145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ksed_00960 on replicon NC_013169
Organism: Kytococcus sedentarius DSM 20547



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013169  Ksed_00960  transcriptional regulator  100 
 
 
148 aa  298  1e-80  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4108  MarR family transcriptional regulator  43.75 
 
 
137 aa  89.7  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7225  transcriptional regulator, MarR family  43.4 
 
 
151 aa  85.9  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4259  transcriptional regulator, MarR family  41.96 
 
 
137 aa  82.8  2e-15  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4236  transcriptional regulator, MarR family  42.86 
 
 
137 aa  82.8  2e-15  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8160  transcriptional regulator, MarR family  36.43 
 
 
153 aa  79.3  2e-14  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.469151 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4490  hypothetical protein  38.61 
 
 
154 aa  75.5  2e-13  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.132739  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0828  MarR family transcriptional regulator  34.43 
 
 
149 aa  72  2e-12  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.245501  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1818  MarR family transcriptional regulator  33.61 
 
 
149 aa  69.3  2e-11  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  2.01551e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0945  transcriptional regulator, MarR family  34.11 
 
 
149 aa  68.6  3e-11  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3906  transcriptional regulator, MarR family  34.69 
 
 
140 aa  66.2  1e-10  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0144  transcriptional regulator, MarR family  33.64 
 
 
150 aa  63.2  1e-09  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0766  transcriptional regulator, TrmB  41.94 
 
 
140 aa  62.8  1e-09  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.151681  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00430  transcriptional regulator  37.23 
 
 
160 aa  62.4  2e-09  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.788816  normal  0.0203884 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2058  transcriptional regulator, MarR family  31.93 
 
 
170 aa  62.8  2e-09  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4525  transcriptional regulator, MarR family  36.89 
 
 
165 aa  61.6  3e-09  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0873  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
157 aa  58.9  2e-08  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.90206  normal  0.127598 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0913  transcriptional regulator, MarR family  33.66 
 
 
166 aa  58.2  3e-08  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0467048 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1275  hypothetical protein  31.91 
 
 
160 aa  58.9  3e-08  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0136  transcriptional regulator, MarR family  38.04 
 
 
153 aa  57  8e-08  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1577  MarR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
176 aa  57  8e-08  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0171714 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0144  transcriptional regulator, MarR family  30.61 
 
 
155 aa  55.5  2e-07  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2932  transcriptional regulator, MarR family  34.29 
 
 
183 aa  55.8  2e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.264112 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4581  transcriptional regulator, MarR family  30.11 
 
 
128 aa  55.5  2e-07  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.308908 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3827  MarR family transcriptional regulator  30.88 
 
 
172 aa  55.1  3e-07  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.360185  normal  0.0550359 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4987  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 
176 aa  54.3  5e-07  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.411261  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5368  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 
176 aa  54.3  5e-07  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5075  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 
176 aa  54.3  5e-07  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.771744 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1717  regulatory protein MarR  30.43 
 
 
142 aa  53.9  8e-07  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1264  transcriptional regulator, MarR family  31.25 
 
 
159 aa  53.5  9e-07  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8410  putative transcriptional regulator protein, MarR family  37.18 
 
 
163 aa  53.5  1e-06  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.410665  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1981  MarR family transcriptional regulator  27.1 
 
 
184 aa  52.4  2e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.74595 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2250  transcriptional regulator, MarR family  37.5 
 
 
166 aa  52.8  2e-06  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.4153  hitchhiker  0.000614739 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0800  transcriptional regulator, MarR family  40 
 
 
167 aa  52.4  2e-06  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.929664  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24280  transcriptional regulator  29.33 
 
 
197 aa  52  3e-06  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0635766  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0889  MarR family transcriptional regulator  33 
 
 
157 aa  52  3e-06  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.432936  normal  0.269103 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1845  transcriptional regulator, MarR family  31.07 
 
 
157 aa  52  3e-06  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.146036  normal  0.153387 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12510  transcriptional regulator  30.89 
 
 
161 aa  52  3e-06  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1263  transcriptional regulator, MarR family  41.18 
 
 
169 aa  51.6  4e-06  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0891  transcriptional regulator, MarR family  35.48 
 
 
156 aa  51.6  4e-06  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0781  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
194 aa  51.2  5e-06  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0796  MarR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
194 aa  51.2  5e-06  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.126149 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3374  MarR family transcriptional regulator  26.67 
 
 
159 aa  50.4  7e-06  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.307875  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07180  transcriptional regulator, MarR family  30.69 
 
 
159 aa  49.7  1e-05  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.733565  normal  0.223019 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2322  transcriptional regulator, MarR family  25.66 
 
 
193 aa  50.1  1e-05  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000287638  decreased coverage  1.019e-06 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0777  MarR family transcriptional regulator  32.5 
 
 
194 aa  50.1  1e-05  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.630614 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1087  MarR family transcriptional regulator  32.98 
 
 
166 aa  50.1  1e-05  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.502735  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0733  MarR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
165 aa  49.7  1e-05  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.23727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8691  transcriptional regulator, MarR family  28.97 
 
 
155 aa  48.9  2e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1821  transcriptional regulator, MarR family  32 
 
 
152 aa  48.9  2e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_01640  transcriptional regulator  27.1 
 
 
151 aa  49.3  2e-05  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.98097  normal  0.211927 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0121  MarR family transcriptional regulator  33.77 
 
 
169 aa  48.5  3e-05  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.273573  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4179  transcriptional regulator, MarR family  31.58 
 
 
166 aa  48.5  3e-05  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.483943  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1870  regulatory protein, MarR  24.62 
 
 
158 aa  48.5  3e-05  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0850554  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24880  transcriptional regulator  30.95 
 
 
171 aa  48.1  4e-05  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_18710  transcriptional regulator, MarR family  33.02 
 
 
160 aa  48.1  4e-05  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.332753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1273  transcriptional regulator, MarR family  34.07 
 
 
168 aa  48.1  4e-05  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5614  MarR family transcriptional regulator  30 
 
 
172 aa  48.1  4e-05  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.695178  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1190  MarR family transcriptional regulator  29.73 
 
 
172 aa  47.8  5e-05  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.206069  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1060  MarR family transcriptional regulator  32.43 
 
 
162 aa  47.8  5e-05  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3013  putative MarR-family regulatory protein  29.7 
 
 
154 aa  47.4  7e-05  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.102255  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2736  transcriptional regulator, MarR family  34.94 
 
 
194 aa  47.4  7e-05  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.00897235  normal  0.0940124 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0362  transcriptional regulator, MarR family  35.06 
 
 
177 aa  47  8e-05  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3531  transcriptional regulator, MarR family  30 
 
 
132 aa  47  9e-05  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.179982  normal  0.511756 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0442  transcriptional regulator, MarR family  34.12 
 
 
172 aa  46.6  0.0001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.798743  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3506  transcriptional regulator, MarR family  29.13 
 
 
164 aa  46.6  0.0001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.719145  normal  0.764643 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2393  regulatory protein, MarR  35.56 
 
 
173 aa  46.6  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3256  transcriptional regulator, MarR family  34.78 
 
 
168 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0935978  normal  0.196608 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0819  MarR family transcriptional regulator  30.7 
 
 
162 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3981  transcriptional regulator, MarR family  27.05 
 
 
200 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1226  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.194022  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1228  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5981  transcriptional regulator, MarR family  32.91 
 
 
164 aa  45.4  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.309203  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1253  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1388  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 
148 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0249  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
162 aa  45.4  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.250747  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0878  transcriptional regulator, MarR family  32.56 
 
 
163 aa  45.8  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1425  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000689424 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4598  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
189 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3956  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 
148 aa  45.4  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.410327 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1525  transcriptional regulator, MarR family  34.57 
 
 
156 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1491  transcriptional regulator, MarR family  31.76 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1352  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
148 aa  45.8  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2001  MarR family transcriptional regulator  32.52 
 
 
197 aa  45.4  0.0003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.803243  normal  0.0833293 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0350  transcriptional regulator, MarR family  28.57 
 
 
149 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0519  transcriptional regulator, MarR family  30.19 
 
 
161 aa  45.1  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  hitchhiker  9.93982e-08  hitchhiker  0.00277743 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4289  transcriptional regulator, MarR family  36.84 
 
 
166 aa  45.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.801881 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2051  regulatory protein, MarR  30.36 
 
 
164 aa  45.4  0.0003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0889  transcriptional regulator, MarR family  29.82 
 
 
163 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1450  MarR family transcriptional regulator  31.76 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0809  MarR family transcriptional regulator  29.82 
 
 
189 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.22485  normal  0.428179 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0455  transcriptional regulator, MarR family  27.21 
 
 
171 aa  45.1  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0136  MarR family transcriptional regulator  35.19 
 
 
168 aa  44.7  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0416957  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3830  transcriptional regulator, MarR family  35.04 
 
 
172 aa  44.7  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1129  transcriptional regulator, MarR family  29.29 
 
 
144 aa  45.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.014042  normal  0.303537 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1370  regulatory protein, MarR  35.62 
 
 
164 aa  44.7  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.546813  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2941  transcriptional regulator, MarR family  33.33 
 
 
186 aa  44.7  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.760695  normal  0.485895 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1251  MarR family transcriptional regulator  34.25 
 
 
148 aa  44.7  0.0005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0920  MarR family transcriptional regulator  36.05 
 
 
181 aa  44.7  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.428707 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6082  transcriptional regulator, MarR family  36.47 
 
 
167 aa  44.3  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.352412  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>