More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mboo_2102 on replicon NC_009712
Organism: Candidatus Methanoregula boonei 6A8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009712  Mboo_2102  signal transduction protein  100 
 
 		 292 aa  586  1e-166  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1922  signal transduction protein  70.65 
 
 		 293 aa  414  9.999999999999999e-116  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0054  putative signal transduction protein with CBS domains  66.67 
 
 		 292 aa  414  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2936  signal transduction protein  65.64 
 
 		 292 aa  389  1e-107  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.000000290592  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0640  hypothetical protein  58.22 
 
 		 292 aa  358  5e-98  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2165  hypothetical protein  45.8 
 
 		 291 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.758559  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1886  hypothetical protein  46.85 
 
 		 291 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0754  signal transduction protein  40.07 
 
 		 302 aa  226  4e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.284841  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1153  signal transduction protein  40.77 
 
 		 288 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1625  signal transduction protein  37.12 
 
 		 303 aa  207  2e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1049  signal transduction protein  36.45 
 
 		 303 aa  204  1e-51  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0897  signal transduction protein  36.79 
 
 		 303 aa  202  4e-51  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1067  signal transduction protein  36 
 
 		 303 aa  196  5.000000000000001e-49  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2115  signal transduction protein  34.13 
 
 		 300 aa  173  3.9999999999999995e-42  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.548765 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1085  putative signal transduction protein with CBS domains  33.77 
 
 		 300 aa  172  6.999999999999999e-42  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.971141  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0936  Protein of unknown function DUF293  46.55 
 
 		 177 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0850424  normal  0.275415 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2734  Protein of unknown function DUF293  45.35 
 
 		 177 aa  162  4.0000000000000004e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.645133 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2771  transcriptional regulator, TrmB  44.77 
 
 		 177 aa  160  2e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.129306  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2269  Protein of unknown function DUF293  45.35 
 
 		 177 aa  157  2e-37  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0304  Protein of unknown function DUF293  43.6 
 
 		 177 aa  153  4e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.480647  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4532  transcriptional regulator, TrmB  42.51 
 
 		 177 aa  150  2e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3672  Protein of unknown function DUF293  40 
 
 		 173 aa  131  1.0000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.829255  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1119  signal transduction protein  30.63 
 
 		 295 aa  128  1.0000000000000001e-28  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.700202 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0942  signal transduction protein  29.86 
 
 		 307 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1169  Protein of unknown function DUF293  34.55 
 
 		 176 aa  102  6e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.896672  normal  0.435827 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2105  Protein of unknown function DUF293  34.9 
 
 		 178 aa  97.4  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0300972  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1735  signal transduction protein  29.17 
 
 		 286 aa  92  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.281156  decreased coverage  0.000421461 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1555  signal transduction protein  30.21 
 
 		 286 aa  90.5  3e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0565  signal transduction protein  31.71 
 
 		 286 aa  89.4  7e-17  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.632057  hitchhiker  0.00109381 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2063  protein of unknown function UPF0074  34.72 
 
 		 194 aa  86.7  4e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3557  putative CBS domain and cyclic nucleotide-regulated nucleotidyltransferase  35.43 
 
 		 605 aa  81.6  0.00000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1742  signal transduction protein  27.87 
 
 		 286 aa  79.7  0.00000000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.12379 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2087  Polynucleotide adenylyltransferase region  34.71 
 
 		 877 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.625204 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2915  Chloride channel core  30.64 
 
 		 897 aa  74.3  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3428  Polynucleotide adenylyltransferase region  37.07 
 
 		 873 aa  74.3  0.000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000799776  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0069  signal transduction protein  32.05 
 
 		 158 aa  70.9  0.00000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0635  CBS domain-containing protein  31.62 
 
 		 432 aa  71.6  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00186716  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01920  Inosine monophosphate dehydrogenase-related protein  32.54 
 
 		 154 aa  68.2  0.0000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.778717  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0213  CBS domain-containing protein  35.96 
 
 		 863 aa  67  0.0000000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1695  CBS domain-containing protein  30.15 
 
 		 885 aa  66.2  0.0000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4216  Chloride channel core  32.54 
 
 		 863 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.298005 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4338  CBS domain-containing protein  25.56 
 
 		 618 aa  65.1  0.000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1725  signal-transduction protein  33.33 
 
 		 155 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.467768 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0978  hypothetical protein  35.87 
 
 		 364 aa  63.9  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0215  CBS domain-containing protein  33.82 
 
 		 863 aa  63.9  0.000000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0302  signal transduction protein  34.68 
 
 		 282 aa  63.2  0.000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.983478  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1131  polynucleotide adenylyltransferase region  30.43 
 
 		 907 aa  63.2  0.000000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00727527  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1763  putative PAS/PAC sensor protein  34.45 
 
 		 698 aa  62.8  0.000000007  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1913  putative sigma54 specific transcriptional regulator  33.65 
 
 		 710 aa  62.4  0.000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0899132  normal  0.0546689 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3006  PAS  32.52 
 
 		 1560 aa  61.6  0.00000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.755684 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2272  CBS domain-containing protein  31.93 
 
 		 384 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.29511 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1552  CBS domain-containing protein  32.2 
 
 		 378 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.651546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0506  CBS domain-containing protein  33.88 
 
 		 606 aa  61.2  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.413474  normal  0.25412 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0447  signal-transduction protein  29.91 
 
 		 145 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.285729  n/a   
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5334  Cl- channel voltage-gated family protein  33.93 
 
 		 863 aa  60.5  0.00000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.817477  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1352  Cl- channel, voltage gated  33.06 
 
 		 577 aa  60.5  0.00000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1294  CBS domain-containing protein  31.01 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.0268357 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0400  CBS domain-containing protein  35.29 
 
 		 378 aa  60.5  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0735736  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0878  CBS domain containing protein  33.33 
 
 		 880 aa  60.5  0.00000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3667  cyclic nucleotide-binding protein  29.38 
 
 		 606 aa  60.1  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.773951  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1113  signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 		 723 aa  59.7  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0575  signal transduction protein  36.27 
 
 		 606 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.513215  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2905  XRE family transcriptional regulator  32.79 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2228  cyclic nucleotide-binding protein  36.27 
 
 		 606 aa  59.7  0.00000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.480608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2009  CBS domain-containing protein  28.79 
 
 		 143 aa  60.1  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.416479  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1326  signal-transduction protein  32.67 
 
 		 144 aa  59.3  0.00000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0264  signal protein  31.9 
 
 		 614 aa  59.7  0.00000006  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0709  CBS domain containing protein  34.13 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1308  putative signal transduction protein with CBS domains  31.13 
 
 		 161 aa  59.3  0.00000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1487  sigma-L-dependent transcriptional regulator  32.04 
 
 		 696 aa  59.3  0.00000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1302  CBS domain containing protein  28.26 
 
 		 769 aa  58.9  0.00000009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0035  signal-transduction protein  30.58 
 
 		 138 aa  58.5  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000525301  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0283  putative signal-transduction protein with CBS domains  28.47 
 
 		 148 aa  58.5  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.974941  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0657  signal transduction protein  30.77 
 
 		 309 aa  58.5  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00784458  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1731  peptidase M50  27.8 
 
 		 366 aa  57.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0401  signal-transduction protein  28.03 
 
 		 302 aa  57.8  0.0000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1776  putative PAS/PAC sensor protein  30.91 
 
 		 698 aa  57.4  0.0000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0916  CBS domain-containing protein  29.41 
 
 		 225 aa  57  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0373364 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1420  polyA polymerase family protein  29.2 
 
 		 880 aa  57.4  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0185526  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2246  CBS domain-containing protein  31.78 
 
 		 875 aa  57.4  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1577  AcuB family protein  27.13 
 
 		 219 aa  57  0.0000004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4097  CBS domain-containing protein  26.38 
 
 		 643 aa  56.6  0.0000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0891  polynucleotide adenylyltransferase region  32.76 
 
 		 883 aa  56.6  0.0000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0304  signal transduction protein  34.78 
 
 		 261 aa  56.6  0.0000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123702  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4553  cyclic nucleotide-binding protein  32.77 
 
 		 603 aa  56.6  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.984926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0822  diguanylate cyclase  33.33 
 
 		 287 aa  56.2  0.0000006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0750  CBS domain containing protein  29.85 
 
 		 867 aa  56.2  0.0000006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.596795  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0243  signal transduction protein  27.15 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0768  CBS domain containing membrane protein  27.56 
 
 		 138 aa  55.8  0.0000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.838909  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0620  signal-transduction protein  30.69 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0684  polynucleotide adenylyltransferase region  30.51 
 
 		 877 aa  55.8  0.0000008  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1203  CBS domain-containing protein  26.81 
 
 		 873 aa  55.5  0.0000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.452152  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0767  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.89 
 
 		 675 aa  55.5  0.0000009  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000798179  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2162  Cl- channel, voltage gated  27.06 
 
 		 862 aa  55.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.30551 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06340  putative signal-transduction protein with CBS domains  26.32 
 
 		 141 aa  55.5  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000465197  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3436  Chloride channel core  31.76 
 
 		 879 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07150  CBS domain containing protein  27.66 
 
 		 865 aa  54.7  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0367477  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1578  PolyA polymerase family protein  30.65 
 
 		 880 aa  54.7  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.507141  normal  0.242793 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0303  signal transduction protein  28.33 
 
 		 320 aa  54.7  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.123815  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1421  CBS domain-containing protein  25.17 
 
 		 279 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.351959  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>