More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_17610 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_17610  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  100 
 
 
250 aa  506  9.999999999999999e-143  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  decreased coverage  0.00262944  normal  0.585837 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2643  ABC transporter related protein  48.39 
 
 
245 aa  200  1.9999999999999998e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.189012  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2319  ABC transporter related  48.42 
 
 
245 aa  198  7.999999999999999e-50  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2760  ABC transporter related  48.22 
 
 
269 aa  188  7e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.335106  hitchhiker  0.0095726 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0692  ABC transporter related  47.75 
 
 
252 aa  188  8e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7746  ABC transporter related protein  46.95 
 
 
266 aa  185  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.128918  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2588  ABC transporter related  48.13 
 
 
247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0206492  hitchhiker  0.00398644 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3716  ABC transporter related protein  45.79 
 
 
244 aa  182  4.0000000000000006e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2271  ABC transporter related  42.66 
 
 
258 aa  180  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000137949 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4473  ABC transporter related protein  40.56 
 
 
291 aa  176  2e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.204662  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1552  ABC transporter-related protein  46.46 
 
 
221 aa  176  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0090  ABC transporter related protein  43.78 
 
 
243 aa  176  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.197502  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4185  ABC transporter related  47.22 
 
 
258 aa  177  2e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.348554 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_21930  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  46.46 
 
 
280 aa  176  3e-43  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.17909  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4608  ABC transporter related protein  50 
 
 
249 aa  176  3e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.310251  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4480  ABC transporter related protein  40.34 
 
 
256 aa  176  3e-43  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.269764  normal  0.77881 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0970  ABC transporter, ATPase subunit  42.79 
 
 
240 aa  176  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.253892 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2234  ABC transporter related  41.56 
 
 
255 aa  175  7e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.184169  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2697  ABC transporter related  47.21 
 
 
279 aa  175  8e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.136885  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2719  ABC transporter related protein  43.88 
 
 
255 aa  174  9.999999999999999e-43  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0950  ABC transporter-like protein  46 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.256342  normal  0.361687 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3961  ABC transporter related  39.27 
 
 
255 aa  173  1.9999999999999998e-42  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.538851  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2351  ABC transporter related  41.13 
 
 
255 aa  172  5e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.234031  normal  0.139824 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1745  efflux ABC transporter, lipoprotein translocase (LPT) family, ATP-binding protein  41.67 
 
 
256 aa  172  5.999999999999999e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.357481 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1576  ABC transporter related  40.64 
 
 
223 aa  172  5.999999999999999e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0223  ABC transporter related  44.5 
 
 
225 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0225  ABC transporter related  44.5 
 
 
225 aa  171  7.999999999999999e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8290  ABC transporter related  43.32 
 
 
253 aa  171  9e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0396  ABC transporter related protein  43.5 
 
 
262 aa  171  1e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0709854  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4659  ABC transporter related protein  46.33 
 
 
241 aa  171  1e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  41.95 
 
 
653 aa  170  2e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2457  ABC transporter related protein  49.53 
 
 
247 aa  170  2e-41  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0887865  hitchhiker  0.00000290657 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1516  ABC transporter related  41.12 
 
 
230 aa  169  3e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1847  peptide ABC transporter ATPase  38.25 
 
 
252 aa  169  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.838866  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0849  ABC transporter related protein  48.5 
 
 
271 aa  169  4e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.235229  normal  0.0970289 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20470  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  42.24 
 
 
245 aa  169  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0202995  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0335  ABC transporter related  41.44 
 
 
248 aa  169  5e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000938347 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4457  ABC transporter related  42.72 
 
 
253 aa  168  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_32340  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  41.47 
 
 
264 aa  168  8e-41  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.442827 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0458  ABC transporter related  44.44 
 
 
288 aa  167  2e-40  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186138  normal  0.029508 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2759  ABC transporter related  46.7 
 
 
256 aa  167  2e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.000159269  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1885  ABC transporter related protein  42.13 
 
 
247 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  0.0695851 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4405  ABC transporter related  45.54 
 
 
224 aa  166  2.9999999999999998e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  hitchhiker  0.00499909  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  42.58 
 
 
657 aa  166  2.9999999999999998e-40  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2118  ABC transporter related  40.74 
 
 
259 aa  166  2.9999999999999998e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.36781  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5675  ABC transporter related  39.92 
 
 
250 aa  166  2.9999999999999998e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.216475  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0848  ABC transporter related  42.34 
 
 
249 aa  166  2.9999999999999998e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4490  ABC transporter related protein  43.58 
 
 
257 aa  166  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2301  ABC transporter related protein  39.39 
 
 
264 aa  166  4e-40  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00393831  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2635  ABC transporter related  40.38 
 
 
445 aa  165  5e-40  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.182564  normal  0.318501 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1073  ABC transporter related  37.83 
 
 
231 aa  165  5e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2603  ABC transporter related protein  41.41 
 
 
271 aa  165  6.9999999999999995e-40  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.159465  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1914  ABC transporter related  47.72 
 
 
272 aa  165  8e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2782  ABC transporter related protein  41.67 
 
 
255 aa  164  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.283122 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7925  ABC transporter related  46.08 
 
 
228 aa  164  1.0000000000000001e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08480  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  39.32 
 
 
274 aa  164  1.0000000000000001e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.363174  normal  0.516344 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1874  ABC transporter related  42.79 
 
 
258 aa  164  1.0000000000000001e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.265297  normal  0.39521 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3230  ABC transporter related protein  42.13 
 
 
312 aa  163  2.0000000000000002e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.1961  normal  0.0782588 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4887  ABC transporter related  39.35 
 
 
455 aa  162  3e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.98231  normal  0.130468 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2392  ABC transporter related protein  42.15 
 
 
277 aa  162  3e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00600237  hitchhiker  0.00131217 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1179  ABC transporter related  41.62 
 
 
253 aa  162  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.515909  normal  0.937486 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1370  ABC transporter related  39.27 
 
 
232 aa  162  4.0000000000000004e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000531133  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1151  ABC transporter related  39.29 
 
 
228 aa  162  6e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.023193  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0186  ABC transporter related  41.82 
 
 
244 aa  162  6e-39  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.475038 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4413  ABC transporter related protein  44.24 
 
 
244 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.14097  normal  0.0308412 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1349  ABC transporter related  41.94 
 
 
258 aa  162  6e-39  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0799  ABC transporter related  40.74 
 
 
266 aa  162  7e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0641  ABC transporter, ATP-binding protein  40.1 
 
 
279 aa  161  8.000000000000001e-39  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.202535 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1335  ABC transporter related  39.55 
 
 
238 aa  161  9e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.43014  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1004  ABC transporter-related protein  43.72 
 
 
230 aa  161  9e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0287  ABC transporter related  37.21 
 
 
240 aa  161  9e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0743  ABC transporter related  39.59 
 
 
226 aa  161  1e-38  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1628  ABC transporter related protein  40.54 
 
 
250 aa  160  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.175437 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2106  ABC transporter related  42.92 
 
 
248 aa  161  1e-38  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.61282  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0270  ABC transporter related protein  46.7 
 
 
243 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, ATPase component  44.7 
 
 
269 aa  160  1e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0459464  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0086  ABC transporter related  41.41 
 
 
233 aa  160  2e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2956  ABC transporter, ATP-binding protein  38.99 
 
 
251 aa  160  2e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000801785  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0346  ABC transporter related protein  46.5 
 
 
302 aa  160  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3057  ABC transporter related protein  42.64 
 
 
255 aa  160  2e-38  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2148  ABC transporter related  44.95 
 
 
225 aa  160  2e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.357033  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0669  ABC transporter related  36.86 
 
 
242 aa  159  3e-38  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0872  ABC transporter-like protein  40.09 
 
 
248 aa  160  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.175759  normal  0.103583 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0530  ABC transporter related  47.92 
 
 
277 aa  160  3e-38  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.103758  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4388  lipoprotein transporter ATP-binding subunit  44.04 
 
 
238 aa  160  3e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0119739  normal  0.0787869 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2841  ABC transporter related  48.29 
 
 
244 aa  159  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.321502  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0557  ABC transporter related  42.42 
 
 
225 aa  159  5e-38  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3481  ABC transporter-related protein  37.56 
 
 
256 aa  159  5e-38  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2747  ABC transporter-related protein  48.29 
 
 
244 aa  159  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00686798  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1243  ABC transporter related  40.51 
 
 
229 aa  158  7e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  42.13 
 
 
657 aa  158  7e-38  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4723  ABC transporter ATP-binding protein  38.36 
 
 
256 aa  158  8e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4581  ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 
256 aa  158  8e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5085  ABC transporter ATP-binding protein  38.36 
 
 
256 aa  158  8e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4946  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 
256 aa  158  8e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0279  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 
256 aa  158  9e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl019  glutamine ABC transporter  37.81 
 
 
604 aa  157  1e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2892  ABC transporter, ATP-binding protein  37.9 
 
 
251 aa  157  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4956  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 
256 aa  158  1e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4972  efflux ABC transporter, ATP-binding protein  38.36 
 
 
256 aa  157  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>