More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mfla_1469 on replicon NC_007947
Organism: Methylobacillus flagellatus KT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007947  Mfla_1469  squalene/phytoene synthase  100 
 
 		 278 aa  575  1.0000000000000001e-163  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.093499 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2706  squalene/phytoene synthase  64.03 
 
 		 277 aa  374  1e-103  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000109995  hitchhiker  0.00000842168 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2158  squalene synthase HpnD  61.73 
 
 		 277 aa  371  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2343  squalene/phytoene synthase  60.85 
 
 		 280 aa  365  1e-100  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.149671  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1524  putative terpenoid synthase  58.76 
 
 		 293 aa  343  1e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1512  squalene synthase HpnD  60.22 
 
 		 285 aa  335  3.9999999999999995e-91  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.575071  normal  0.0112347 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2505  squalene synthase HpnD  57.72 
 
 		 279 aa  328  5.0000000000000004e-89  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.522879  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1121  squalene synthase HpnD  56.62 
 
 		 279 aa  324  9e-88  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.148736  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1202  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  56.62 
 
 		 279 aa  324  1e-87  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0346934  normal  0.446286 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1697  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  55.36 
 
 		 281 aa  322  4e-87  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.242152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2964  squalene/phytoene synthase  55.84 
 
 		 293 aa  319  3e-86  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  decreased coverage  0.00159614  decreased coverage  0.000921441 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2017  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  55.11 
 
 		 280 aa  316  3e-85  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1371  squalene/phytoene synthase  55.76 
 
 		 302 aa  315  6e-85  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.157684  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2549  squalene synthase HpnD  54.38 
 
 		 278 aa  313  1.9999999999999998e-84  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00412385 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0070  squalene/phytoene synthase  54.58 
 
 		 280 aa  312  4.999999999999999e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  decreased coverage  0.00181146  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1549  squalene/phytoene synthase  55.51 
 
 		 279 aa  303  1.0000000000000001e-81  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2572  squalene synthase HpnD  55.88 
 
 		 281 aa  299  3e-80  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0455716 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1456  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  56.04 
 
 		 286 aa  298  8e-80  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1287  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  53.71 
 
 		 287 aa  283  2.0000000000000002e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.200444  normal  0.0949052 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1042  squalene/phytoene synthase  47.64 
 
 		 286 aa  267  2e-70  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.100807  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1944  squalene/phytoene synthase  44.96 
 
 		 276 aa  248  6e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.134668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1565  squalene synthase HpnD  43.68 
 
 		 277 aa  241  7e-63  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0179833  normal  0.166486 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1894  squalene synthase HpnD  43.17 
 
 		 277 aa  240  2e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.635436  normal  0.151415 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1652  putative phytoene synthase protein  43.32 
 
 		 290 aa  238  9e-62  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.665297 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0906  squalene/phytoene synthase  41.82 
 
 		 284 aa  217  2e-55  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0584416  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0306  squalene/phytoene synthase  39.13 
 
 		 288 aa  204  9e-52  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1958  squalene synthase HpnD  40.52 
 
 		 300 aa  202  6e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0340477  normal  0.450684 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1482  phytoene synthase, putative  39.03 
 
 		 307 aa  201  7e-51  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.135853  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2502  phytoene synthase, putative  39.03 
 
 		 307 aa  201  7e-51  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1975  putative phytoene synthase  38.83 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264351  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3330  putative phytoene synthase  38.83 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10709  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1248  putative phytoene synthase  38.83 
 
 		 278 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.245345  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2389  putative phytoene synthase  38.55 
 
 		 280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2347  putative phytoene synthase  38.55 
 
 		 280 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5245  squalene/phytoene synthase  40.59 
 
 		 303 aa  199  3e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2098  phytoene synthase, putative  38.83 
 
 		 278 aa  198  7e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.389143  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1356  phytoene desaturase  36.71 
 
 		 311 aa  198  1.0000000000000001e-49  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6145  squalene/phytoene synthase  40.52 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1934  squalene/phytoene synthase  40.52 
 
 		 300 aa  196  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1006  squalene/phytoene synthase  38.35 
 
 		 302 aa  194  1e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.109233  normal  0.62289 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2703  squalene/phytoene synthase  41.51 
 
 		 324 aa  194  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80466  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1337  squalene synthase HpnD  39.55 
 
 		 352 aa  191  1e-47  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00058937 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1849  squalene synthase HpnD  40.15 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.775732  hitchhiker  0.00598695 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2303  putative phytoene synthase  37.17 
 
 		 284 aa  190  2e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.244566  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1922  squalene/phytoene synthase  40.37 
 
 		 303 aa  189  2.9999999999999997e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.691361  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1752  squalene/phytoene synthase  42.06 
 
 		 337 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1732  Squalene/phytoene synthase  34.03 
 
 		 310 aa  186  4e-46  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.956731  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1585  Squalene/phytoene synthase  36.05 
 
 		 309 aa  185  6e-46  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1507  Squalene/phytoene synthase  36.15 
 
 		 309 aa  185  8e-46  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.100446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4189  Squalene/phytoene synthase  36.39 
 
 		 312 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.604456  normal  0.235652 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1175  phytoene desaturase  37.69 
 
 		 316 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.111689  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1738  squalene/phytoene synthase  35.66 
 
 		 310 aa  183  2.0000000000000003e-45  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.214205  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1883  Squalene/phytoene synthase  38.06 
 
 		 292 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0657917 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2117  squalene/phytoene synthase  40.29 
 
 		 337 aa  182  4.0000000000000006e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4794  phytoene synthase  35.42 
 
 		 310 aa  179  4e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000000235829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1984  phytoene synthase  37.99 
 
 		 308 aa  179  4.999999999999999e-44  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.735846  normal  0.234628 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0969  Squalene/phytoene synthase  35.91 
 
 		 311 aa  179  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.641353 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2874  phytoene synthase  34.74 
 
 		 310 aa  179  4.999999999999999e-44  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.109595  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02151  squalene and phytoene synthase  36.3 
 
 		 312 aa  178  8e-44  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0026  squalene/phytoene synthase  36.88 
 
 		 268 aa  178  9e-44  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1509  squalene and phytoene synthase  36.3 
 
 		 312 aa  178  1e-43  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1158  Squalene/phytoene synthase  34.95 
 
 		 310 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0309  Squalene/phytoene synthase  34.26 
 
 		 310 aa  171  1e-41  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01601  squalene and phytoene synthase  35.93 
 
 		 302 aa  169  3e-41  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.37181  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0309  Phytoene synthase  33.91 
 
 		 310 aa  169  3e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.334071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0299  phytoene synthase  35.94 
 
 		 304 aa  169  4e-41  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.791623  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01621  squalene and phytoene synthase  35.93 
 
 		 302 aa  169  4e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26641  squalene and phytoene synthase  34.46 
 
 		 313 aa  169  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01581  squalene and phytoene synthase  34.46 
 
 		 313 aa  168  7e-41  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5424  squalene synthase HpnD  39.83 
 
 		 283 aa  168  9e-41  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.766675  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1833  squalene synthase HpnD  38.56 
 
 		 283 aa  167  1e-40  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2394  phytoene synthase  34.89 
 
 		 302 aa  167  1e-40  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4010  phytoene synthase  34.14 
 
 		 325 aa  168  1e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0937  Squalene/phytoene synthase  41.26 
 
 		 331 aa  167  2e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0100379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0145  squalene and phytoene synthase  34.83 
 
 		 302 aa  166  2.9999999999999998e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7144  squalene synthase HpnD  37.96 
 
 		 283 aa  166  4e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01711  squalene and phytoene synthase  35.19 
 
 		 302 aa  163  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.460844  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0523  squalene/phytoene synthase  36.84 
 
 		 298 aa  161  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.182071  normal  0.774917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2218  squalene synthase HpnD  38.06 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.674273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1942  squalene synthase HpnD  38.06 
 
 		 283 aa  160  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.802248 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3241  squalene synthase HpnD  37.7 
 
 		 294 aa  160  2e-38  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.154532 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2441  Phytoene synthase  36.16 
 
 		 289 aa  156  3e-37  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.214033  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1694  squalene/phytoene synthase  36.4 
 
 		 303 aa  154  1e-36  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0597183  hitchhiker  0.0000516194 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0064  squalene-phytoene synthase  39.2 
 
 		 687 aa  154  2e-36  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1383  phytoene synthase  33.22 
 
 		 339 aa  151  8.999999999999999e-36  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.244204  hitchhiker  0.00693002 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1745  squalene/phytoene synthase  31.46 
 
 		 293 aa  151  1e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13432  phytoene synthase phyA  38 
 
 		 302 aa  150  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1724  squalene/phytoene synthase  36.73 
 
 		 279 aa  150  3e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.949729  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6349  squalene synthase HpnD  37.87 
 
 		 284 aa  149  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.00743094  normal  0.0909411 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2967  putative phytoene synthase  39.66 
 
 		 279 aa  150  3e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3575  squalene/phytoene synthase  35.95 
 
 		 279 aa  148  8e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0912672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4080  squalene/phytoene synthase  34.72 
 
 		 310 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.243563 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4263  squalene synthase HpnD  36.36 
 
 		 279 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3229  Squalene/phytoene synthase  31.32 
 
 		 332 aa  145  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.0335688 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6667  squalene synthase HpnD  36.9 
 
 		 287 aa  145  5e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.349811  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7027  squalene synthase HpnD  35.74 
 
 		 282 aa  145  6e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.597423  hitchhiker  0.000000555779 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1746  farnesyl-diphosphate farnesyltransferase  32.09 
 
 		 316 aa  145  9e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_56481  phytoene synthase  39.19 
 
 		 505 aa  145  1e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0010  putative squalene/phytoene synthase  35.25 
 
 		 306 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_12559  predicted protein  34.62 
 
 		 273 aa  144  1e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.209763  normal  0.196988 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>