100 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_3462 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_3462  peptidase C39, bacteriocin processing  100 
 
 
261 aa  536  1e-151  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2175  peptidase C39, bacteriocin processing  46.41 
 
 
237 aa  190  2e-47  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.811326  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1020  peptidase C39 bacteriocin processing  45.18 
 
 
235 aa  185  5e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1155  peptidase C39, bacteriocin processing  44 
 
 
203 aa  177  1e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0445  putative signal peptide protein  45.21 
 
 
234 aa  176  5e-43  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.248925 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5392  peptidase C39, bacteriocin processing  45.64 
 
 
209 aa  174  9.999999999999999e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0260975  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3210  C39 family peptidase  41.23 
 
 
231 aa  173  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5873  peptidase (C39-family, bacteriocin processing)  45.1 
 
 
232 aa  174  1.9999999999999998e-42  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0336  peptidase C39 bacteriocin processing  41.82 
 
 
227 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.752621 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0321  peptidase C39 bacteriocin processing  41.36 
 
 
227 aa  169  5e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.337286  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2316  peptidase C39, bacteriocin processing  42 
 
 
223 aa  166  4e-40  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.543976  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0738  peptidase C39, bacteriocin processing  48.9 
 
 
234 aa  165  5.9999999999999996e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.772162  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03496  hypothetical protein  41.67 
 
 
225 aa  156  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2584  peptidase C39, bacteriocin processing  39.74 
 
 
251 aa  152  4e-36  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39250  putative double-glycine peptidase  44.91 
 
 
226 aa  139  3e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.050482  normal  0.369017 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2595  peptidase C39, bacteriocin processing  41.57 
 
 
226 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.369961 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2765  peptidase C39 bacteriocin processing  41.44 
 
 
226 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2855  hypothetical protein  42.22 
 
 
226 aa  133  3e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2834  peptidase C39, bacteriocin processing  41.67 
 
 
226 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.222444  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2926  peptidase C39 bacteriocin processing  42.22 
 
 
226 aa  132  5e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2967  peptidase C39, bacteriocin processing  39.01 
 
 
227 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3435  peptidase C39 bacteriocin processing  38.55 
 
 
238 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.254055  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3089  peptidase C39 bacteriocin processing  38.55 
 
 
238 aa  127  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4127  peptidase C39 bacteriocin processing  42.14 
 
 
235 aa  125  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000936066 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2446  peptidase C39 bacteriocin processing  34.57 
 
 
235 aa  120  3e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1024  putative peptidase  34.03 
 
 
237 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0531887  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0933  C39 family peptidase  37.41 
 
 
236 aa  118  9e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.212685  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2960  peptidase C39 bacteriocin processing  36.73 
 
 
237 aa  118  9e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0402092  normal  0.773236 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2422  peptidase C39 bacteriocin processing  33.94 
 
 
251 aa  113  3e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000506928  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_41780  hypothetical protein  39.74 
 
 
253 aa  113  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1801  peptidase C39, bacteriocin processing  35.12 
 
 
266 aa  112  5e-24  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3545  hypothetical protein  39.07 
 
 
253 aa  111  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.101815  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2536  peptidase C39, bacteriocin processing  38.16 
 
 
253 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.160882  hitchhiker  0.00642935 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2091  peptidase C39 bacteriocin processing  38.36 
 
 
234 aa  110  3e-23  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0732241 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0785  peptidase C39 bacteriocin processing  37.17 
 
 
427 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.297572  normal  0.031231 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3887  peptidase C39, bacteriocin processing  33.14 
 
 
244 aa  82.4  0.000000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.000193962  decreased coverage  0.00447347 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4701  ABC transporter related protein  32.03 
 
 
728 aa  62  0.00000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0115772  normal  0.281049 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3038  peptidase C39 bacteriocin processing  32.33 
 
 
209 aa  59.3  0.00000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.227483  normal  0.191518 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0425  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease, putative  26.88 
 
 
721 aa  56.6  0.0000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2265  ABC-type bacteriocin transporter  29.14 
 
 
727 aa  55.8  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4383  bacteriocin-processing peptidase  26.95 
 
 
1011 aa  55.1  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.443877  normal  0.0633498 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2680  cyclic nucleotide-binding protein  27.34 
 
 
906 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3424  cyclic nucleotide-binding protein  27.34 
 
 
906 aa  53.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1371  peptidase family protein  25.65 
 
 
197 aa  53.1  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0658  lactococcin g processing and transport ATP-binding protein  25.15 
 
 
760 aa  52.8  0.000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.357384  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4002  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  31.65 
 
 
1018 aa  52.4  0.000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3834  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  30.22 
 
 
1018 aa  51.6  0.00001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.823997 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0339  ABC transporter-like protein  28.16 
 
 
695 aa  51.2  0.00001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3040  ABC transporter related  30.37 
 
 
734 aa  52  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.638019 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4438  ABC transporter related  27.06 
 
 
723 aa  51.2  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.162884  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4071  ABC transporter related  26.9 
 
 
723 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0571162  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4552  ABC transporter related  27.06 
 
 
723 aa  50.8  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1082  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  28.17 
 
 
738 aa  50.4  0.00003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.706831  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3264  cyclic nucleotide-binding protein  30.08 
 
 
1038 aa  50.1  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0929  bacteriocin-processing peptidase  30.63 
 
 
1040 aa  50.1  0.00003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.247839  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0475  bacteriocin-processing peptidase  30.94 
 
 
1018 aa  50.4  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.977404  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0534  bacteriocin-processing peptidase  29.46 
 
 
727 aa  50.4  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0782715  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2857  cyclic nucleotide-binding protein  30.83 
 
 
1038 aa  50.1  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.590453  hitchhiker  0.00593059 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0625  bacteriocin-processing peptidase  26.62 
 
 
736 aa  49.7  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275381  normal  0.0105564 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2230  hypothetical protein  25.69 
 
 
715 aa  49.7  0.00005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3519  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  32.33 
 
 
1019 aa  49.3  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2150  peptidase C39, bacteriocin processing  29.85 
 
 
186 aa  49.3  0.00006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.649783  normal  0.0669823 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1271  ABC transporter related  27.92 
 
 
737 aa  48.9  0.00009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1761  ABC transporter related  28.8 
 
 
1675 aa  48.9  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.743128 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0055  peptidase family protein  24.82 
 
 
198 aa  48.5  0.0001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2175  ABC transporter related  26.11 
 
 
699 aa  48.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0474  ABC transporter related  27.86 
 
 
695 aa  47.4  0.0002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0068  peptidase family protein  25 
 
 
199 aa  47.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0167  ABC-type bacteriocin transporter family protein  28.68 
 
 
739 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2946  ABC transporter related  28.36 
 
 
732 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.912238  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0225  bacteriocin-processing peptidase  25.93 
 
 
908 aa  47.4  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2431  bacteriocin ABC transporter, ATP-binding/permease protein, putative  22.75 
 
 
759 aa  46.6  0.0004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4795  ABC transporter related  27.34 
 
 
741 aa  46.6  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.112132  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0049  toxin secretion ABC transporter, ATP-binding subunit/permease protein, putative  23.95 
 
 
725 aa  46.2  0.0006  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.41671  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0958  peptidase C39 bacteriocin processing  24.81 
 
 
164 aa  45.8  0.0006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000835793  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4874  ABC transporter related  26.62 
 
 
714 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.850711  normal  0.288804 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1133  bacteriocin-processing peptidase  25 
 
 
714 aa  45.8  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.156219  normal  0.573302 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4910  ABC transporter related  32.14 
 
 
738 aa  45.8  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.948579  normal  0.144734 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1164  ABC transporter related  28.46 
 
 
716 aa  45.8  0.0008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.589518  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0637  hypothetical protein  23.89 
 
 
188 aa  45.4  0.0008  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.323019  normal  0.918011 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3057  ABC transporter related  34.83 
 
 
683 aa  45.8  0.0008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.696223  normal  0.0570299 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4229  ABC transporter related protein  26.47 
 
 
726 aa  45.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2167  ABC transporter related  28.17 
 
 
696 aa  44.7  0.001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0837291  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1399  ABC transporter related  24.84 
 
 
521 aa  45.1  0.001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000528778  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl264  putative multidrug ABC transporter  24.06 
 
 
608 aa  44.3  0.002  Mesoplasma florum L1  Bacteria  decreased coverage  4.04334e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0327  ABC-type bacteriocin transporter  26.28 
 
 
734 aa  44.7  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5839  ABC transporter related protein  28.03 
 
 
743 aa  44.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.348328 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0251  ABC-type bacteriocin transporter  26.28 
 
 
734 aa  44.3  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000911417  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8163  ABC transporter related  28.06 
 
 
767 aa  43.9  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2398  bacteriocin-processing peptidase  28.91 
 
 
716 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0391365  hitchhiker  0.0000309205 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0410  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporter  27.56 
 
 
908 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1129  ABC transporter, transmembrane region  28.57 
 
 
748 aa  43.9  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00231099  normal  0.125208 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04477  colicin V secretion/processing ATP-binding protein CvaB/putative ABC transporter protein required for AvrXa21 activity B (raxB)  25.45 
 
 
719 aa  43.9  0.003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.265194  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2878  peptidase C39, bacteriocin processing  27.81 
 
 
297 aa  43.5  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0648351  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1828  ABC transporter related  44.23 
 
 
738 aa  43.5  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0155639  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0728  cyclic nucleotide-regulated ABC bacteriocin/lantibiotic exporters  27.61 
 
 
1013 aa  43.1  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.637206  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0939  ABC transporter related  23.68 
 
 
721 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000202507  normal  0.210316 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5250  ABC transporter related  22.16 
 
 
802 aa  42.7  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0112  ABC transporter related  27.61 
 
 
727 aa  42.7  0.006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1838  antibiotic ABC transporter permease  28.48 
 
 
706 aa  42  0.01  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.804625  normal  0.506284 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>