More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_0026 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_0026  short chain dehydrogenase  100 
 
 		 319 aa  637    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.122051  normal  0.68068 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0944  short chain dehydrogenase  91.16 
 
 		 294 aa  547  1e-154  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.296729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0726  short chain dehydrogenase  73.1 
 
 		 291 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.352329 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0732  short chain dehydrogenase  73.1 
 
 		 291 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.403449  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0746  short chain dehydrogenase  73.1 
 
 		 291 aa  433  1e-120  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.095749 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10558  short chain dehydrogenase  67.93 
 
 		 294 aa  382  1e-105  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0196339 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3466  short chain dehydrogenase  64.98 
 
 		 294 aa  341  1e-92  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.241299 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0860  short chain dehydrogenase  64.34 
 
 		 291 aa  335  5e-91  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0854  short chain dehydrogenase  64.73 
 
 		 291 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0871  short chain dehydrogenase  64.73 
 
 		 291 aa  334  1e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2507  short chain dehydrogenase  49.06 
 
 		 661 aa  243  3e-63  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1379  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  45.64 
 
 		 292 aa  227  2e-58  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0182353  hitchhiker  0.000251864 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4550  Male sterility domain protein  48.79 
 
 		 659 aa  221  9.999999999999999e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.838393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0491  short chain dehydrogenase  44.81 
 
 		 668 aa  218  1e-55  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0442129 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4122  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  47.37 
 
 		 275 aa  218  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1232  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  49.2 
 
 		 305 aa  217  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.623354  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2917  short chain dehydrogenase  50.21 
 
 		 665 aa  217  2e-55  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0126943  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1079  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.91 
 
 		 295 aa  215  9e-55  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.366872  normal  0.186845 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4023  short chain dehydrogenase  45.28 
 
 		 671 aa  213  2.9999999999999995e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.367232  normal  0.629555 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3494  short chain dehydrogenase  43.82 
 
 		 664 aa  213  3.9999999999999995e-54  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.447449 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3526  short chain dehydrogenase  43.7 
 
 		 665 aa  212  7.999999999999999e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.309759  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1299  fatty acyl-CoA reductase protein  42.13 
 
 		 295 aa  209  7e-53  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11576  fatty acyl-CoA reductase  46.15 
 
 		 341 aa  194  2e-48  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0002  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.87 
 
 		 273 aa  185  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  0.690765 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13425  short chain dehydrogenase  41.06 
 
 		 650 aa  179  7e-44  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3608  Male sterility domain protein  48.24 
 
 		 637 aa  172  7.999999999999999e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.619777  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4896  short chain dehydrogenase  43.35 
 
 		 671 aa  170  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.0501144 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1527  short chain dehydrogenase  44.89 
 
 		 653 aa  166  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.724176 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1256  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.59 
 
 		 280 aa  165  8e-40  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1750  Male sterility domain protein  39.69 
 
 		 642 aa  165  1.0000000000000001e-39  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1104  Male sterility domain protein  42.79 
 
 		 701 aa  147  2.0000000000000003e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.972313  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6897  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.14 
 
 		 290 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.748885 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0044  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.2 
 
 		 264 aa  122  6e-27  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1067  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.06 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0808  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  42.7 
 
 		 252 aa  121  1.9999999999999998e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3565  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  43.09 
 
 		 244 aa  121  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4623  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 		 265 aa  120  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4456  short chain dehydrogenase  40.61 
 
 		 258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.968852  decreased coverage  0.00124263 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1904  gluconate 5-dehydrogenase  31.68 
 
 		 270 aa  114  3e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  decreased coverage  0.000312184  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3779  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.74 
 
 		 266 aa  112  7.000000000000001e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  hitchhiker  0.00111461  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4482  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.63 
 
 		 244 aa  111  1.0000000000000001e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000123251 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2536  short chain dehydrogenase  38.25 
 
 		 241 aa  109  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0761  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 277 aa  109  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.416641 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2534  gluconate 5-dehydrogenase  33.65 
 
 		 262 aa  109  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0490  gluconate 5-dehydrogenase  34.63 
 
 		 265 aa  109  6e-23  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3756  gluconate 5-dehydrogenase  33.66 
 
 		 257 aa  109  6e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0911  short chain dehydrogenase  36.46 
 
 		 242 aa  109  8.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2470  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.72 
 
 		 244 aa  108  1e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7039  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.09 
 
 		 258 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.607221 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0938  short chain dehydrogenase  36.46 
 
 		 242 aa  107  2e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4868  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.16 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00194851  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0353  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.18 
 
 		 262 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0159  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 		 249 aa  107  2e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.410897  normal  0.168063 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0451  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.85 
 
 		 339 aa  107  2e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1918  short chain dehydrogenase  35.1 
 
 		 252 aa  107  3e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.633362  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6414  gluconate 5-dehydrogenase  33.67 
 
 		 254 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0118789  normal  0.389185 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.69 
 
 		 255 aa  106  4e-22  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.82 
 
 		 262 aa  107  4e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.133593  normal  0.554394 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2049  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  31.96 
 
 		 230 aa  106  5e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11068  oxidoreductase  35.38 
 
 		 301 aa  106  5e-22  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.205536 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04715  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.2 
 
 		 249 aa  106  6e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.863639  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2831  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.54 
 
 		 264 aa  106  6e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7167  short chain dehydrogenase  36.6 
 
 		 249 aa  106  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.83 
 
 		 251 aa  105  7e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3251  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.73 
 
 		 259 aa  105  8e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5709  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.73 
 
 		 347 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4660  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.53 
 
 		 261 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.268545  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0951  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.03 
 
 		 261 aa  104  2e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1752  short chain dehydrogenase  38.12 
 
 		 254 aa  104  2e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9335  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.78 
 
 		 250 aa  104  2e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.728753  normal  0.802866 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3170  putative Short-chain dehydrogenase/reductase  35.23 
 
 		 544 aa  104  2e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0745281 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4214  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.23 
 
 		 262 aa  104  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.717984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3078  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.95 
 
 		 255 aa  104  2e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.485877  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1359  short chain dehydrogenase  35.24 
 
 		 602 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3728  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.62 
 
 		 241 aa  104  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.56 
 
 		 260 aa  103  3e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3368  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.08 
 
 		 241 aa  104  3e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.119808  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6403  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.92 
 
 		 258 aa  103  4e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 		 264 aa  103  4e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.845571  normal  0.46236 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0548  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.27 
 
 		 261 aa  103  4e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0947  gluconate 5-dehydrogenase oxidoreductase protein  36.82 
 
 		 258 aa  103  5e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.815693 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3735  short chain dehydrogenase  39.66 
 
 		 281 aa  103  5e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0032  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.98 
 
 		 342 aa  102  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.891974  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6104  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.05 
 
 		 258 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.500717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4578  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.29 
 
 		 264 aa  102  7e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3982  short chain dehydrogenase  34.63 
 
 		 260 aa  102  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0357942 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3253  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.78 
 
 		 264 aa  102  7e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.200417  normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0982  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.5 
 
 		 268 aa  102  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3138  short chain dehydrogenase  34.63 
 
 		 260 aa  102  7e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0721208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  36.32 
 
 		 253 aa  102  8e-21  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00235361 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0412  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.11 
 
 		 249 aa  102  8e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.956154 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0894  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.47 
 
 		 266 aa  102  8e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3491  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  33.89 
 
 		 253 aa  102  9e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.260507  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5584  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.77 
 
 		 344 aa  101  1e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.753226  normal  0.910238 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4539  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.2 
 
 		 276 aa  102  1e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0488  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  35.56 
 
 		 261 aa  101  1e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3288  short chain dehydrogenase  34.31 
 
 		 260 aa  101  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0233742  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2764  short chain dehydrogenase  34.72 
 
 		 258 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.191986  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2771  short chain dehydrogenase  35.98 
 
 		 253 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.46 
 
 		 258 aa  102  1e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>