More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Huta_2524 on replicon NC_013158
Organism: Halorhabdus utahensis DSM 12940



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013158  Huta_2524  30S ribosomal protein S13P  100 
 
 		 176 aa  352  2e-96  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.00788045  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2589  30S ribosomal protein S13P  74.52 
 
 		 178 aa  236  9e-62  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.191208  normal  0.380444 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2554  ribosomal protein S13P  70.06 
 
 		 174 aa  231  4.0000000000000004e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0420  ribosomal protein S13P  72.67 
 
 		 171 aa  231  5e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1816  30S ribosomal protein S13P  62.42 
 
 		 174 aa  208  2e-53  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2225  30S ribosomal protein S13P  49.65 
 
 		 153 aa  150  5.9999999999999996e-36  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1800  30S ribosomal protein S13P  46.15 
 
 		 149 aa  145  3e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.411699  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1247  30S ribosomal protein S13P  47.92 
 
 		 150 aa  144  5e-34  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000201962  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2388  30S ribosomal protein S13P  45.83 
 
 		 151 aa  141  4e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.656616 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0078  30S ribosomal protein S13P  48.32 
 
 		 162 aa  138  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1618  30S ribosomal protein S13P  43.33 
 
 		 159 aa  138  3.9999999999999997e-32  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2902  30S ribosomal protein S13P  43.75 
 
 		 151 aa  135  2e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.132412  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0036  30S ribosomal protein S13P  45.77 
 
 		 148 aa  132  3e-30  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1396  ribosomal protein S13P  45.07 
 
 		 148 aa  131  3.9999999999999996e-30  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.837984  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0972  30S ribosomal protein S13P  42.25 
 
 		 153 aa  114  6e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0987409 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1421  30S ribosomal protein S13P  42.66 
 
 		 153 aa  114  6.9999999999999995e-25  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.839715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1894  30S ribosomal protein S13P  39.16 
 
 		 152 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0910  30S ribosomal protein S13P  40.56 
 
 		 153 aa  109  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0502  30S ribosomal protein S13P  41.3 
 
 		 162 aa  101  6e-21  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.712073  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0274  30S ribosomal protein S13P  37.32 
 
 		 149 aa  99.8  2e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0564  30S ribosomal protein S13P  36.62 
 
 		 149 aa  98.6  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1354  30S ribosomal protein S13P  36.62 
 
 		 149 aa  98.6  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.239883  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1101  30S ribosomal protein S13P  33.8 
 
 		 149 aa  97.1  1e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006679  CNJ03110  ribosomal protein S18, putative  33.33 
 
 		 155 aa  96.7  2e-19  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.710402  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0630  30S ribosomal protein S13P  35.21 
 
 		 149 aa  95.1  4e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05441  ribosomal protein S13p/S18e (AFU_orthologue; AFUA_6G13550)  32.39 
 
 		 155 aa  93.6  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.22167 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0259  30S ribosomal protein S13P  42.36 
 
 		 157 aa  92  4e-18  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78465  ribosomal protein S18B  33.09 
 
 		 145 aa  91.7  5e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0325  30S ribosomal protein S13P  34.29 
 
 		 194 aa  90.5  1e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29591  Ribosomal protein S18, component of cytosolic 80S ribosome and 40S small subunit  32.85 
 
 		 144 aa  85.1  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30486  predicted protein  32.64 
 
 		 146 aa  83.2  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2148  30S ribosomal protein S13P  33.07 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00000000612517  hitchhiker  0.000312913 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1055  ribosomal protein S13P  38.78 
 
 		 165 aa  78.2  0.00000000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0133675  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0287  30S ribosomal protein S13  30.28 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0660  30S ribosomal protein S13  29.69 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.0897908  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2512  30S ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 122 aa  58.9  0.00000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1005  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 124 aa  57  0.0000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.00000000000343576  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1720  30S ribosomal protein S13  32.86 
 
 		 124 aa  56.6  0.0000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000124945  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0978  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 122 aa  55.8  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.24534  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0277  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 122 aa  55.5  0.0000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.630615 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0324  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 120 aa  55.1  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1136  ribosomal protein S13  31.54 
 
 		 122 aa  55.1  0.0000006  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000957458  normal  0.0444923 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0383  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.087289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1737  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 122 aa  54.7  0.0000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4973  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2042  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 123 aa  53.9  0.000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00070968  hitchhiker  0.000175358 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20620  SSU ribosomal protein S13P  33.08 
 
 		 123 aa  53.5  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.114743  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0250  30S ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 132 aa  53.9  0.000001  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2434  30S ribosomal protein S13  33.1 
 
 		 123 aa  52.8  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3970  ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 121 aa  52.8  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2620  30S ribosomal protein S13  34.59 
 
 		 126 aa  52.8  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0311  ribosomal protein S13  29.29 
 
 		 123 aa  52.4  0.000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.860174  normal  0.358609 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1369  30S ribosomal protein S13  31.06 
 
 		 125 aa  52.4  0.000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000385836  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0240  30S ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 123 aa  52.8  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.696841  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1859  30S ribosomal protein S13  29.46 
 
 		 129 aa  52.4  0.000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.300797  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1317  30S ribosomal protein S13  31.06 
 
 		 125 aa  52.4  0.000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000394298  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1433  30S ribosomal protein S13  33.08 
 
 		 124 aa  52.4  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.702882  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0316  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 118 aa  52  0.000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0714162  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1843  30S ribosomal protein S13  34.09 
 
 		 126 aa  52.4  0.000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.911295 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0342  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 121 aa  52.4  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158727  hitchhiker  0.00039866 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0511  30S ribosomal protein S13  28.24 
 
 		 125 aa  51.6  0.000005  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2131  30S ribosomal protein S13  31.01 
 
 		 122 aa  51.6  0.000005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0523363  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1636  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 122 aa  52  0.000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0556196  normal  0.0187712 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0650  30S ribosomal protein S13  31.82 
 
 		 122 aa  51.6  0.000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.221495  hitchhiker  0.00000484055 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0615  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 122 aa  51.6  0.000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0765  ribosomal protein S13  31.06 
 
 		 121 aa  51.6  0.000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2686  30S ribosomal protein S13  30.77 
 
 		 122 aa  51.2  0.000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000961805  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0416  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 118 aa  51.2  0.000007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0392  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 118 aa  51.2  0.000007  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1139  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 124 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.732173  normal  0.382275 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0307  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 147 aa  51.2  0.000007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.322221 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1110  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 124 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1579  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 124 aa  51.2  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00743687  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1127  30S ribosomal protein S13  32.31 
 
 		 124 aa  51.2  0.000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.121764  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0250  ribosomal protein S13  29.29 
 
 		 123 aa  50.8  0.000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000000527618  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0056  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 122 aa  50.8  0.000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0521  30S ribosomal protein S13  27.69 
 
 		 118 aa  50.8  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.148461  unclonable  0.0000000000153746 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0351  30S ribosomal protein S13  27.69 
 
 		 118 aa  50.8  0.000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.069435  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2350  30S ribosomal protein S13  27.69 
 
 		 118 aa  50.1  0.00001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0713  30S ribosomal protein S13  34.09 
 
 		 126 aa  50.4  0.00001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.237056 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0204  30S ribosomal protein S13  27.34 
 
 		 129 aa  50.8  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0290  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 126 aa  50.1  0.00001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000353572  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0439  ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 125 aa  50.1  0.00001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00237388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1567  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 122 aa  50.8  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0795251  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6025  30S ribosomal protein S13  33.83 
 
 		 126 aa  50.4  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0915595 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0480  30S ribosomal protein S13  26.92 
 
 		 119 aa  50.8  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3686  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 118 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0131343  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1935  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 127 aa  50.1  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.610956 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1386  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 122 aa  50.1  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.35161 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0275  30S ribosomal protein S13  32.58 
 
 		 125 aa  50.1  0.00002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0725  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 122 aa  50.1  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.848573  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2042  30S ribosomal protein S13  26.92 
 
 		 128 aa  49.7  0.00002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.643752  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0427  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 118 aa  50.1  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.621258  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0302  30S ribosomal protein S13  26.92 
 
 		 120 aa  49.7  0.00002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000000420412  hitchhiker  0.0000142456 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2294  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 121 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1113  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 123 aa  49.7  0.00002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000830783  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3614  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 118 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00105943  normal  0.48549 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0782  30S ribosomal protein S13  29.23 
 
 		 122 aa  50.1  0.00002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.630132  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3613  30S ribosomal protein S13  28.46 
 
 		 118 aa  49.7  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000260189  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2253  30S ribosomal protein S13  30 
 
 		 121 aa  49.7  0.00002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.025499  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>