More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maqu_0696 on replicon NC_008740
Organism: Marinobacter aquaeolei VT8



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008740  Maqu_0696  peptidase M23B  100 
 
 
459 aa  942    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.000424266  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3928  peptidase M23B  42.74 
 
 
475 aa  379  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  decreased coverage  0.0000103245  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0607  peptidase, M23/M37 family  42.45 
 
 
474 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0513451  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5099  peptidase M23B  42.99 
 
 
503 aa  370  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000186305  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4566  peptidase M23B  41.76 
 
 
475 aa  366  1e-100  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00491492  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0808  hypothetical protein  41.72 
 
 
468 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0111068  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0465  peptidase M23B  41.23 
 
 
473 aa  359  5e-98  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494323  normal  0.161916 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08540  hypothetical protein  42.47 
 
 
447 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000156584  decreased coverage  0.00000000118926 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4768  peptidase M23B  40.79 
 
 
472 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.000000282967  normal  0.90661 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0435  M24/M37 family peptidase  40.31 
 
 
475 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.269158  normal  0.0460462 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0468  peptidase M23B  40.31 
 
 
473 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.000910103  hitchhiker  0.00126388 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1087  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  42.73 
 
 
460 aa  350  4e-95  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00818194  normal  0.118313 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0910  peptidase M23B  46.63 
 
 
479 aa  344  2e-93  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.217217  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2406  Peptidase M23  47.03 
 
 
517 aa  342  5.999999999999999e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000297595  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0437  peptidase M23B  46.61 
 
 
513 aa  340  2e-92  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.000637591  normal  0.0934933 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_46000  metallopeptidase  40.3 
 
 
480 aa  337  1.9999999999999998e-91  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.064748  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1070  peptidase M23B  37.86 
 
 
470 aa  318  9e-86  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.000663159  hitchhiker  0.00472125 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0994  peptidase M23B  37.55 
 
 
470 aa  315  9e-85  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000818534  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4726  M24/M37 family peptidase  37.15 
 
 
498 aa  310  2.9999999999999997e-83  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2139  Peptidase M23  39.29 
 
 
490 aa  307  3e-82  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.00671131  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01618  Peptidase, M23/M37 family protein  39.83 
 
 
441 aa  305  9.000000000000001e-82  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1211  peptidase M23B  37.42 
 
 
475 aa  293  5e-78  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0168861  normal  0.0255188 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0849  M24/M37 family peptidase  37.47 
 
 
462 aa  292  1e-77  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0168749  normal  0.445111 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3506  peptidase M23B  37.27 
 
 
741 aa  290  3e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.00000124744  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1021  peptidase M23B  35.96 
 
 
491 aa  290  4e-77  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.000137565  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1314  M24/M37 family peptidase  35.28 
 
 
482 aa  288  1e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3144  Peptidase M23  34.81 
 
 
468 aa  288  1e-76  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0015226  normal  0.847017 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2568  putative membrane associated peptidase  39.84 
 
 
436 aa  288  2e-76  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0102631  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1246  peptidase M23B  35.31 
 
 
468 aa  287  2.9999999999999996e-76  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00321659  normal  0.121883 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2881  peptidase M23B  36.12 
 
 
466 aa  286  4e-76  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000532238  hitchhiker  0.00000791404 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3059  peptidase M23B  35.83 
 
 
466 aa  286  7e-76  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.000000244164  normal  0.0231551 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1169  peptidase M23B  34.39 
 
 
468 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.000504545  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1127  peptidase M23B  35 
 
 
468 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000608337  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2963  peptidase M23B  35.42 
 
 
491 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00002101  normal  0.0112469 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1103  peptidase M23B  36.17 
 
 
475 aa  281  1e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.123313 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1213  peptidase M23B  34.18 
 
 
468 aa  281  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0214324  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0877  peptidase M23B  40.85 
 
 
503 aa  277  3e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0472829  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2811  peptidase M23B  33.96 
 
 
472 aa  276  4e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000654378  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0458  peptidase family protein  37.85 
 
 
438 aa  272  7e-72  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0151813  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2972  peptidase M23B  39.04 
 
 
512 aa  272  1e-71  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000246824  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0299  Peptidase M23  42.12 
 
 
490 aa  270  2.9999999999999997e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0751276  normal  0.0202035 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0063  peptidase M23B  39.82 
 
 
448 aa  268  1e-70  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000736446  normal  0.441172 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0627  hypothetical protein  34.02 
 
 
477 aa  264  3e-69  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03413  hypothetical protein  39.58 
 
 
429 aa  261  1e-68  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02939  membrane-bound metalloendopeptidase  40.62 
 
 
472 aa  261  2e-68  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0513  peptidase M23B  37.56 
 
 
439 aa  260  3e-68  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.842896  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0610  hypothetical protein  33.5 
 
 
477 aa  259  6e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002595  membrane protein  41.03 
 
 
353 aa  258  1e-67  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0000185495  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0159  hypothetical protein  32.74 
 
 
433 aa  254  2.0000000000000002e-66  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000424474  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0141  metallopeptidase  38.27 
 
 
471 aa  252  8.000000000000001e-66  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.000148736  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0124  peptidase M23  38.27 
 
 
471 aa  252  1e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.000771684  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1920  peptidoglycan-specific endopeptidase, M23 family  36.68 
 
 
452 aa  247  3e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0283385  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0270  M23 peptidase domain-containing protein  36.68 
 
 
423 aa  246  4e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00486213  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1236  Peptidase M23  39.66 
 
 
441 aa  242  1e-62  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.747064  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0172  Peptidase M23  34.94 
 
 
465 aa  238  1e-61  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0593266  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2472  metalloendopeptidase-like membrane protein  38.62 
 
 
441 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000271454  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0554  peptidase M23B  34.71 
 
 
457 aa  231  2e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0864407  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0008  peptidase M23B  43.4 
 
 
417 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2080  Peptidase M23  38.51 
 
 
441 aa  231  3e-59  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0352  peptidase M23B  37.65 
 
 
430 aa  230  4e-59  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0505  peptidase M23B  36.72 
 
 
465 aa  228  1e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4107  peptidase M23B  36.34 
 
 
457 aa  227  3e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5906  peptidase M23B  37.44 
 
 
464 aa  227  4e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0727  peptidase M23B  34.53 
 
 
465 aa  226  6e-58  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3446  peptidase M23B  39.22 
 
 
464 aa  223  6e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0198039 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2030  Peptidase M23  36.67 
 
 
470 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0656  peptidase M23B  35.97 
 
 
490 aa  218  2e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.45264  normal  0.700073 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4673  Peptidase M23  36.81 
 
 
446 aa  213  3.9999999999999995e-54  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3784  M24/M37 family peptidase  37.87 
 
 
439 aa  212  1e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0002  Peptidase M23  40.08 
 
 
523 aa  211  2e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2632  peptidase M23B  32.35 
 
 
418 aa  211  2e-53  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.252347  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2504  peptidase M23B  29.64 
 
 
423 aa  210  3e-53  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.331029  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0416  peptidase M23B  35.05 
 
 
464 aa  211  3e-53  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.749321  normal  0.0708981 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3151  hypothetical protein  35.15 
 
 
460 aa  208  1e-52  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.696817  hitchhiker  0.00198036 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2644  peptidase M23B  34.6 
 
 
462 aa  207  2e-52  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.107778  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2450  peptidase M23B  30.82 
 
 
428 aa  207  2e-52  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1597  Peptidase M23  45.64 
 
 
435 aa  207  3e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2136  Peptidase M23  33.16 
 
 
437 aa  206  7e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1590  peptidase M23B  33.99 
 
 
424 aa  206  9e-52  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0596835  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06306  peptidase  36.77 
 
 
439 aa  205  1e-51  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0475  peptidase M23B  33.7 
 
 
464 aa  205  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0764227  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1134  peptidase M23B  32.71 
 
 
550 aa  204  3e-51  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000017693  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3059  peptidase M23B  36.13 
 
 
438 aa  203  6e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00145951  normal  0.0144005 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0060  hypothetical protein  36.69 
 
 
430 aa  202  8e-51  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  5.86289e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2610  peptidase M23B  32.52 
 
 
431 aa  201  1.9999999999999998e-50  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.326466  hitchhiker  0.000000038042 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2448  peptidase M23B  32.52 
 
 
431 aa  200  3e-50  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.093884  hitchhiker  0.000000000665253 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2518  peptidase M23B  32.52 
 
 
431 aa  200  3e-50  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0290484  unclonable  0.0000200771 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1754  peptidase M23B  32.11 
 
 
569 aa  201  3e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.598264 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6410  peptidase M23B  33.42 
 
 
491 aa  200  5e-50  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.101162  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2455  peptidase M23B  32.65 
 
 
418 aa  199  7e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0186992  unclonable  0.00000341195 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2540  peptidase M23B  37.87 
 
 
429 aa  199  7e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.169428  normal  0.74545 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2702  Peptidase M23  30.73 
 
 
433 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000811311  hitchhiker  0.0000822209 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1641  peptidase M23B  30.73 
 
 
433 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000435092  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1678  peptidase M23B  30.73 
 
 
433 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0411923  normal  0.669465 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1533  peptidase M23B  30.73 
 
 
431 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00239746  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001428  cell wall endopeptidase family M23/M37  35.65 
 
 
404 aa  197  5.000000000000001e-49  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.0015397  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2842  M24/M37 family peptidase  30.07 
 
 
434 aa  196  6e-49  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1656  peptidase M23B  30.73 
 
 
433 aa  196  6e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000516182  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2732  Peptidase M23  36.6 
 
 
440 aa  196  9e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.169167  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2638  Peptidase M23  36.6 
 
 
440 aa  196  9e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.388995  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>