161 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1653 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_1653  hexulose-6-phosphate isomerase  100 
 
 		 181 aa  370  1e-102  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  unclonable  0.000000000157973  normal  0.272827 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3044  SIS domain-containing protein  55.06 
 
 		 177 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.128664  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA3050  SIS domain-containing protein  55.06 
 
 		 177 aa  199  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2738  hexulose-6-phosphate synthase/SIS domain-containing protein  50 
 
 		 389 aa  177  7e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2737  sugar isomerase (SIS)  42.86 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2813  sugar isomerase (SIS)  42.86 
 
 		 183 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0217  SIS domain-containing protein  39.23 
 
 		 182 aa  125  4.0000000000000003e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0308  sugar isomerase (SIS)  39.88 
 
 		 206 aa  120  9.999999999999999e-27  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3213  6-phospho 3-hexuloisomerase  38.59 
 
 		 187 aa  117  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0993  hexulose-6-phosphate isomerase  38.82 
 
 		 200 aa  117  9.999999999999999e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.830093  normal  0.529844 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0479  sugar isomerase (SIS)  40.13 
 
 		 202 aa  111  6e-24  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0638  sugar isomerase (SIS)  40.52 
 
 		 178 aa  111  6e-24  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1199  sugar isomerase (SIS)  35.64 
 
 		 191 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.645191  normal  0.0117075 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1507  sugar isomerase (SIS)  33.33 
 
 		 211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0594  sugar isomerase (SIS)  36.46 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0608  sugar isomerase (SIS)  36.46 
 
 		 182 aa  109  2.0000000000000002e-23  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0910  sugar isomerase (SIS)  35.4 
 
 		 190 aa  108  5e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.510158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1889  hexulose-6-phosphate isomerase  34.41 
 
 		 202 aa  107  7.000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3132  hexulose-6-phosphate isomerase  35.85 
 
 		 204 aa  104  8e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.212429  normal  0.445732 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0236  hexulose-6-phosphate isomerase  34.43 
 
 		 209 aa  104  8e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.249011 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1130  6-phospho 3-hexuloisomerase  37.3 
 
 		 209 aa  102  2e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3252  3-hexulose-6-phosphate isomerase  36.41 
 
 		 186 aa  102  2e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.235317  normal  0.405094 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2411  6-phospho 3-hexuloisomerase  30.16 
 
 		 199 aa  103  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1650  sugar isomerase (SIS)  36.96 
 
 		 186 aa  102  4e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000127624 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0132  hexulose-6-phosphate isomerase  32.95 
 
 		 180 aa  101  6e-21  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1579  sugar isomerase (SIS)  35.48 
 
 		 202 aa  101  6e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.208067  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3031  sugar isomerase (SIS)  31.25 
 
 		 194 aa  99.4  3e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1850  6-phospho 3-hexuloisomerase  36.7 
 
 		 186 aa  99.4  3e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1163  sugar isomerase (SIS)  30.39 
 
 		 194 aa  98.2  6e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.105663  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1367  hexulose-6-phosphate isomerase  34.46 
 
 		 185 aa  97.8  7e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0808  hexulose-6-phosphate isomerase  41.45 
 
 		 202 aa  97.4  9e-20  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0706  sugar isomerase (SIS)  27.6 
 
 		 205 aa  94.4  8e-19  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0564626  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0610  6-phospho 3-hexuloisomerase  38.82 
 
 		 202 aa  92.4  3e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0616  sugar isomerase (SIS)  36.84 
 
 		 201 aa  91.7  5e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.271955  normal  0.764233 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2930  6-phospho 3-hexuloisomerase  37.84 
 
 		 188 aa  91.7  6e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000566835 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5672  6-phospho 3-hexuloisomerase  38.46 
 
 		 194 aa  79.7  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.343688 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3709  hexulose-6-phosphate isomerase  40.91 
 
 		 200 aa  78.6  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3836  sugar isomerase (SIS)  32.04 
 
 		 188 aa  77.8  0.00000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.347937  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0552  sugar isomerase  33.77 
 
 		 188 aa  75.1  0.0000000000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4594  3-hexulose-6-phosphate isomerase  30.43 
 
 		 187 aa  73.2  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3056  sugar isomerase (SIS)  28.25 
 
 		 186 aa  72.4  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0185  sugar phosphate isomerase  30.25 
 
 		 397 aa  64.3  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0722  RpiR family transcriptional regulator  31.93 
 
 		 286 aa  55.8  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.23938  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29100  transcriptional regulator  28.19 
 
 		 290 aa  55.8  0.0000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02327  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.16 
 
 		 285 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02288  hypothetical protein  30.16 
 
 		 285 aa  53.5  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1252  RpiR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 285 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.102619 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2799  transcriptional regulator, RpiR family  30.16 
 
 		 285 aa  52.8  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.576789  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2563  RpiR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 285 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2713  RpiR family transcriptional regulator  30.16 
 
 		 285 aa  53.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0807  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  33.04 
 
 		 346 aa  52.4  0.000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0718  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  33.04 
 
 		 346 aa  52.4  0.000003  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1234  transcriptional regulator, RpiR family  29.37 
 
 		 285 aa  52  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2582  RpiR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 285 aa  51.2  0.000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0300  RpiR family transcriptional regulator  24.86 
 
 		 266 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0307  hypothetical protein  24.86 
 
 		 266 aa  50.4  0.00001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0416  helix-turn-helix protein RpiR:sugar isomerase (SIS)  31.54 
 
 		 286 aa  49.7  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3657  transcriptional regulator, RpiR family  29.37 
 
 		 285 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3564  RpiR family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 284 aa  49.3  0.00003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.536409  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3122  RpiR family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 282 aa  48.9  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4477  KpsF/GutQ family protein  34.78 
 
 		 334 aa  48.5  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.382175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4164  RpiR family transcriptional regulator  28.21 
 
 		 282 aa  48.1  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.045816  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0727  KpsF/GutQ family protein  26.06 
 
 		 340 aa  48.1  0.00007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.516394  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03961  DNA-binding transcriptional repressor  28.57 
 
 		 296 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3902  transcriptional regulator, RpiR family  28.57 
 
 		 296 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3787  transcriptional regulator, RpiR family  35.14 
 
 		 280 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.925929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4864  transcriptional regulator, RpiR family  35.14 
 
 		 280 aa  47  0.0001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.403808 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4117  KpsF/GutQ  29.6 
 
 		 327 aa  47  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4555  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  28.57 
 
 		 296 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0338  transcriptional regulator, RpiR family  27.73 
 
 		 282 aa  47  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3937  DNA-binding transcriptional repressor RpiR  28.57 
 
 		 296 aa  47.8  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03921  hypothetical protein  28.57 
 
 		 296 aa  47.4  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3960  RpiR family transcriptional regulator  28.1 
 
 		 304 aa  47.4  0.0001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.162661  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0495  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  43.55 
 
 		 339 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000215608 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2767  RpiR family transcriptional regulator  37.68 
 
 		 312 aa  47  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0360  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  34.02 
 
 		 609 aa  47  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0550  transcriptional regulator  28.23 
 
 		 284 aa  45.8  0.0003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00967802  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3232  transcriptional regulator  26.88 
 
 		 274 aa  45.8  0.0003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0360083  normal  0.0600235 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06356  glucokinase  31.91 
 
 		 287 aa  45.8  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3105  KpsF/GutQ family protein  21.79 
 
 		 324 aa  45.8  0.0004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.345406  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0879  KpsF/GutQ family protein  34.02 
 
 		 329 aa  45.4  0.0004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00879092  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1373  hypothetical protein  30.53 
 
 		 278 aa  45.8  0.0004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4463  glucosamine/fructose-6-phosphate aminotransferase, isomerizing  36.59 
 
 		 609 aa  45.1  0.0005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3036  RpiR family transcriptional regulator  29.13 
 
 		 293 aa  45.1  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.627986 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0363  KpsF/GutQ family protein  27.14 
 
 		 344 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.103679  normal  0.93857 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2129  RpiR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 312 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2741  RpiR family transcriptional regulator  36.23 
 
 		 312 aa  45.1  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1123  KpsF/GutQ family protein  30.25 
 
 		 342 aa  45.1  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5116  transcriptional regulator, RpiR family  35.11 
 
 		 286 aa  44.7  0.0007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0006  KpsF/GutQ family protein  23.26 
 
 		 357 aa  44.7  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.157738  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2584  hypothetical protein  31.07 
 
 		 282 aa  44.7  0.0007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2934  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  28.89 
 
 		 332 aa  44.7  0.0008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000247935  normal  0.818557 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3016  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  28.89 
 
 		 332 aa  44.7  0.0008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.143361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3113  sugar isomerase (SIS)  28.89 
 
 		 332 aa  44.7  0.0008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000765301  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1481  glucosamine--fructose-6-phosphate aminotransferase  30.19 
 
 		 603 aa  44.7  0.0008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3506  SIS domain-containing protein  30.23 
 
 		 332 aa  43.9  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0521  RpiR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 283 aa  44.3  0.001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.207231  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0601  KpsF/GutQ family protein  31.19 
 
 		 327 aa  44.3  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0442241 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1799  RpiR family transcriptional regulator  27.83 
 
 		 309 aa  44.3  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0151884  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1077  glutamine--fructose-6-phosphate transaminase (isomerizing)  29.21 
 
 		 332 aa  43.9  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.898822  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>