65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A3591 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A3591  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  266  8.999999999999999e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.157612  normal  0.0949488 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1788  RDD domain containing protein  33.81 
 
 		 187 aa  84.7  4e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0098202  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1706  RDD  36.76 
 
 		 170 aa  84.3  5e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.305495  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0171  RDD domain-containing protein  39.26 
 
 		 140 aa  83.2  0.000000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.0000000652856  decreased coverage  0.0096302 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1148  RDD domain containing protein  31.65 
 
 		 185 aa  80.5  0.000000000000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00101829  hitchhiker  0.000000000000525817 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0075  RDD domain-containing protein  31.82 
 
 		 185 aa  79.7  0.00000000000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0306278  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3457  RDD domain containing protein  37.59 
 
 		 205 aa  77.4  0.00000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.052067 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1364  RDD domain-containing protein  34.46 
 
 		 186 aa  77  0.00000000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000121263  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0277  RDD domain containing protein  33.09 
 
 		 217 aa  73.6  0.0000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.666159  normal  0.0986894 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0170  RDD domain-containing protein  36.43 
 
 		 145 aa  72  0.000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  decreased coverage  0.00000000534855  decreased coverage  0.00967799 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1213  RDD  38.55 
 
 		 176 aa  72.4  0.000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0799296  normal  0.0127909 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2608  RDD domain-containing protein  32.41 
 
 		 456 aa  68.6  0.00000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.107491 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1223  RDD domain containing protein  36.59 
 
 		 202 aa  64.7  0.0000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1340  serine/threonine protein kinase  34.88 
 
 		 536 aa  62  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.975368 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2289  RDD domain-containing protein  40.91 
 
 		 202 aa  61.6  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1489  RDD domain containing protein  29.1 
 
 		 155 aa  58.5  0.00000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.126204  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1499  RDD domain containing protein  28.57 
 
 		 174 aa  57.8  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.127102 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0409  RDD  27.78 
 
 		 231 aa  57.8  0.00000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3590  RDD domain containing protein  28.48 
 
 		 310 aa  57  0.00000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3843  RDD domain containing protein  28.12 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0628  hypothetical protein  26.57 
 
 		 154 aa  55.1  0.0000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0572979  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4958  RDD domain containing protein  28.46 
 
 		 231 aa  51.6  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000303152 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4809  RDD  29.86 
 
 		 261 aa  50.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000284972  normal  0.915687 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1602  hypothetical protein  28.15 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2609  serine/threonine protein kinase  30.53 
 
 		 415 aa  48.9  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.101255 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3069  RDD domain containing protein  35.37 
 
 		 150 aa  48.5  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4968  YxaI  39.44 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0115  hypothetical protein  28.19 
 
 		 157 aa  48.1  0.00004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.539233  hitchhiker  0.000011217 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5849  RDD domain-containing protein  25.58 
 
 		 316 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.273522 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4817  RDD domain containing protein  32.41 
 
 		 198 aa  46.6  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0355  hypothetical protein  34.74 
 
 		 198 aa  45.4  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1285  hypothetical protein  26.57 
 
 		 165 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2713  RDD domain containing protein  28.79 
 
 		 159 aa  46.2  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0396  RDD  34.94 
 
 		 196 aa  45.1  0.0003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.476249  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14520  hypothetical protein  25.87 
 
 		 165 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0643  RDD family protein  25.48 
 
 		 195 aa  44.3  0.0006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3574  RDD domain containing protein  26.15 
 
 		 255 aa  44.3  0.0006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.737424  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0891  RDD domain-containing protein  30.6 
 
 		 152 aa  43.9  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.98299 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4396  RDD  26.24 
 
 		 162 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.327978 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0234  RDD protein  37.5 
 
 		 141 aa  42.7  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1682  RDD domain containing protein  27.27 
 
 		 241 aa  43.5  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38330  hypothetical protein  28.46 
 
 		 242 aa  43.5  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4234  RDD domain-containing protein  34.43 
 
 		 162 aa  42.7  0.001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2416  hypothetical protein  26.52 
 
 		 270 aa  43.1  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4623  RDD domain-containing protein  33.33 
 
 		 169 aa  43.1  0.001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.846019 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0950  RDD protein  30.77 
 
 		 150 aa  43.1  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3524  RDD domain-containing protein  24.5 
 
 		 165 aa  42.7  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.352555 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3583  MJ0042 family finger-like protein  28.95 
 
 		 295 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.040814  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1128  RDD domain-containing protein  29.1 
 
 		 152 aa  42.4  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1175  RDD domain-containing protein  34.52 
 
 		 166 aa  42.4  0.002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1364  hypothetical protein  35.53 
 
 		 166 aa  42.7  0.002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.356558  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1021  RDD domain-containing protein  29.51 
 
 		 162 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.579963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1596  RDD domain-containing protein  23.31 
 
 		 258 aa  41.2  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3024  branched-chain amino acid aminotransferase I  23.91 
 
 		 167 aa  41.6  0.004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000160975 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0989  RDD domain-containing protein  29.51 
 
 		 162 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  decreased coverage  0.00320129  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0984  RDD domain containing protein  29.51 
 
 		 162 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1422  RDD domain-containing protein  26.39 
 
 		 257 aa  41.2  0.005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000176176  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8545  membrane protein/domain-like protein  33.33 
 
 		 175 aa  41.2  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1908  hypothetical protein  28.17 
 
 		 154 aa  41.2  0.005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4266  RDD domain-containing protein  23.91 
 
 		 274 aa  40.8  0.007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000560964  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1701  RDD domain containing protein  28.57 
 
 		 162 aa  40.4  0.007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000482282  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3447  RDD domain-containing protein  23.31 
 
 		 254 aa  40.4  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.492648 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3078  hypothetical protein  24.18 
 
 		 406 aa  40.4  0.009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0824  RDD domain containing protein  29.79 
 
 		 590 aa  40  0.01  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0333571  normal  0.0552944 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4021  RDD  26.19 
 
 		 241 aa  40  0.01  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.897049  normal  0.0584976 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>