More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Krad_1376 on replicon NC_009664
Organism: Kineococcus radiotolerans SRS30216



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009664  Krad_1376  Ribonuclease III  100 
 
 		 224 aa  439  9.999999999999999e-123  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.028132  normal  0.115485 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0651  ribonuclease III  65.32 
 
 		 240 aa  274  1.0000000000000001e-72  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8017  ribonuclease III  65.14 
 
 		 276 aa  265  5.999999999999999e-70  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1574  ribonuclease III  61.01 
 
 		 246 aa  263  2e-69  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0764716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0212  ribonuclease III  66.98 
 
 		 248 aa  258  5.0000000000000005e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2293  ribonuclease III  61.43 
 
 		 240 aa  253  2.0000000000000002e-66  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.051216  hitchhiker  0.000715248 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3433  ribonuclease III  65.28 
 
 		 268 aa  249  2e-65  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.699086  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4192  ribonuclease III  59.91 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3281  ribonuclease III  64.1 
 
 		 276 aa  243  9.999999999999999e-64  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1883  ribonuclease III  60.19 
 
 		 249 aa  241  7.999999999999999e-63  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0277805  normal  0.0189831 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2780  ribonuclease III  64.25 
 
 		 267 aa  239  2e-62  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.16188  normal  0.181798 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12940  ribonuclease III  65.1 
 
 		 240 aa  239  2e-62  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1139  ribonuclease III  61.9 
 
 		 306 aa  236  3e-61  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.323858  normal  0.0251289 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1177  ribonuclease III  62.63 
 
 		 252 aa  235  5.0000000000000005e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.312769  hitchhiker  0.0000455541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1287  ribonuclease III  62.12 
 
 		 252 aa  232  3e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.134604  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2122  ribonuclease III  61.43 
 
 		 243 aa  232  3e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0434013 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1609  ribonuclease III  58.29 
 
 		 252 aa  233  3e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.425776  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2171  ribonuclease III  61.46 
 
 		 235 aa  232  4.0000000000000004e-60  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2072  ribonuclease III  60 
 
 		 262 aa  230  1e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.497475  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1567  ribonuclease III  61.62 
 
 		 249 aa  228  5e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0292107  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2501  ribonuclease III  58.88 
 
 		 240 aa  226  3e-58  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.601617  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2239  Ribonuclease III  57.87 
 
 		 242 aa  225  5.0000000000000005e-58  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000641726 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2273  ribonuclease III  56.6 
 
 		 239 aa  225  5.0000000000000005e-58  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3601  ribonuclease III  63.64 
 
 		 270 aa  224  8e-58  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7995  Ribonuclease III  65.99 
 
 		 243 aa  223  3e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.250763 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_11290  RNAse III  54.98 
 
 		 234 aa  219  1.9999999999999999e-56  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0299262 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1929  ribonuclease III  58.33 
 
 		 234 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18360  RNAse III  59.51 
 
 		 250 aa  217  1e-55  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1666  ribonuclease III  54.03 
 
 		 241 aa  217  1e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.397284  normal  0.0114969 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1949  ribonuclease III  58.33 
 
 		 234 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1995  ribonuclease III  58.33 
 
 		 234 aa  217  1e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0814275  normal  0.249883 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4029  ribonuclease III  63.24 
 
 		 270 aa  214  9e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5964  ribonuclease III  60.1 
 
 		 267 aa  214  9.999999999999999e-55  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09490  RNAse III  60.63 
 
 		 250 aa  213  1.9999999999999998e-54  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.805869  normal  0.162457 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10860  RNAse III  59.07 
 
 		 228 aa  211  5.999999999999999e-54  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0129939  normal  0.199787 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08900  RNAse III  54.98 
 
 		 220 aa  209  2e-53  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.493633  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1183  ribonuclease III  47.12 
 
 		 259 aa  183  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000192839  normal  0.0311814 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1363  Ribonuclease III  46.48 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000482904  normal  0.16151 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0645  ribonuclease III  48.06 
 
 		 235 aa  178  5.999999999999999e-44  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0482466  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2069  ribonuclease III  47.6 
 
 		 246 aa  177  2e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00379668  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1403  RNase III  44.13 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000749592  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0907  ribonuclease III  45.58 
 
 		 246 aa  175  5e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1650  ribonuclease III  51.27 
 
 		 385 aa  172  3.9999999999999995e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1972  ribonuclease III  42.65 
 
 		 241 aa  172  5e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00427234  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1690  ribonuclease III  43.13 
 
 		 241 aa  172  5e-42  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00872848  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2208  Ribonuclease III  51.27 
 
 		 383 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.904351  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2296  Ribonuclease III  51.27 
 
 		 383 aa  171  6.999999999999999e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.302366  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1027  ribonuclease III  45.24 
 
 		 246 aa  171  7.999999999999999e-42  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.0000153417  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0961  ribonuclease III  48.78 
 
 		 235 aa  171  7.999999999999999e-42  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10320  Ribonuclease III  45.83 
 
 		 236 aa  170  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000486688  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0773  ribonuclease III  46.57 
 
 		 233 aa  169  3e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000168987  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2159  ribonuclease III  48.08 
 
 		 377 aa  169  3e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.201039 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0931  ribonuclease III  44.08 
 
 		 236 aa  168  7e-41  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000194117  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0876  ribonuclease III  44.29 
 
 		 242 aa  163  2.0000000000000002e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0687  ribonuclease III  42.44 
 
 		 236 aa  162  3e-39  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1083  ribonuclease III  44.81 
 
 		 246 aa  162  3e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.599235  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2661  ribonuclease III  47.66 
 
 		 260 aa  162  4.0000000000000004e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0726  ribonuclease III  42.51 
 
 		 245 aa  162  5.0000000000000005e-39  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.902468  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1974  ribonuclease III  46.26 
 
 		 246 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3813  Ribonuclease III  44.98 
 
 		 262 aa  161  6e-39  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000119761  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3545  ribonuclease III  49.24 
 
 		 282 aa  160  1e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0895887  normal  0.125705 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2460  ribonuclease III  43 
 
 		 231 aa  161  1e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.214805  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2813  ribonuclease III  42.06 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.527235  normal  0.303497 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3303  Ribonuclease III  42.06 
 
 		 225 aa  157  2e-37  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0336  ribonuclease III  45.33 
 
 		 242 aa  156  2e-37  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_897  ribonuclease III  40 
 
 		 248 aa  156  3e-37  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000334707  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2065  ribonuclease III  40.93 
 
 		 223 aa  156  3e-37  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1720  ribonuclease III  44.39 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00348045  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2444  ribonuclease III  44.6 
 
 		 235 aa  155  5.0000000000000005e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.517921  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1494  ribonuclease III  39.71 
 
 		 222 aa  154  7e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1092  Ribonuclease III  45.93 
 
 		 228 aa  154  8e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.268595  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3152  ribonuclease III  43.72 
 
 		 240 aa  154  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000533907  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1025  ribonuclease III  39.63 
 
 		 237 aa  154  1e-36  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.00427221  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1753  ribonuclease III  42.79 
 
 		 230 aa  154  1e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.159532  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0380  ribonuclease III  41.78 
 
 		 234 aa  153  2e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.492905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1502  ribonuclease III  42.92 
 
 		 231 aa  153  2e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00547993  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0908  ribonuclease III  39.81 
 
 		 248 aa  152  2.9999999999999998e-36  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000640181  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1041  ribonuclease III  44.29 
 
 		 242 aa  152  2.9999999999999998e-36  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.834225  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0661  ribonuclease III  41.35 
 
 		 221 aa  152  5e-36  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0685749  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1778  ribonuclease III  44.39 
 
 		 234 aa  152  5e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.574202  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4749  ribonuclease III  43.5 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.190764  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1272  ribonuclease III  41.35 
 
 		 229 aa  150  2e-35  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.812547  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0406  ribonuclease III  42.86 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.832098  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3203  ribonuclease III  47.62 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000725651  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0951  ribonuclease III  45.96 
 
 		 233 aa  149  3e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.608841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54330  ribonuclease III  43.5 
 
 		 229 aa  149  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0946  Ribonuclease III  39.81 
 
 		 238 aa  149  4e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.652577  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1463  ribonuclease III  44.86 
 
 		 230 aa  149  4e-35  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3959  Ribonuclease III  44.72 
 
 		 228 aa  149  4e-35  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4374  ribonuclease III  44.61 
 
 		 229 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1947  ribonuclease III  40.29 
 
 		 253 aa  148  5e-35  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2429  ribonuclease III  44.23 
 
 		 242 aa  149  5e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2317  ribonuclease III:double-stranded RNA binding  42.72 
 
 		 246 aa  148  7e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.458623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1613  ribonuclease III  40.91 
 
 		 223 aa  148  7e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4288  ribonuclease III  44.12 
 
 		 229 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1433  ribonuclease III  44.12 
 
 		 229 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00353608  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0723  ribonuclease III  41.71 
 
 		 236 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0778  ribonuclease III  36.62 
 
 		 233 aa  147  1.0000000000000001e-34  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1060  ribonuclease III  48.57 
 
 		 232 aa  146  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.2378e-17 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2274  ribonuclease III  43.2 
 
 		 256 aa  146  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.143896 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>