More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hore_16320 on replicon NC_011899
Organism: Halothermothrix orenii H 168



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011899  Hore_16320  Transcriptional regulator IclR  100 
 
 		 255 aa  518  1e-146  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  7.446e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1180  IclR family transcriptional regulator  48.41 
 
 		 267 aa  228  5e-59  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000000286827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1178  IclR family transcriptional regulator  45.06 
 
 		 262 aa  220  9.999999999999999e-57  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00493645  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1780  IclR family transcriptional regulator  41.3 
 
 		 272 aa  194  8.000000000000001e-49  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3102  transcriptional regulator, IclR family  38.31 
 
 		 260 aa  192  3e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2850  IclR family transcriptional regulator  42.11 
 
 		 260 aa  191  1e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.000441287  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3644  regulatory protein, IclR  39.11 
 
 		 260 aa  189  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000806492  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3027  IclR family transcriptional regulator  39.11 
 
 		 260 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000289902  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0669  transcriptional regulator, IclR family  38.71 
 
 		 260 aa  186  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.4595400000000001e-34 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0375  IclR family transcriptional regulator  41.74 
 
 		 254 aa  184  1.0000000000000001e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.665673 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1156  transcriptional regulator, IclR family  41.2 
 
 		 256 aa  184  1.0000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0417534  hitchhiker  0.00000481305 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2833  IclR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000013624  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0656  transcriptional regulator, IclR family  38.31 
 
 		 260 aa  184  2.0000000000000003e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000253097  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0514  IclR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 260 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000101936  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0759  IclR family transcriptional regulator  43.61 
 
 		 261 aa  180  2e-44  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.46118e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1911  transcriptional regulator, IclR family  37.5 
 
 		 256 aa  177  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1318  IclR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 275 aa  174  9.999999999999999e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.486749  normal  0.878274 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2387  transcriptional regulator, IclR family  38.64 
 
 		 257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2617  IclR family transcriptional regulator  40.27 
 
 		 276 aa  172  3.9999999999999995e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2064  IclR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 259 aa  171  1e-41  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740052 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4346  regulatory protein, IclR  38.04 
 
 		 263 aa  170  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.361524  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0443  transcriptional regulator, TrmB  37.33 
 
 		 254 aa  169  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.915404  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0849  regulatory proteins, IclR  39.43 
 
 		 276 aa  169  4e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3440  IclR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 273 aa  169  6e-41  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.866579  normal  0.57268 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4762  transcriptional regulator, IclR family  39.27 
 
 		 248 aa  168  6e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0417  IclR family transcriptional regulator  39.73 
 
 		 268 aa  168  8e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.116242 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2531  transcriptional regulator, IclR family  36.44 
 
 		 259 aa  168  9e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2373  transcriptional regulator, IclR family  36.93 
 
 		 261 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3546  regulatory protein, IclR  33.87 
 
 		 265 aa  166  2.9999999999999998e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000366663  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1855  transcriptional regulator, IclR family  40.53 
 
 		 280 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2596  IclR family transcriptional regulator  39.46 
 
 		 256 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2164  transcriptional regulator, IclR family  36.55 
 
 		 277 aa  163  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.851841  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3109  IclR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0066  IclR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 284 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0221  transcriptional repressor IclR  33.74 
 
 		 275 aa  161  8.000000000000001e-39  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0850662 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03890  DNA-binding transcriptional repressor  34.65 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3979  transcriptional regulator, IclR family  34.65 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03850  hypothetical protein  34.65 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4254  transcriptional repressor IclR  34.65 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.084393  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5488  transcriptional repressor IclR  34.65 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.901357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4012  transcriptional repressor IclR  34.65 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.992009  normal  0.0359052 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4471  transcriptional repressor IclR  34.65 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.215784  normal  0.0860899 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4562  transcriptional repressor IclR  34.65 
 
 		 274 aa  161  1e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4521  transcriptional repressor IclR  33.05 
 
 		 274 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.693212  normal  0.182303 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4399  transcriptional repressor IclR  33.05 
 
 		 274 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.241135  normal  0.788445 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4597  transcriptional repressor IclR  33.05 
 
 		 274 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0297  transcriptional repressor IclR  34.82 
 
 		 280 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0438568  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4434  transcriptional repressor IclR  33.05 
 
 		 274 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3924  transcriptional repressor IclR  34.82 
 
 		 280 aa  160  3e-38  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4524  transcriptional repressor IclR  33.05 
 
 		 274 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0367  transcriptional repressor IclR  34.82 
 
 		 280 aa  160  3e-38  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.504781  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09640  transcriptional regulator, IclR family  41.3 
 
 		 257 aa  159  4e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.936146  normal  0.241147 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0712  transcriptional regulator, IclR family  36.65 
 
 		 265 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.93668  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0368  transcriptional repressor IclR  35.77 
 
 		 277 aa  157  2e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4797  transcriptional regulator, IclR family  40 
 
 		 258 aa  156  3e-37  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2698  IclR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 280 aa  156  3e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.505501  normal  0.569064 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4491  transcriptional repressor IclR  35.84 
 
 		 276 aa  155  4e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.880691  normal  0.328338 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0370  IclR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 265 aa  155  5.0000000000000005e-37  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.470614  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2225  Transcriptional regulator IclR  38.57 
 
 		 249 aa  155  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5943  transcriptional regulator, IclR family  39.57 
 
 		 257 aa  155  7e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3776  transcriptional repressor IclR  33.47 
 
 		 276 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2527  transcriptional regulator, IclR family  36.8 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00648168  normal  0.235147 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5403  transcriptional regulator, IclR family  38.67 
 
 		 290 aa  153  2.9999999999999998e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.681342  normal  0.436291 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2702  transcriptional regulator, IclR family  36.28 
 
 		 254 aa  152  5e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7726  IclR family transcriptional regulator  36.9 
 
 		 261 aa  151  8e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2257  IclR family transcriptional regulator  38.74 
 
 		 259 aa  151  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.115222 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3952  transcriptional repressor IclR  33.06 
 
 		 277 aa  151  8.999999999999999e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.398782  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0265  transcriptional regulator, IclR family  37.28 
 
 		 264 aa  151  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_08220  transcriptional regulator, IclR family  35.63 
 
 		 257 aa  150  1e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0612  transcriptional regulator IclR  33.2 
 
 		 255 aa  151  1e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000145018 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0457  transcriptional regulator IclR  36.44 
 
 		 295 aa  150  1e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3670  IclR family transcriptional regulator  35.92 
 
 		 267 aa  150  1e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.461825  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0453  transcriptional repressor IclR  35.09 
 
 		 277 aa  150  2e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0122119  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4307  transcriptional regulator IclR  35.9 
 
 		 273 aa  150  2e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0456166 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3702  transcriptional regulator, IclR family  31.45 
 
 		 252 aa  150  2e-35  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.8457  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4604  regulatory proteins, IclR  34.4 
 
 		 251 aa  148  8e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2259  IclR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 260 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.10057  hitchhiker  0.0000000211035 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0547  transcriptional regulator, IclR family  32.75 
 
 		 265 aa  147  2.0000000000000003e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.244078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4386  transcriptional regulator, IclR family  34.63 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.7103e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3431  IclR family transcriptional regulator  34.96 
 
 		 251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0859  transcriptional regulator IclR-like protein  32.78 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0882  IclR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 246 aa  146  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2240  regulatory protein, IclR  33.74 
 
 		 262 aa  145  4.0000000000000006e-34  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2008  transcriptional regulator IclR  33.03 
 
 		 260 aa  145  9e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0504  transcriptional regulator, IclR family  32.51 
 
 		 266 aa  144  1e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2309  transcriptional regulator, IclR family  33.92 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6969  IclR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 283 aa  144  2e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.255259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1624  transcriptional regulator, IclR family  36.73 
 
 		 275 aa  144  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0668  transcriptional regulator, IclR family  35.98 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000062061  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2294  transcriptional regulator, IclR family  35.59 
 
 		 265 aa  143  3e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3210  transcriptional regulator, IclR family  34.15 
 
 		 251 aa  142  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1998  IclR family transcriptional regulator  34.71 
 
 		 250 aa  142  5e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13060  transcriptional regulator, IclR family  34.47 
 
 		 264 aa  142  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3922  regulatory proteins, IclR  33.61 
 
 		 279 aa  142  7e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.959177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1249  transcriptional regulator  32.93 
 
 		 271 aa  142  8e-33  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.568713  normal  0.308528 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1407  transcriptional regulator, IclR family  32.11 
 
 		 257 aa  139  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2510  transcriptional regulator, IclR family  34.96 
 
 		 308 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00153166  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3853  IclR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 263 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.532852  hitchhiker  0.00959131 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0223  Transcriptional regulator IclR  37.05 
 
 		 246 aa  139  6e-32  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.093608  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0458  regulatory protein, IclR  32.13 
 
 		 252 aa  139  6e-32  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0309456 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>