More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2069 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2069  major facilitator superfamily permease  100 
 
 
440 aa  856  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1077  major facilitator superfamily permease  46.94 
 
 
444 aa  387  1e-106  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0782  putative transmembrane efflux protein  42.66 
 
 
470 aa  308  1e-82  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  7.00007e-06 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0947  major facilitator transporter  43.36 
 
 
483 aa  301  2e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.289424  normal  0.783186 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2443  major facilitator transporter  39.56 
 
 
481 aa  288  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5012  major facilitator transporter  37.26 
 
 
490 aa  231  2e-59  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.675946  normal  0.0652477 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6210  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.97 
 
 
508 aa  194  2e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.208526 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7577  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.31 
 
 
487 aa  194  2e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7966  major facilitator superfamily MFS_1  34.05 
 
 
487 aa  194  3e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3979  EmrB/QacA family drug resistance transporter  33.73 
 
 
527 aa  191  3e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0756  permease of the major facilitator superfamily  30.62 
 
 
497 aa  189  1e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4781  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.44 
 
 
487 aa  184  3e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.31571 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.13 
 
 
522 aa  183  4e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS03124  transmembrane efflux transmembrane protein  30.59 
 
 
467 aa  180  4e-44  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1705  major facilitator superfamily MFS_1  33.02 
 
 
733 aa  180  4e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1704  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.41 
 
 
757 aa  179  1e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3343  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.66 
 
 
534 aa  177  3e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.953855 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3303  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.22 
 
 
498 aa  175  1e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.213054  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1130  major facilitator superfamily MFS_1  31.87 
 
 
491 aa  174  2e-42  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0346  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.41 
 
 
490 aa  175  2e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.149604 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0731  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.21 
 
 
763 aa  173  5e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.164946  normal  0.060075 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2996  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.04 
 
 
478 aa  171  3e-41  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.015101  decreased coverage  6.83759e-05 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4349  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.22 
 
 
493 aa  169  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0255  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.85 
 
 
487 aa  169  9e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.717354 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2370  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.06 
 
 
520 aa  169  1e-40  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236919  normal  0.7616 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5182  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.29 
 
 
488 aa  167  3e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_26870  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.22 
 
 
534 aa  167  3e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.287743  normal  0.830336 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3005  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.3 
 
 
512 aa  166  6e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.216237  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2307  major facilitator superfamily transporter  31.19 
 
 
508 aa  164  2e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.018174  normal  0.0567456 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0952  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.24 
 
 
540 aa  165  2e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.05909  normal  0.0418926 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3177  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.05 
 
 
519 aa  163  5e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.706315  hitchhiker  0.000232213 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4046  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.2 
 
 
543 aa  163  6e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.92 
 
 
479 aa  163  7e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.384361 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3139  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  27.05 
 
 
504 aa  162  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7424  major facilitator superfamily MFS_1  31.76 
 
 
494 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2254  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.78 
 
 
507 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0213589 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2717  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.97 
 
 
509 aa  160  4e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00105313 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5562  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.76 
 
 
493 aa  159  9e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7473  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.12 
 
 
514 aa  159  1e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5573  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.36 
 
 
474 aa  157  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0402  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.33 
 
 
509 aa  158  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.15496  normal  0.237492 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8828  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.06 
 
 
458 aa  158  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00337993  hitchhiker  0.00204639 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2058  major facilitator transporter  32.22 
 
 
529 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.283059  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2075  major facilitator transporter  32.22 
 
 
529 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0542399  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2121  major facilitator superfamily transporter  32.22 
 
 
529 aa  157  4e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.360369  normal  0.0488476 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4824  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.72 
 
 
519 aa  157  4e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2306  major facilitator superfamily transporter  31.63 
 
 
543 aa  156  6e-37  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0864673  normal  0.0994822 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00880  sugar phosphate permease  29.02 
 
 
458 aa  156  6e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4704  major facilitator superfamily MFS_1  30.61 
 
 
478 aa  156  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.391324  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0141  major facilitator superfamily MFS_1  29.85 
 
 
511 aa  156  8e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37915  major facilitator transporter  30.71 
 
 
471 aa  156  9e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000756673  normal  0.0508172 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17950  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.51 
 
 
521 aa  155  1e-36  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0956578  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3502  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.58 
 
 
474 aa  155  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3496  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.67 
 
 
482 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.152282  normal  0.192769 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1829  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.2 
 
 
522 aa  154  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1486  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.13 
 
 
482 aa  154  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.527824  normal  0.420653 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1888  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.29 
 
 
505 aa  155  2e-36  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.170605  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4568  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  32.67 
 
 
482 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.411532 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4328  major facilitator transporter  32.94 
 
 
482 aa  153  6e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.192705  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3916  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.16 
 
 
534 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.371671  normal  0.0821497 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2144  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.19 
 
 
520 aa  152  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.434739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1042  putative membrane transport protein  31.07 
 
 
498 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.010302  normal  0.0110823 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4492  EmrB/QacA family drug resistance transporter  31.98 
 
 
487 aa  151  2e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.44231  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0971  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.14 
 
 
475 aa  151  3e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4015  major facilitator superfamily MFS_1  29.16 
 
 
492 aa  151  3e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4425  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.62 
 
 
788 aa  150  4e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0371338  normal  0.193177 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4014  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.89 
 
 
504 aa  150  4e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.223084 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0906  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.24 
 
 
510 aa  150  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.431531  normal  0.0779201 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0209  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  30.15 
 
 
524 aa  150  6e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8291  major facilitator superfamily MFS_1  26.73 
 
 
480 aa  149  7e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4582  EmrB/QacA family drug resistance transporter  29.01 
 
 
452 aa  149  7e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1038  major facilitator superfamily MFS_1  33.01 
 
 
506 aa  149  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.531658 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1215  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.63 
 
 
553 aa  149  7e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.117259 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1633  major facilitator superfamily MFS_1  27.16 
 
 
503 aa  149  8e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0865478  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3686  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  28.99 
 
 
546 aa  149  8e-35  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.455316 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4632  putative transmembrane efflux protein  30.27 
 
 
475 aa  149  8e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0926  EmrB/QacA subfamily drug resistance transporter  28.96 
 
 
522 aa  148  2e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0678644  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6960  EmrB/QacA family drug resistance transporter  26.16 
 
 
528 aa  148  2e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148929  normal  0.0874374 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0790  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.07 
 
 
541 aa  148  2e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.004165  hitchhiker  0.00652278 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3935  EmrB/QacA family drug resistance transporter  32.92 
 
 
479 aa  148  2e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000976381 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0587  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.34 
 
 
469 aa  148  2e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.211687 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4556  major facilitator superfamily MFS_1  33.13 
 
 
494 aa  148  2e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4552  putative transmembrane efflux protein  30.32 
 
 
454 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.739035  normal  0.395452 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  28.89 
 
 
532 aa  147  3e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.95287  normal  0.532549 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8045  major facilitator superfamily MFS_1  27.38 
 
 
507 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.440862  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2757  EmrB/QacA family drug resistance transporter  30.46 
 
 
500 aa  147  3e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2081  major facilitator transporter  29.3 
 
 
528 aa  147  4e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0312  major facilitator superfamily MFS_1  29.53 
 
 
485 aa  147  4e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.116628 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17940  arabinose efflux permease family protein  27.21 
 
 
457 aa  146  6e-34  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0499  major facilitator superfamily MFS_1  28.73 
 
 
465 aa  146  7e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1696  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  29.55 
 
 
534 aa  146  9e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.218803  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8208  putative major facilitator superfamily (MFS) transporter  33.58 
 
 
463 aa  145  1e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1336  major facilitator superfamily multidrug efflux transporter  30.35 
 
 
469 aa  145  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0279  major facilitator superfamily MFS_1  28.13 
 
 
463 aa  145  1e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12861  integral membrane efflux protein efpA  31.99 
 
 
530 aa  144  2e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0945731  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7047  putative transmembrane efflux protein  29.66 
 
 
492 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0500177  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0603  drug resistance transporter, EmrB/QacA subfamily  31.23 
 
 
498 aa  144  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4837  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.68 
 
 
478 aa  144  3e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.179905 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2221  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.85 
 
 
609 aa  144  3e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.667625  normal  0.81194 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4542  EmrB/QacA family drug resistance transporter  27.68 
 
 
484 aa  144  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.717772 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>