More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_12510 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_2378  alanyl-tRNA synthetase  52.46 
 
 		 889 aa  891    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2026  alanyl-tRNA synthetase  43.27 
 
 		 879 aa  638    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0668165  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3200  alanyl-tRNA synthetase  40.77 
 
 		 880 aa  654    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0953243  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1694  alanyl-tRNA synthetase  51.9 
 
 		 892 aa  826    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0569274  normal  0.130258 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1819  alanyl-tRNA synthetase  54.07 
 
 		 892 aa  922    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000366282 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0769  alanyl-tRNA synthetase  41.17 
 
 		 878 aa  640    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0610904  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5265  alanyl-tRNA synthetase  59.73 
 
 		 890 aa  1035    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3075  alanyl-tRNA synthetase  52.79 
 
 		 888 aa  836    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.314973 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16360  alanyl-tRNA synthetase  50.77 
 
 		 902 aa  860    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1689  alanyl-tRNA synthetase  53.4 
 
 		 895 aa  872    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.153123  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1828  alanyl-tRNA synthetase  54.4 
 
 		 892 aa  921    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222093  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2070  alanyl-tRNA synthetase  52.56 
 
 		 889 aa  850    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.450401  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12720  alanyl-tRNA synthetase  58.77 
 
 		 903 aa  972    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.233264  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3763  alanyl-tRNA synthetase  56.09 
 
 		 898 aa  914    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.49187 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2015  alanyl-tRNA synthetase  57.01 
 
 		 898 aa  981    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000286953 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0375  alanine--tRNA ligase  49.78 
 
 		 894 aa  801    Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3158  alanyl-tRNA synthetase  61.86 
 
 		 897 aa  1029    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.412954  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3214  alanyl-tRNA synthetase  51.84 
 
 		 881 aa  829    Frankia sp. CcI3  Bacteria  hitchhiker  0.0063614  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2014  alanyl-tRNA synthetase  53.51 
 
 		 896 aa  813    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.226707  normal  0.142525 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1351  alanyl-tRNA synthetase  52.95 
 
 		 895 aa  899    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12576  alanyl-tRNA synthetase  52.82 
 
 		 904 aa  877    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.251019  normal  0.0860525 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1975  alanyl-tRNA synthetase  54.65 
 
 		 890 aa  911    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.235306  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3297  alanyl-tRNA synthetase  57.95 
 
 		 891 aa  967    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000320998  normal  0.10569 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2096  alanyl-tRNA synthetase  40.99 
 
 		 879 aa  650    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.224522  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2320  alanyl-tRNA synthetase  55.39 
 
 		 900 aa  917    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.871367  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3878  alanyl-tRNA synthetase  57.21 
 
 		 885 aa  993    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.785303  normal  0.718927 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2346  alanyl-tRNA synthetase  54.94 
 
 		 897 aa  894    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.413447  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2033  alanyl-tRNA synthetase  41.82 
 
 		 879 aa  642    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1750  alanyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 879 aa  642    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12510  alanyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 893 aa  1797    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.617945  normal  0.25929 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0616  alanyl-tRNA synthetase  50.06 
 
 		 893 aa  806    Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05750  alanyl-tRNA synthetase  41.21 
 
 		 876 aa  676    Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.214182  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6094  Alanine--tRNA ligase  53.24 
 
 		 890 aa  840    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0138717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2387  alanyl-tRNA synthetase  54.83 
 
 		 897 aa  892    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.648952  normal  0.0242506 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2278  alanyl-tRNA synthetase  56.9 
 
 		 892 aa  983    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  decreased coverage  0.00416969  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15270  alanyl-tRNA synthetase  53.91 
 
 		 888 aa  900    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0205422  normal  0.854238 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1330  alanyl-tRNA synthetase  50.74 
 
 		 886 aa  799    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0429057  normal  0.324853 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17690  alanyl-tRNA synthetase  54.06 
 
 		 895 aa  898    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.010603  normal  0.139761 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2407  alanyl-tRNA synthetase  56.44 
 
 		 896 aa  907    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.714506  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2393  alanyl-tRNA synthetase  54.94 
 
 		 897 aa  894    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.545162 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2135  alanyl-tRNA synthetase  54.9 
 
 		 889 aa  859    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00198775  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2640  alanyl-tRNA synthetase  54.14 
 
 		 898 aa  890    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.747101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3032  alanyl-tRNA synthetase  55.73 
 
 		 893 aa  893    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2047  alanyl-tRNA synthetase  54.85 
 
 		 889 aa  884    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0621427  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1818  alanyl-tRNA synthetase  54.92 
 
 		 897 aa  848    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.17806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1033  alanyl-tRNA synthetase  40.56 
 
 		 882 aa  630  1e-179  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5448  alanyl-tRNA synthetase  42.35 
 
 		 896 aa  631  1e-179  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.10309 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1331  alanyl-tRNA synthetase  40.02 
 
 		 883 aa  630  1e-179  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0912  alanyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 880 aa  625  1e-177  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00106674  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1299  alanyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 875 aa  624  1e-177  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.745017  normal  0.0109857 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2555  alanyl-tRNA synthetase  41.67 
 
 		 878 aa  620  1e-176  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3154  alanyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 		 876 aa  620  1e-176  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0201  alanyl-tRNA synthetase  39.73 
 
 		 876 aa  621  1e-176  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0035752 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1780  alanyl-tRNA synthetase  38.07 
 
 		 878 aa  619  1e-176  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3176  alanyl-tRNA synthetase  41.2 
 
 		 878 aa  621  1e-176  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4054  alanyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 874 aa  617  1e-175  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100715  normal  0.103124 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2268  alanyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 878 aa  618  1e-175  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000149569 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1489  alanyl-tRNA synthetase  39.05 
 
 		 877 aa  618  1e-175  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000163922  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0831  alanyl-tRNA synthetase  41.5 
 
 		 884 aa  618  1e-175  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.168627  normal  0.137566 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2557  alanyl-tRNA synthetase  41.71 
 
 		 887 aa  617  1e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.243689  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1052  alanyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 877 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.103695 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1217  alanyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 874 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00997618  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0843  alanyl-tRNA synthetase  40.82 
 
 		 892 aa  615  9.999999999999999e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000200247  unclonable  0.0000000309197 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2374  alanyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 		 880 aa  613  9.999999999999999e-175  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0815913  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0934  alanyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 877 aa  613  9.999999999999999e-175  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1213  alanyl-tRNA synthetase  40.95 
 
 		 874 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0239363  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1621  alanyl-tRNA synthetase  42.57 
 
 		 897 aa  612  9.999999999999999e-175  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0965  alanyl-tRNA synthetase  41.61 
 
 		 876 aa  612  9.999999999999999e-175  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.171678  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0148  alanyl-tRNA synthetase  41 
 
 		 875 aa  610  1e-173  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.379709  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0389  alanyl-tRNA synthetase  42.74 
 
 		 867 aa  611  1e-173  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1324  alanyl-tRNA synthetase  40.18 
 
 		 874 aa  610  1e-173  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.632034 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1287  alanyl-tRNA synthetase  42.79 
 
 		 891 aa  611  1e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.178643 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1311  alanyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 		 874 aa  609  1e-173  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.290938  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3015  alanyl-tRNA synthetase  40.27 
 
 		 865 aa  610  1e-173  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.071786  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1289  alanyl-tRNA synthetase  42.44 
 
 		 865 aa  611  1e-173  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0013  alanyl-tRNA synthetase  40.51 
 
 		 878 aa  609  1e-173  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1660  alanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 874 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0773336  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00451  alanyl-tRNA synthetase  37.68 
 
 		 886 aa  607  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0895  alanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 874 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131636  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1815  alanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 874 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.124325  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2408  alanyl-tRNA synthetase  39.53 
 
 		 882 aa  607  9.999999999999999e-173  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00604857  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2824  alanyl-tRNA synthetase  40.62 
 
 		 874 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.0756598 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0089  alanyl-tRNA synthetase  41.15 
 
 		 879 aa  608  9.999999999999999e-173  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0705  alanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 874 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.722358  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0146  alanyl-tRNA synthetase  39.2 
 
 		 876 aa  608  9.999999999999999e-173  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0010822  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1637  alanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 874 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.365835  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0927  alanyl-tRNA synthetase  39.74 
 
 		 897 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.540325  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0455  alanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 874 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.70342  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1286  alanyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 874 aa  606  9.999999999999999e-173  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1409  alanyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 897 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.412076  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3339  alanyl-tRNA synthetase  40.38 
 
 		 874 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0101035  hitchhiker  0.000000688194 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1387  alanyl-tRNA synthetase  39.85 
 
 		 874 aa  608  9.999999999999999e-173  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.371658 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1906  alanyl-tRNA synthetase  39.24 
 
 		 879 aa  607  9.999999999999999e-173  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1423  alanyl-tRNA synthetase  40.97 
 
 		 874 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.429159  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0311  alanyl-tRNA synthetase  40.33 
 
 		 880 aa  605  1.0000000000000001e-171  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00471  alanyl-tRNA synthetase  37.34 
 
 		 886 aa  603  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1318  alanyl-tRNA synthetase  39.96 
 
 		 874 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0106685  hitchhiker  0.00151314 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1653  alanyl-tRNA synthetase  42.1 
 
 		 863 aa  605  1.0000000000000001e-171  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.149949  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1521  alanyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 887 aa  604  1.0000000000000001e-171  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1063  alanyl-tRNA synthetase  39.89 
 
 		 874 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>