aa  789    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225844  hitchhiker  0.0000186089 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0184  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  56.73 
 
 
741 aa  665    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1091  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  53.64 
 
 
788 aa  697    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.305899  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0447  ATP-dependent DNA helicase RecQ  62.7 
 
 
708 aa  773    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0452326  decreased coverage  0.00000647403 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  62.45 
 
 
724 aa  776    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  0.167588 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1626  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  100 
 
 
706 aa  1384    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.135098  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4657  ATP-dependent DNA helicase RecQ  61.54 
 
 
691 aa  800    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5950  ATP-dependent DNA helicase RecQ  61.64 
 
 
749 aa  821    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0569292 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2394  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  58.05 
 
 
756 aa  685    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396069  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0672  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.84 
 
 
729 aa  706    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20415  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22560  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.58 
 
 
979 aa  748    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188991  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1571  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.48 
 
 
693 aa  551  1e-155  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.000060483  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1532  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.31 
 
 
697 aa  539  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  44.71 
 
 
708 aa  540  9.999999999999999e-153  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.449772  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1318  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  43.14 
 
 
756 aa  540  9.999999999999999e-153  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0376564  decreased coverage  0.0000000122508 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0827  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.21 
 
 
706 aa  532  1e-150  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.493882  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0315  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  47.13 
 
 
698 aa  527  1e-148  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1940  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.51 
 
 
706 aa  525  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187923  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4035  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  49.35 
 
 
679 aa  522  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000527005  normal  0.0486665 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0673  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.51 
 
 
695 aa  514  1e-144  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.293047  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0559  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.4 
 
 
698 aa  507  9.999999999999999e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000154535  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3804  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.84 
 
 
698 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00343497  decreased coverage  0.0000140841 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4347  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.11 
 
 
699 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0558193  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0485  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.35 
 
 
697 aa  498  1e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3718  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.86 
 
 
698 aa  492  9.999999999999999e-139  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.33 
 
 
693 aa  473  1e-132  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000979868  decreased coverage  0.000575313 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1436  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.08 
 
 
691 aa  465  1e-129  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000631982  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1126  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.94 
 
 
691 aa  461  9.999999999999999e-129  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.760992  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0495  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.8 
 
 
448 aa  245  1.9999999999999999e-63  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264596  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.54 
 
 
1376 aa  231  4e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5632  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.92 
 
 
545 aa  228  2e-58  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.48 
 
 
588 aa  228  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.95 
 
 
543 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.95 
 
 
543 aa  218  2.9999999999999998e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.42 
 
 
543 aa  218  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.08 
 
 
562 aa  209  1e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1249  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.48 
 
 
557 aa  206  1e-51  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.94 
 
 
602 aa  204  5e-51  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.27 
 
 
607 aa  203  9.999999999999999e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138004  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4797  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33 
 
 
590 aa  201  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6470  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.16 
 
 
624 aa  200  9e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0566058 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.23 
 
 
708 aa  195  3e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0829  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.73 
 
 
546 aa  194  4e-48  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.85 
 
 
563 aa  194  4e-48  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4547  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.92 
 
 
556 aa  194  4e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908744  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.29 
 
 
552 aa  193  9e-48  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6295  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.31 
 
 
590 aa  191  2.9999999999999997e-47  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4974  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.69 
 
 
568 aa  191  4e-47  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581094  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.51 
 
 
626 aa  191  5e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1782  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.24 
 
 
646 aa  191  5.999999999999999e-47  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4005  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.88 
 
 
630 aa  190  9e-47  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2232  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.81 
 
 
634 aa  189  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.319875  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.03 
 
 
716 aa  187  4e-46  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00903  RecQ domain protein  36.92 
 
 
679 aa  187  5e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0017  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.25 
 
 
681 aa  187  7e-46  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.571196  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1359  DEAD/DEAH box helicase  41.25 
 
 
681 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0027  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.25 
 
 
681 aa  186  2.0000000000000003e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0879817  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1261  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.76 
 
 
707 aa  184  6e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.850947  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.39 
 
 
646 aa  184  6e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3025  ATP-dependent DNA helicase protein  39.22 
 
 
637 aa  183  1e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0062287  normal  0.0101494 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0911  superfamily II DNA helicase  38.17 
 
 
621 aa  182  1e-44  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2659  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.37 
 
 
679 aa  182  2e-44  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0011  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.63 
 
 
793 aa  182  2e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00580778  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0035  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.48 
 
 
707 aa  182  2.9999999999999997e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.142382  normal  0.0608085 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3305  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.89 
 
 
637 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.563115  normal  0.0132339 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1290  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.01 
 
 
616 aa  181  2.9999999999999997e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.289447  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0020  hypothetical protein  35.4 
 
 
493 aa  181  4.999999999999999e-44  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1092  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.75 
 
 
451 aa  181  4.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0412103  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4236  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.78 
 
 
535 aa  181  4.999999999999999e-44  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.55 
 
 
592 aa  180  7e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.53 
 
 
593 aa  180  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.53 
 
 
593 aa  180  7e-44  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.33 
 
 
725 aa  180  8e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2958  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.56 
 
 
636 aa  179  1e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217223 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1931  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.99 
 
 
591 aa  179  1e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3602  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.1 
 
 
737 aa  179  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.436547 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0083  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.4 
 
 
615 aa  178  2e-43  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3264  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.53 
 
 
731 aa  179  2e-43  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1946  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.77 
 
 
658 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.937169  normal  0.260337 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2030  ATP-dependent DNA helicase RecQ  30.77 
 
 
665 aa  179  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.371966 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.11 
 
 
625 aa  178  2e-43  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2064  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.43 
 
 
729 aa  178  3e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.256854  normal  0.150426 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.83 
 
 
736 aa  178  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.765409 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>