88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mbar_A2122 on replicon NC_007355
Organism: Methanosarcina barkeri str. Fusaro



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007355  Mbar_A2122  hypothetical protein  100 
 
 		 72 aa  144  5e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00580753  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3688  hypothetical protein  60.56 
 
 		 76 aa  85.9  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148975  hitchhiker  0.00946321 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0554  hypothetical protein  59.42 
 
 		 69 aa  80.1  0.00000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1149  hypothetical protein  56.52 
 
 		 69 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0483  hypothetical protein  57.35 
 
 		 73 aa  77.4  0.00000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.243945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0248  hypothetical protein  62.5 
 
 		 64 aa  77.4  0.00000000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.209106  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0620  hypothetical protein  57.97 
 
 		 72 aa  75.9  0.0000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1176  protein of unknown function UPF0150  70 
 
 		 69 aa  72.8  0.000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0378  hypothetical protein  47.17 
 
 		 72 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0763711 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1874  hypothetical protein  52.63 
 
 		 108 aa  57.4  0.00000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3186  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 75 aa  57  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.234644  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1661  protein of unknown function UPF0150  50.98 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1099  protein of unknown function UPF0150  45.28 
 
 		 72 aa  55.8  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1679  protein of unknown function UPF0150  50.98 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.80579  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0398  hypothetical protein  46.15 
 
 		 71 aa  54.3  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.969866  normal  0.102699 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2778  hypothetical protein  48.98 
 
 		 72 aa  54.3  0.0000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2670  protein of unknown function UPF0150  46.38 
 
 		 69 aa  53.5  0.0000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.158684 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2648  hypothetical protein  40.91 
 
 		 82 aa  52.8  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3154  protein of unknown function UPF0150  45.45 
 
 		 68 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0271385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0567  hypothetical protein  46.43 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0099  hypothetical protein  44.12 
 
 		 74 aa  53.5  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.808751  normal  0.173804 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2942  protein of unknown function UPF0150  45.45 
 
 		 68 aa  53.5  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011727  PCC8801_4556  protein of unknown function UPF0150  44.93 
 
 		 78 aa  52  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1463  hypothetical protein  44.29 
 
 		 75 aa  51.2  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1504  hypothetical protein  44.29 
 
 		 72 aa  50.8  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00554822  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1511  hypothetical protein  44.29 
 
 		 72 aa  50.8  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1470  hypothetical protein  44.29 
 
 		 72 aa  50.8  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1441  protein of unknown function UPF0150  38.16 
 
 		 69 aa  50.8  0.000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0633487  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2487  protein of unknown function UPF0150  41.79 
 
 		 71 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3621  protein of unknown function UPF0150  41.79 
 
 		 71 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3515  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 79 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2602  protein of unknown function UPF0150  50 
 
 		 79 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2115  protein of unknown function UPF0150  43.4 
 
 		 68 aa  50.4  0.000008  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5735  protein of unknown function UPF0150  38.89 
 
 		 130 aa  50.1  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0400  hypothetical protein  50 
 
 		 74 aa  50.4  0.000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.908801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0046  hypothetical protein  40 
 
 		 130 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00000235341  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1740  hypothetical protein  46.81 
 
 		 66 aa  48.9  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0186698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0586  XRE family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 134 aa  48.5  0.00003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011721  PCC8801_4470  protein of unknown function UPF0150  49.09 
 
 		 68 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013167  Cyan8802_4633  protein of unknown function UPF0150  49.09 
 
 		 68 aa  48.9  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0670  hypothetical protein  42 
 
 		 78 aa  47.8  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.720771  normal  0.417071 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1245  hypothetical protein  50 
 
 		 67 aa  47.4  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1496  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.815263  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1469  protein of unknown function UPF0150  42.86 
 
 		 66 aa  47  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2667  hypothetical protein  39.29 
 
 		 132 aa  46.6  0.0001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  hitchhiker  0.0000207573  normal  0.619713 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0001  protein of unknown function UPF0150  47.83 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2095  hypothetical protein  36.54 
 
 		 134 aa  46.6  0.0001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.391448  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3342  hypothetical protein  33.33 
 
 		 131 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.589243  normal  0.0213598 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2242  hypothetical protein  36.84 
 
 		 69 aa  47  0.0001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4509  protein of unknown function UPF0150  43.4 
 
 		 67 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3237  protein of unknown function UPF0150  37.29 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2881  protein of unknown function UPF0150  37.29 
 
 		 67 aa  45.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0217093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0712  hypothetical protein  47.62 
 
 		 117 aa  44.7  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0338618 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2353  hypothetical protein  44.44 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0592921  normal  0.0104315 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0981  protein of unknown function UPF0150  38.03 
 
 		 73 aa  44.7  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000496376  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2363  hypothetical protein  44.44 
 
 		 72 aa  44.7  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.555585  normal  0.0574979 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1308  hypothetical protein  37.74 
 
 		 75 aa  44.3  0.0005  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0851  protein of unknown function UPF0150  42.55 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0717  hypothetical protein  50 
 
 		 57 aa  43.9  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.810179  normal  0.0354366 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0878  protein of unknown function UPF0150  42.55 
 
 		 72 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.336866  normal  0.426422 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4567  protein of unknown function UPF0150  40.35 
 
 		 67 aa  43.9  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.312088  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1725  protein of unknown function UPF0150  37.5 
 
 		 135 aa  43.9  0.0007  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2885  hypothetical protein  43.4 
 
 		 137 aa  43.9  0.0008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1998  hypothetical protein  33.33 
 
 		 138 aa  43.5  0.0009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0136867  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4921  hypothetical protein  40.35 
 
 		 71 aa  43.5  0.001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0136782  normal  0.0396825 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1684  hypothetical protein  37.93 
 
 		 133 aa  42.7  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.690218 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3872  protein of unknown function UPF0150  38.46 
 
 		 121 aa  42.7  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.663514 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4282  hypothetical protein  44.9 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.674146  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4380  protein of unknown function UPF0150  46.15 
 
 		 75 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.000000434558  unclonable  0.0000000015436 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3827  hypothetical protein  39.29 
 
 		 131 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.539898  normal  1 
 
 
-
 
NC_008790  CJJ81176_pTet0021  hypothetical protein  47.83 
 
 		 72 aa  42  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.317209  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1721  CopG family DNA-binding protein  28.05 
 
 		 119 aa  41.2  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.337055  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1361  transcriptional regulator, XRE family  41.3 
 
 		 147 aa  41.2  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00209269  hitchhiker  6.37946e-19 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2597  protein of unknown function UPF0150  40.74 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00102052  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1797  hypothetical protein  33.8 
 
 		 74 aa  41.2  0.005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4225  MerR family transcriptional regulator  44 
 
 		 212 aa  40.8  0.006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.676238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2675  protein of unknown function UPF0150  36.21 
 
 		 131 aa  40.8  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.295889  normal  0.250044 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0515  hypothetical protein  40.74 
 
 		 75 aa  41.2  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1396  hypothetical protein  38.89 
 
 		 137 aa  40.8  0.006  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000372603  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0455  protein of unknown function UPF0150  30.19 
 
 		 71 aa  40.8  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000544534  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2748  CopG family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 131 aa  40.8  0.007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0176  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0171  protein of unknown function UPF0150  40 
 
 		 72 aa  40.8  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.608923  normal  0.307175 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5077  CopG family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 134 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0452  hypothetical protein  43.4 
 
 		 70 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.332121  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1076  hypothetical protein  31.48 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.293636  normal  0.176904 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1407  hypothetical protein  28.57 
 
 		 131 aa  40.4  0.009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2770  hypothetical protein  39.13 
 
 		 145 aa  40  0.01  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.507789  normal  0.689762 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>