62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_01781 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_01781  peptidase S41  100 
 
 		 555 aa  1137    Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00400716  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0479  peptidase S41  51.77 
 
 		 471 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1752  hypothetical protein  52.33 
 
 		 530 aa  487  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.000000597374  hitchhiker  0.00277538 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4634  peptidase S41  48.34 
 
 		 533 aa  475  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0592  peptidase S41  47.53 
 
 		 529 aa  473  1e-132  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2716  peptidase S41  47.72 
 
 		 522 aa  465  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000585076 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3287  peptidase S41  48.94 
 
 		 538 aa  463  1e-129  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.710782  hitchhiker  0.000000281065 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02497  hypothetical protein  46.63 
 
 		 566 aa  447  1.0000000000000001e-124  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2977  peptidase S41  47.87 
 
 		 507 aa  417  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0745194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003677  carboxyl-terminal protease  46.79 
 
 		 530 aa  413  1e-114  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0151  peptidase S41  43.98 
 
 		 530 aa  374  1e-102  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.624429  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3023  peptidase S41  35.54 
 
 		 440 aa  235  2.0000000000000002e-60  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2755  peptidase S41  27.66 
 
 		 488 aa  120  4.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.960698  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09693  hypothetical protein  32.18 
 
 		 485 aa  120  7.999999999999999e-26  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.185647  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2144  peptidase S41  28.54 
 
 		 492 aa  116  8.999999999999998e-25  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.0000194647  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7210  peptidase S41  27.77 
 
 		 496 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.267039  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0093  peptidase S41  29.33 
 
 		 490 aa  101  4e-20  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5878  peptidase S41  25.73 
 
 		 494 aa  97.4  6e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.304835 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1888  peptidase S41  28.98 
 
 		 494 aa  97.1  8e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.389553 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1456  peptidase S41  26.7 
 
 		 518 aa  94.4  5e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3853  peptidase S41  23.83 
 
 		 450 aa  85.5  0.000000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.221065  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3009  peptidase S41  27.94 
 
 		 527 aa  85.5  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.237965 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1696  peptidase S41  25.78 
 
 		 481 aa  84.7  0.000000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.848704  normal  0.058079 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3599  peptidase S41  25.95 
 
 		 406 aa  82.8  0.00000000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000173984  hitchhiker  0.00002714 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1719  peptidase S41  25.08 
 
 		 460 aa  75.1  0.000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3420  peptidase S41  25.44 
 
 		 463 aa  68.2  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000174493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0180  carboxyl-terminal protease  27.23 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.941197  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0182  carboxyl-terminal protease  27.23 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0641627  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0923  carboxyl-terminal protease  27.91 
 
 		 434 aa  56.2  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2330  C-terminal processing peptidase-2  28.3 
 
 		 407 aa  55.1  0.000003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.436353 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_03601  carboxyl-terminal protease  22.79 
 
 		 436 aa  54.7  0.000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0484  carboxyl-terminal protease  27.37 
 
 		 394 aa  53.1  0.00001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.165712  normal  0.591876 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1589  carboxyl-terminal protease  27.67 
 
 		 458 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1614  carboxyl-terminal protease  27.67 
 
 		 458 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2346  carboxyl-terminal protease  28.03 
 
 		 409 aa  51.2  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0299  C-terminal processing peptidase-2  28.99 
 
 		 431 aa  50.8  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2340  carboxyl-terminal protease  25.94 
 
 		 472 aa  50.4  0.00009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000278022  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0224  carboxyl-terminal protease  24.67 
 
 		 401 aa  50.4  0.00009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000279933  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1798  carboxyl-terminal protease  23.32 
 
 		 397 aa  48.9  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0604  carboxyl-terminal protease  26.19 
 
 		 440 aa  48.9  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21861  carboxyl-terminal protease  25.4 
 
 		 446 aa  48.9  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.43703 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1850  peptidase S41A, C-terminal protease  23.77 
 
 		 429 aa  48.9  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.333848  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04161  carboxyl-terminal protease  25.17 
 
 		 457 aa  48.1  0.0004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.63143 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2193  carboxyl-terminal protease  27.04 
 
 		 476 aa  47.8  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000308451  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0287  carboxyl-terminal protease  28 
 
 		 427 aa  47.8  0.0006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1722  carboxyl-terminal protease  23.99 
 
 		 560 aa  47.8  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000358148  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4514  carboxyl-terminal protease  27.81 
 
 		 447 aa  47.4  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00000295237  normal  0.684404 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1732  C-terminal processing peptidase  23.97 
 
 		 497 aa  47  0.0008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1403  carboxyl-terminal protease  24.64 
 
 		 555 aa  46.6  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1701  carboxyl-terminal protease  25.14 
 
 		 436 aa  47  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6540  carboxyl-terminal protease  27.94 
 
 		 535 aa  45.8  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.114224  normal  0.688204 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4584  carboxyl-terminal protease  26.95 
 
 		 401 aa  45.8  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.524838 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3471  carboxyl-terminal protease  24.82 
 
 		 710 aa  45.8  0.002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.723449  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2991  carboxyl-terminal protease  24.4 
 
 		 446 aa  45.4  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0813  peptidase S41A, C-terminal protease  22.39 
 
 		 551 aa  44.7  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.338188  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0838  Periplasmic protease-like protein  28.57 
 
 		 452 aa  44.3  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0516  C-terminal processing peptidase-2  23.01 
 
 		 440 aa  44.3  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.484387  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3850  carboxyl-terminal protease  24.59 
 
 		 550 aa  44.3  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.614434  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0290  carboxyl-terminal protease  24.35 
 
 		 488 aa  44.3  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1479  carboxyl-terminal protease  29.82 
 
 		 449 aa  44.3  0.007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.613425 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1268  carboxyl-terminal protease  26.01 
 
 		 423 aa  43.9  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1544  carboxy-terminal protease  32.61 
 
 		 672 aa  44.3  0.007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>