More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_0819 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009953  Sare_0447  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.63 
 
 
708 aa  655    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0452326  decreased coverage  0.00000647403 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_06850  ATP-dependent DNA helicase RecQ  64.8 
 
 
713 aa  843    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1626  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  54.52 
 
 
706 aa  689    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.135098  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4745  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.8 
 
 
691 aa  680    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.865957 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1193  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  57.29 
 
 
691 aa  692    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.346189  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5584  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  57.57 
 
 
718 aa  728    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.128967  normal  0.346665 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0819  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  100 
 
 
745 aa  1478    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5040  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.52 
 
 
691 aa  676    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.26563  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5233  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.56 
 
 
704 aa  672    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.157625 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22560  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.17 
 
 
979 aa  704    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.188991  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1524  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.96 
 
 
712 aa  664    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18920  ATP-dependent DNA helicase RecQ  58.2 
 
 
762 aa  795    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.275245  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  56.6 
 
 
724 aa  733    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.586353  normal  0.167588 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1612  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  52.3 
 
 
733 aa  655    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.644858 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0677  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.17 
 
 
754 aa  694    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.00766403  normal  0.0478204 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03530  ATP-dependent DNA helicase RecQ  63.76 
 
 
734 aa  854    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3301  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  55.19 
 
 
723 aa  735    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1305  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  53.14 
 
 
766 aa  667    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.572742  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4657  ATP-dependent DNA helicase RecQ  53.8 
 
 
691 aa  680    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.17835  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2394  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  52.97 
 
 
756 aa  644    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.396069  normal  0.368811 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0376  ATP-dependent DNA helicase RecQ  54.97 
 
 
712 aa  650    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3226  ATP-dependent DNA helicase RecQ family  54.4 
 
 
691 aa  663    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.225844  hitchhiker  0.0000186089 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0672  ATP-dependent DNA helicase RecQ  90.34 
 
 
729 aa  1233    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.20415  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7074  ATP-dependent DNA helicase RecQ  55.75 
 
 
689 aa  713    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0184  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  63.36 
 
 
741 aa  800    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5950  ATP-dependent DNA helicase RecQ  52.73 
 
 
749 aa  682    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0569292 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0133  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  52.96 
 
 
714 aa  659    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.931384  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1091  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  48.68 
 
 
788 aa  623  1e-177  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.305899  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1532  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  41.77 
 
 
697 aa  541  9.999999999999999e-153  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1571  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.07 
 
 
693 aa  538  1e-151  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.000060483  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1940  DEAD/DEAH box helicase domain protein  47.03 
 
 
706 aa  536  1e-151  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.187923  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1318  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  42.03 
 
 
756 aa  523  1e-147  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0376564  decreased coverage  0.0000000122508 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4035  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  47.83 
 
 
679 aa  516  1.0000000000000001e-145  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000527005  normal  0.0486665 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0315  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  46.23 
 
 
698 aa  518  1.0000000000000001e-145  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.316141  normal  0.401314 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2468  ATP-dependent DNA helicase RecQ  42.78 
 
 
708 aa  513  1e-144  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.449772  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0827  DEAD/DEAH box helicase domain protein  45.79 
 
 
706 aa  511  1e-143  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.493882  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0673  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  40.17 
 
 
695 aa  506  9.999999999999999e-143  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.293047  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0559  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.45 
 
 
698 aa  481  1e-134  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  unclonable  0.000154535  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4347  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40 
 
 
699 aa  476  1e-133  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0558193  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3804  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.11 
 
 
698 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00343497  decreased coverage  0.0000140841 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3718  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.25 
 
 
698 aa  467  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0485  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.62 
 
 
697 aa  468  9.999999999999999e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1436  DEAD/DEAH box helicase domain protein  39.97 
 
 
691 aa  451  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000631982  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2963  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.03 
 
 
693 aa  444  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.00000979868  decreased coverage  0.000575313 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1126  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.39 
 
 
691 aa  441  9.999999999999999e-123  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.760992  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0495  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.89 
 
 
448 aa  266  8.999999999999999e-70  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00264596  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5632  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.19 
 
 
545 aa  242  2e-62  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.185605 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2304  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.53 
 
 
602 aa  233  7.000000000000001e-60  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3149  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.66 
 
 
1376 aa  232  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.212538 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6329  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  36.99 
 
 
588 aa  228  3e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2543  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.32 
 
 
543 aa  227  5.0000000000000005e-58  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.843392 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4974  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.67 
 
 
568 aa  225  2e-57  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.581094  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2541  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  34.86 
 
 
646 aa  224  3e-57  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0694576  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2506  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.11 
 
 
543 aa  225  3e-57  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.452  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2551  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.11 
 
 
543 aa  225  3e-57  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.525573  normal  0.510247 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3305  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.44 
 
 
637 aa  221  3e-56  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.563115  normal  0.0132339 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6295  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  39.14 
 
 
590 aa  221  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2958  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.17 
 
 
636 aa  220  8.999999999999998e-56  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00217223 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3025  ATP-dependent DNA helicase protein  41.09 
 
 
637 aa  219  2e-55  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.0062287  normal  0.0101494 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3186  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.91 
 
 
615 aa  219  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3328  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.23 
 
 
630 aa  218  4e-55  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.554418  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4005  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37 
 
 
630 aa  218  5e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1920  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.02 
 
 
563 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.000000000199537  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4797  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.01 
 
 
590 aa  212  2e-53  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.121709 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0829  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.71 
 
 
546 aa  211  3e-53  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0948  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.18 
 
 
562 aa  210  9e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2961  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.59 
 
 
622 aa  206  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.303637 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0308  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.53 
 
 
615 aa  206  1e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.356078  normal  0.56487 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06400  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.78 
 
 
626 aa  204  4e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.199854  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2984  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.66 
 
 
600 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.31482 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0953  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.78 
 
 
611 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.645427 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1097  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.78 
 
 
611 aa  203  9.999999999999999e-51  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2702  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.06 
 
 
621 aa  202  1.9999999999999998e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2101  ATP-dependent DNA helicase RecQ  41.45 
 
 
625 aa  202  1.9999999999999998e-50  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6470  ATP-dependent DNA helicase RecQ  34.68 
 
 
624 aa  202  1.9999999999999998e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0566058 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0870  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.79 
 
 
611 aa  201  3.9999999999999996e-50  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0635  ATP-dependent DNA helicase RecQ  32.93 
 
 
748 aa  201  3.9999999999999996e-50  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000112896  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1442  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.95 
 
 
605 aa  201  3.9999999999999996e-50  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.514441  normal  0.157684 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4236  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  35.46 
 
 
535 aa  200  7e-50  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3650  ATP-dependent DNA helicase RecQ  37.68 
 
 
615 aa  200  7.999999999999999e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000258992  hitchhiker  0.00000000287243 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3200  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.4 
 
 
600 aa  200  9e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4701  ATP-dependent DNA helicase, RecQ  39.08 
 
 
618 aa  200  1.0000000000000001e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0899  hypothetical protein  37.57 
 
 
608 aa  198  3e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2618  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.76 
 
 
705 aa  198  3e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00666767  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6077  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.36 
 
 
618 aa  198  3e-49  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.9148  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0838  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.66 
 
 
527 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1919  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.39 
 
 
706 aa  197  5.000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77164  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0761  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.75 
 
 
593 aa  197  5.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.089844  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0744  ATP-dependent DNA helicase RecQ  33.75 
 
 
593 aa  197  5.000000000000001e-49  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0017  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.77 
 
 
681 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.571196  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2993  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.41 
 
 
633 aa  197  6e-49  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768661  normal  0.830913 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0884  ATP-dependent DNA helicase, RecQ family  38.83 
 
 
595 aa  197  7e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.385904  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6924  ATP-dependent DNA helicase RecQ  35.24 
 
 
625 aa  197  8.000000000000001e-49  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.286849 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3175  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.08 
 
 
763 aa  197  9e-49  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0819328  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0027  ATP-dependent DNA helicase RecQ  40.35 
 
 
681 aa  196  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0879817  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3783  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.08 
 
 
647 aa  196  1e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0410934  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0270  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.24 
 
 
615 aa  196  1e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.816269 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4412  ATP-dependent DNA helicase RecQ  38.79 
 
 
619 aa  196  1e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.659664  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2659  ATP-dependent DNA helicase RecQ  39.39 
 
 
679 aa  196  1e-48  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1918  ATP-dependent DNA helicase RecQ  36.08 
 
 
658 aa  196  1e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0352657  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>