More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_5950 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013947  Snas_3226  ATP-dependent DNA helicase RecQ family  55.24 
 
 		 691 aa  727    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225844  hitchhiker  0.0000186089 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0447  ATP-dependent DNA helicase RecQ  57.99 
 
 		 708 aa  720    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0452326  decreased coverage  0.00000647403 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4745  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.81 
 
 		 691 aa  754    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.865957 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5584  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  57.96 
 
 		 718 aa  758    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128967  normal  0.346665 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06850  ATP-dependent DNA helicase RecQ  56.84 
 
 		 713 aa  739    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5233  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.79 
 
 		 704 aa  749    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.157625 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  55.75 
 
 		 724 aa  735    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  0.167588 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5040  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.68 
 
 		 691 aa  753    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  62.36 
 
 		 691 aa  803    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346189  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1524  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.39 
 
 		 712 aa  741    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  51.64 
 
 		 766 aa  662    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.572742  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0133  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  56.05 
 
 		 714 aa  709    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.931384  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0677  ATP-dependent DNA helicase RecQ  73.35 
 
 		 754 aa  1072    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00766403  normal  0.0478204 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  59.76 
 
 		 689 aa  808    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03530  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.3 
 
 		 734 aa  716    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2394  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  52.59 
 
 		 756 aa  653    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396069  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3301  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  57.45 
 
 		 723 aa  792    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4657  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.81 
 
 		 691 aa  754    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1626  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  61.64 
 
 		 706 aa  823    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.135098  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0819  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  52.73 
 
 		 745 aa  689    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22560  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.48 
 
 		 979 aa  679    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188991  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1612  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  54.11 
 
 		 733 aa  670    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.644858 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0184  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  54.2 
 
 		 741 aa  637    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0672  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.42 
 
 		 729 aa  689    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20415  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5950  ATP-dependent DNA helicase RecQ  100 
 
 		 749 aa  1474    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0569292 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0376  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.77 
 
 		 712 aa  731    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18920  ATP-dependent DNA helicase RecQ  50.32 
 
 		 762 aa  630  1e-179  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275245  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1091  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  47.27 
 
 		 788 aa  621  1e-176  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.305899  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1571  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.93 
 
 		 693 aa  526  1e-148  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.000060483  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.18 
 
 		 708 aa  514  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.449772  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1532  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  37.94 
 
 		 697 aa  513  1e-144  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1940  DEAD/DEAH box helicase domain protein  44.36 
 
 		 706 aa  511  1e-143  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187923  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0315  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  44.23 
 
 		 698 aa  509  1e-143  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1318  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.97 
 
 		 756 aa  512  1e-143  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0376564  decreased coverage  0.0000000122508 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0827  DEAD/DEAH box helicase domain protein  43.18 
 
 		 706 aa  501  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.493882  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4035  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  45.11 
 
 		 679 aa  493  9.999999999999999e-139  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000527005  normal  0.0486665 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3718  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.57 
 
 		 698 aa  483  1e-135  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3804  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.45 
 
 		 698 aa  485  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00343497  decreased coverage  0.0000140841 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0673  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.86 
 
 		 695 aa  482  1e-134  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.293047  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0485  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.52 
 
 		 697 aa  476  1e-133  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4347  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.22 
 
 		 699 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0558193  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0559  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.15 
 
 		 698 aa  465  1e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000154535  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.68 
 
 		 693 aa  455  1.0000000000000001e-126  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000979868  decreased coverage  0.000575313 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1436  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.92 
 
 		 691 aa  436  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000631982  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1126  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.08 
 
 		 691 aa  435  1e-120  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.760992  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0495  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.33 
 
 		 448 aa  243  1e-62  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264596  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.44 
 
 		 1376 aa  225  2e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.79 
 
 		 543 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.79 
 
 		 543 aa  218  2e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.79 
 
 		 543 aa  219  2e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.12 
 
 		 588 aa  216  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6470  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.69 
 
 		 624 aa  214  3.9999999999999995e-54  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0566058 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.89 
 
 		 602 aa  213  7e-54  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.07 
 
 		 562 aa  206  1e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5632  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.02 
 
 		 545 aa  204  7e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0829  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.63 
 
 		 546 aa  203  9.999999999999999e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6833  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.94 
 
 		 708 aa  200  9e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1249  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.68 
 
 		 557 aa  198  3e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.44 
 
 		 593 aa  194  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.44 
 
 		 593 aa  194  5e-48  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40 
 
 		 625 aa  194  6e-48  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0020  hypothetical protein  32.7 
 
 		 493 aa  192  1e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4236  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  32.1 
 
 		 535 aa  192  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1229  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.6 
 
 		 779 aa  192  2e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2232  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.25 
 
 		 634 aa  192  2e-47  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.319875  normal  0.773319 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.9 
 
 		 626 aa  191  2.9999999999999997e-47  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4547  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.88 
 
 		 556 aa  191  5e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0908744  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0384  ATP-dependent DNA helicase RecQ  31.9 
 
 		 592 aa  191  5.999999999999999e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1914  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.8 
 
 		 588 aa  190  7e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  31.91 
 
 		 563 aa  189  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0297  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.47 
 
 		 725 aa  190  1e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0060  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.57 
 
 		 617 aa  187  4e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1542  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.76 
 
 		 592 aa  188  4e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.260757  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3200  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.97 
 
 		 600 aa  187  6e-46  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12343  putative ATP-dependent DNA helicase  35.21 
 
 		 734 aa  187  6e-46  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.839573  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0911  superfamily II DNA helicase  37.96 
 
 		 621 aa  187  6e-46  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0327  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.95 
 
 		 724 aa  187  8e-46  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.946569  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  29.88 
 
 		 721 aa  187  9e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.1 
 
 		 705 aa  186  1.0000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4590  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.41 
 
 		 607 aa  185  2.0000000000000003e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.138004  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2543  ATP-dependent DNA helicase Q  35.1 
 
 		 705 aa  186  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3439  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.82 
 
 		 599 aa  185  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.833511  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2576  ATP-dependent DNA helicase (RecQ)  35.1 
 
 		 705 aa  185  3e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.238404  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2825  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.1 
 
 		 705 aa  185  3e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000139283 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2335  ATP-dependent DNA helicase RecQ  43.51 
 
 		 593 aa  185  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.699983  normal  0.515906 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1710  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  29.96 
 
 		 716 aa  184  4.0000000000000006e-45  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00000163586  unclonable  9.26658e-25 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2961  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.09 
 
 		 622 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.303637 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2842  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.77 
 
 		 705 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0115008  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1782  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.93 
 
 		 646 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2865  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.77 
 
 		 705 aa  184  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000591362  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2702  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.09 
 
 		 621 aa  184  6e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2627  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.22 
 
 		 705 aa  184  6e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2818  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.22 
 
 		 705 aa  184  6e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.01256  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1290  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.81 
 
 		 616 aa  184  6e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.289447  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4797  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.11 
 
 		 590 aa  184  7e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0027  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.92 
 
 		 681 aa  184  7e-45  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0879817  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2792  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  29.67 
 
 		 552 aa  183  8.000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.825053 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1359  DEAD/DEAH box helicase  40.92 
 
 		 681 aa  184  8.000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0884  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.54 
 
 		 595 aa  183  1e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.385904  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6077  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.73 
 
 		 618 aa  183  1e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.9148  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>