86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_2620 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_2620  pyrimidine 5'-nucleotidase  100 
 
 		 248 aa  501  1e-141  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0626666 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2341  pyrimidine 5'-nucleotidase  99.6 
 
 		 248 aa  498  1e-140  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2296  pyrimidine 5'-nucleotidase  93.42 
 
 		 243 aa  460  9.999999999999999e-129  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.491142  normal  0.310547 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0955  pyrimidine 5'-nucleotidase  80.5 
 
 		 249 aa  400  9.999999999999999e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.559689  normal  0.38574 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0867  pyrimidine 5'-nucleotidase  78.51 
 
 		 243 aa  382  1e-105  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.652613  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1385  pyrimidine 5'-nucleotidase  78.1 
 
 		 243 aa  380  1e-104  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0603953  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1204  pyrimidine 5'-nucleotidase  58.26 
 
 		 240 aa  261  6e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00476471 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7331  HAD-superfamily hydrolase  56.14 
 
 		 231 aa  251  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.178908  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3331  pyrimidine 5'-nucleotidase  54.31 
 
 		 268 aa  247  1e-64  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.142582 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3070  pyrimidine 5-nucleotidase  56.31 
 
 		 238 aa  244  6.999999999999999e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.560308 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3699  pyrimidine 5-nucleotidase  55.2 
 
 		 237 aa  242  3.9999999999999997e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0074  pyrimidine 5-nucleotidase  53.98 
 
 		 233 aa  234  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0135144 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0071  pyrimidine 5'-nucleotidase  52.65 
 
 		 237 aa  232  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0142063  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0631  pyrimidine 5'-nucleotidase  54.71 
 
 		 233 aa  232  5e-60  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0678  pyrimidine 5-nucleotidase  53.64 
 
 		 236 aa  231  6e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0294  pyrimidine 5'-nucleotidase  48.55 
 
 		 248 aa  230  1e-59  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0065  pyrimidine 5'-nucleotidase  49.13 
 
 		 237 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.284923  decreased coverage  0.00705345 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1899  pyrimidine 5'-nucleotidase  50.82 
 
 		 249 aa  228  8e-59  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.226115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0967  HAD superfamily hydrolase  53.15 
 
 		 234 aa  228  8e-59  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1026  HAD superfamily hydrolase  52.7 
 
 		 234 aa  226  3e-58  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0812  pyrimidine 5-nucleotidase  52.84 
 
 		 235 aa  226  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.935066  normal  0.61408 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0082  pyrimidine 5'-nucleotidase  48.68 
 
 		 235 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.723897  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0382  pyrimidine 5'-nucleotidase  50.22 
 
 		 232 aa  219  3e-56  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0582701  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0449  hydrolase  48.48 
 
 		 250 aa  209  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1357  pyrimidine 5'-nucleotidase  51.33 
 
 		 234 aa  205  5e-52  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.593204  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3343  pyrimidine 5-nucleotidase  44.98 
 
 		 238 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2390  putative pyrimidine 5'-nucleotidase  46.19 
 
 		 215 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.664306  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0657  pyrimidine 5'-nucleotidase  45.05 
 
 		 215 aa  176  4e-43  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.114356 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4559  pyrimidine 5'-nucleotidase  43.24 
 
 		 222 aa  172  5e-42  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0455  pyrimidine 5'-nucleotidase  45.31 
 
 		 240 aa  168  9e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.50243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1243  pyrimidine 5-nucleotidase  42.41 
 
 		 213 aa  167  1e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.882257  normal  0.476279 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1870  hydrolase  42.66 
 
 		 215 aa  167  1e-40  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.777911  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2297  pyrimidine 5-nucleotidase  42.92 
 
 		 214 aa  167  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0520  pyrimidine 5'-nucleotidase  42.2 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2912  pyrimidine 5'-nucleotidase  44.86 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3943  pyrimidine 5'-nucleotidase  40.55 
 
 		 228 aa  156  3e-37  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2827  pyrimidine 5-nucleotidase  40.19 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.112564  normal  0.0242793 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1836  pyrimidine 5-nucleotidase  38.43 
 
 		 229 aa  151  1e-35  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.00207221  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3072  HAD family hydrolase  36.76 
 
 		 220 aa  130  1.0000000000000001e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000791447  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1534  pyrimidine 5'-nucleotidase  37.57 
 
 		 216 aa  124  1e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.78669  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0010  pyrimidine 5'-nucleotidase  36.65 
 
 		 221 aa  121  9.999999999999999e-27  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.32249  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0141  pyrimidine 5-nucleotidase  36.17 
 
 		 334 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0804995 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2923  pyrimidine 5'-nucleotidase  38.05 
 
 		 220 aa  112  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0724502  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0181  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  34.59 
 
 		 322 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0032  hypothetical protein  33.33 
 
 		 287 aa  108  1e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0628  HAD family pyrimidine 5-nucleotidase  31.11 
 
 		 212 aa  106  3e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.821924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2256  pyrimidine 5-nucleotidase  33.52 
 
 		 241 aa  105  7e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0948171  hitchhiker  0.0000228381 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2986  pyrimidine 5'-nucleotidase  39.89 
 
 		 217 aa  104  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0234941  hitchhiker  0.000703738 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3395  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.97 
 
 		 281 aa  103  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3718  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.83 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0541  pyrimidine 5'-nucleotidase  32.8 
 
 		 233 aa  97.1  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0337  pyrimidine 5'-nucleotidase  29.58 
 
 		 267 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0063  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.09 
 
 		 252 aa  87.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.264362  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2483  pyrimidine 5-nucleotidase  31.22 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0380059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3097  pyrimidine 5'-nucleotidase  31.22 
 
 		 263 aa  87.4  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.143226  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3113  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.81 
 
 		 263 aa  86.7  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.735685 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3093  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.16 
 
 		 263 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.274131 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0159  HAD-superfamily hydrolase  30.16 
 
 		 267 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6448  HAD family hydrolase  29.63 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.895915  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2909  HAD-superfamily hydrolase  34.11 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.378471  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2180  HAD-superfamily hydrolase  34.11 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0184  HAD-superfamily hydrolase  34.11 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.610769  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0194  HAD-superfamily hydrolase  34.11 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3439  HAD-superfamily hydrolase  34.11 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3248  HAD-superfamily hydrolase  34.11 
 
 		 267 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.800899  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3144  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.27 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3006  pyrimidine 5'-nucleotidase  30.16 
 
 		 263 aa  79  0.00000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0500  hypothetical protein  30.32 
 
 		 243 aa  79  0.00000000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.354982 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4386  HAD family hydrolase  27.7 
 
 		 267 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_7521  predicted protein  31.46 
 
 		 212 aa  77.8  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0283312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2059  pyrimidine 5'-nucleotidase  24.31 
 
 		 214 aa  77.8  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.288048  normal  0.220082 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_18726  predicted protein  29.74 
 
 		 273 aa  69.7  0.00000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.245332 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_15835  predicted protein  28.57 
 
 		 190 aa  57.4  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0367369  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2794  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  31.46 
 
 		 210 aa  54.7  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0916243  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42723  predicted protein  25.87 
 
 		 202 aa  51.6  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1417  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.78 
 
 		 215 aa  49.7  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.49722e-26 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_9879  predicted protein  28.49 
 
 		 188 aa  48.5  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.753142  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3083  HAD family hydrolase  29.1 
 
 		 363 aa  46.6  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0384  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.82 
 
 		 226 aa  46.2  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.000618634  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2818  HAD-like hydrolase  32.06 
 
 		 240 aa  46.2  0.0005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.564979 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2332  HAD superfamily hydrolase  26.06 
 
 		 215 aa  43.5  0.003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000241683  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06325  pyrimidine 5'-nucleotidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G13470)  25.44 
 
 		 223 aa  42.7  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.882261  normal  0.0669048 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0976  HAD family hydrolase  25.93 
 
 		 198 aa  42.4  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1100  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.77 
 
 		 219 aa  42.7  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3898  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  24.64 
 
 		 233 aa  42  0.008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_84214  suppressor of deletion of TFIIS  22.92 
 
 		 287 aa  42  0.009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.538947  normal  0.0127046 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>