More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_0039 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_0039  ABC transporter related  100 
 
 		 256 aa  521  1e-147  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5221  ABC transporter related  71.37 
 
 		 259 aa  374  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.59712  normal  0.146567 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5406  ABC transporter related  71.03 
 
 		 259 aa  366  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0390  ABC transporter related  66.41 
 
 		 256 aa  353  2e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.178829  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1222  ABC transporter related  65.86 
 
 		 258 aa  335  2.9999999999999997e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.757141  hitchhiker  0.00582014 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3681  ABC transporter related protein  64.94 
 
 		 267 aa  336  2.9999999999999997e-91  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4318  ABC transporter related  63.35 
 
 		 263 aa  335  3.9999999999999995e-91  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.274377  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0905  ABC transporter related protein  61.51 
 
 		 256 aa  328  6e-89  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2000  ABC transporter related protein  63.1 
 
 		 254 aa  327  1.0000000000000001e-88  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181776  normal  0.649746 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1773  ABC transporter related  61.2 
 
 		 252 aa  325  4.0000000000000003e-88  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2854  ABC transporter-like  61.13 
 
 		 254 aa  324  8.000000000000001e-88  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1160  polar amino acid ABC transporter ATPase  62.4 
 
 		 254 aa  323  2e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236932  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3516  ABC transporter related  62.4 
 
 		 254 aa  323  2e-87  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6166  ABC transporter related  61.2 
 
 		 267 aa  322  3e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6459  ABC transporter related  61.13 
 
 		 255 aa  318  5e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3581  ABC transporter related  61.18 
 
 		 260 aa  318  6e-86  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.639731  normal  0.0324679 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2834  ABC transporter-related protein  61.02 
 
 		 260 aa  318  6e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1983  ABC transporter related  59.6 
 
 		 261 aa  318  7.999999999999999e-86  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2932  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  61.22 
 
 		 254 aa  315  6e-85  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.735834  normal  0.520228 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3688  ABC transporter related protein  59.13 
 
 		 273 aa  314  7e-85  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.540911 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2098  ABC transporter ATP-binding protein  61.13 
 
 		 254 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4694  ABC transporter related  59.36 
 
 		 254 aa  312  3.9999999999999997e-84  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.695976  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3091  ABC transporter related  58.96 
 
 		 254 aa  311  7.999999999999999e-84  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.436299  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5576  ABC transporter ATP-binding protein  58.73 
 
 		 254 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3709  ABC transporter related  57.6 
 
 		 268 aa  308  5.9999999999999995e-83  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3032  ABC transporter related  58.8 
 
 		 250 aa  308  6.999999999999999e-83  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0101  ABC transporter related protein  57.69 
 
 		 262 aa  307  9e-83  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3048  ABC transporter related  58 
 
 		 250 aa  306  2.0000000000000002e-82  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.160452  normal  0.702295 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_34660  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.84 
 
 		 260 aa  305  6e-82  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7703  ABC transporter related  60.33 
 
 		 264 aa  302  4.0000000000000003e-81  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3908  ABC transporter related  57.25 
 
 		 274 aa  301  6.000000000000001e-81  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.735904  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1940  ABC transporter related  59.13 
 
 		 263 aa  300  1e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00554331  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2503  ABC transporter ATP-binding protein  57.83 
 
 		 598 aa  300  2e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1066  ABC transporter, ATP-binding protein  59.3 
 
 		 262 aa  300  2e-80  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.0891394 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0934  polar amino acid ABC transporter ATPase  59.22 
 
 		 276 aa  299  3e-80  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5459  ABC transporter related  55.56 
 
 		 263 aa  298  5e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.26828  normal  0.671869 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4985  ABC transporter related  56.5 
 
 		 256 aa  297  1e-79  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.397925  normal  0.0181187 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0927  ABC transporter related  57.65 
 
 		 264 aa  297  1e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00049865  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4343  ABC transporter related  57.43 
 
 		 279 aa  296  2e-79  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1375  ABC transporter related  56.05 
 
 		 263 aa  295  4e-79  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000102705  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0327  ABC transporter-like protein  60 
 
 		 246 aa  295  6e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.246598  normal  0.811269 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3766  ABC transporter related  58.61 
 
 		 264 aa  293  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.343031  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24330  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.59 
 
 		 273 aa  292  4e-78  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0478381  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0984  ABC transporter related  54.4 
 
 		 241 aa  291  5e-78  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0949  ABC transporter related  54.4 
 
 		 241 aa  291  5e-78  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3799  ABC transporter related  57.03 
 
 		 256 aa  291  6e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.43106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_38820  amino acid ABC transporter ATP-binding protein  59.2 
 
 		 251 aa  291  8e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5564  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  56.15 
 
 		 592 aa  290  2e-77  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4351  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.1 
 
 		 595 aa  290  2e-77  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.459912  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3458  ABC polar amino acid transporter, ATPase subunit  57.03 
 
 		 246 aa  289  3e-77  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3103  ABC transporter related  57.03 
 
 		 246 aa  289  3e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.209111  normal  0.482435 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4548  ABC transporter related  55.87 
 
 		 254 aa  288  4e-77  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000266703  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2086  ABC transporter related  54.12 
 
 		 257 aa  288  4e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3029  ABC transporter related  53.6 
 
 		 241 aa  288  6e-77  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0959  ABC transporter related  56.75 
 
 		 260 aa  288  6e-77  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0314  hypothetical protein  54 
 
 		 255 aa  288  6e-77  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000000509196  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1184  ABC transporter-related protein  54.4 
 
 		 275 aa  288  7e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2154  ABC transporter related  56.33 
 
 		 274 aa  288  8e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.117419  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2494  ABC transporter related protein  56.33 
 
 		 274 aa  287  1e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.742737  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3930  ABC transporter related  55.38 
 
 		 267 aa  287  1e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.101996  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0917  ABC transporter related  53.6 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.966911 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0880  ABC transporter related  53.6 
 
 		 241 aa  287  1e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.152128  normal  0.31511 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0590  ABC transporter related protein  58.04 
 
 		 257 aa  287  1e-76  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1042  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  53.6 
 
 		 241 aa  286  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2890  ABC transporter  55.74 
 
 		 261 aa  286  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00124978  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2063  ABC transporter related  56.63 
 
 		 246 aa  286  2e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0300144  normal  0.143114 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3400  hypothetical protein  55.2 
 
 		 244 aa  286  2e-76  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0818421  normal  0.200559 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2361  ABC transporter-related protein  57.5 
 
 		 253 aa  286  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5537  ABC transporter related  54.72 
 
 		 255 aa  286  2e-76  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.772431 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3399  ABC transporter related  54.29 
 
 		 241 aa  286  2.9999999999999996e-76  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3519  ABC transporter related protein  54.22 
 
 		 240 aa  285  2.9999999999999996e-76  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2525  ABC transporter-like protein protein  52.73 
 
 		 246 aa  285  2.9999999999999996e-76  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2971  ABC transporter related  55.38 
 
 		 254 aa  285  4e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3055  ABC transporter related  53.2 
 
 		 241 aa  285  4e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00427883  hitchhiker  0.00805011 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3394  ABC transporter related  53.2 
 
 		 241 aa  285  5e-76  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00476356  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3009  amino acid ABC transporter, ATP-binding protein  55.33 
 
 		 261 aa  285  5.999999999999999e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0789225  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3499  ABC transporter related  53.91 
 
 		 254 aa  285  5.999999999999999e-76  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.114372  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3164  ABC transporter-related protein  53.2 
 
 		 241 aa  285  5.999999999999999e-76  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.195167  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0817  ABC transporter related  55.95 
 
 		 244 aa  285  7e-76  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.251466  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0970  ABC transporter related  53.2 
 
 		 241 aa  284  9e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.805871  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1467  glutamine ABC transporter, ATP-binding protein, GlnQ putative  54.22 
 
 		 246 aa  283  1.0000000000000001e-75  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2964  ABC transporter related protein  57.87 
 
 		 253 aa  283  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.194601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5145  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.51 
 
 		 567 aa  284  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.900628 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0737  ABC transporter-like  53.91 
 
 		 246 aa  283  2.0000000000000002e-75  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0599  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  55.73 
 
 		 567 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.741519  normal  0.106218 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0396  polar amino acid ABC transporter inner membrane protein  56.91 
 
 		 602 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0521  ABC transporter related  55.33 
 
 		 272 aa  283  2.0000000000000002e-75  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3863  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.42 
 
 		 594 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.132833  normal  0.716613 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4323  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.42 
 
 		 594 aa  283  2.0000000000000002e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0565  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  56.97 
 
 		 636 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1688  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  56.97 
 
 		 636 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.295284  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0737  amino acid ABC transporter, ATP-binding/permease protein  56.97 
 
 		 636 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5874  polar amino acid ABC transporter, inner membrane subunit  55.74 
 
 		 597 aa  283  3.0000000000000004e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.2284  normal  0.116793 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2265  ABC-type polar amino acid transport system, ATPase component  56.97 
 
 		 636 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1893  amino acid ABC transporter, permease/ATP-binding protein  56.97 
 
 		 636 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1685  His/Glu/Gln/Arg/opine amino acid ABC transporter permease/periplasmic amino acid-binding protein  56.97 
 
 		 636 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1030  ABC transporter related  57.96 
 
 		 243 aa  282  4.0000000000000003e-75  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.71588 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2055  ABC transporter related protein  54.51 
 
 		 244 aa  281  5.000000000000001e-75  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1596  ABC transporter related  55.82 
 
 		 249 aa  281  5.000000000000001e-75  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.655057  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3012  phosphate ABC transporter ATPase  55.69 
 
 		 269 aa  281  6.000000000000001e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0453567  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>