99 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene HY04AAS1_1444 on replicon NC_011126
Organism: Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011126  HY04AAS1_1444  hypothetical protein  100 
 
 		 642 aa  1286    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000091004  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1604  hypothetical protein  32.93 
 
 		 637 aa  292  1e-77  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000507876  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0417  hypothetical protein  25.83 
 
 		 635 aa  170  9e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.483679  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1639  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  26.18 
 
 		 620 aa  155  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  22.03 
 
 		 705 aa  62.8  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3634  TonB-dependent receptor, plug  26.71 
 
 		 668 aa  60.1  0.0000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2785  TonB-dependent receptor  28.79 
 
 		 710 aa  58.2  0.0000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  unclonable  4.99654e-18  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  21.61 
 
 		 619 aa  58.2  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  28.19 
 
 		 659 aa  56.2  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0607  TonB-dependent siderophore receptor  25.9 
 
 		 706 aa  53.5  0.00001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  22.81 
 
 		 602 aa  52.4  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2899  TonB-dependent siderophore receptor  29.73 
 
 		 689 aa  52  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.27988  normal  0.214281 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4020  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  23.76 
 
 		 615 aa  51.6  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000194494  normal  0.015002 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  26.09 
 
 		 641 aa  52  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  29.84 
 
 		 1023 aa  51.2  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1269  TonB-dependent receptor  23.76 
 
 		 710 aa  50.8  0.00007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1049  TonB-dependent siderophore receptor  19.59 
 
 		 788 aa  50.8  0.00007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  32.11 
 
 		 617 aa  50.8  0.00007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2547  TonB-dependent receptor plug  25.44 
 
 		 615 aa  50.8  0.00007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.792273  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1669  TonB-dependent receptor, plug  25.23 
 
 		 676 aa  50.8  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.164954  normal  0.124245 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0936  TonB-dependent receptor  22.03 
 
 		 715 aa  50.4  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.613823  hitchhiker  0.00136124 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2461  TonB-dependent receptor, plug  27.1 
 
 		 662 aa  50.1  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.160214  normal  0.0971358 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2550  TonB-dependent receptor plug  24.22 
 
 		 775 aa  50.1  0.0001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.182788  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4459  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.35 
 
 		 614 aa  49.3  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0519388  hitchhiker  0.0000109547 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  27.05 
 
 		 616 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2118  TonB-dependent siderophore receptor  29.45 
 
 		 704 aa  49.7  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5373  TonB-dependent outer-membrane transporter  28.57 
 
 		 661 aa  49.7  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0456572  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4414  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 639 aa  49.7  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2705  TonB-dependent siderophore receptor  39.71 
 
 		 705 aa  49.3  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  33.33 
 
 		 650 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  33.33 
 
 		 650 aa  48.5  0.0003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4382  TonB-dependent receptor  28.95 
 
 		 635 aa  48.9  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.429499  normal  0.246253 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4073  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.1 
 
 		 630 aa  48.5  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000943492  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0142  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.1 
 
 		 630 aa  48.5  0.0003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000593825  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1005  TonB-dependent receptor  29.38 
 
 		 699 aa  48.9  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.828736  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  33.33 
 
 		 650 aa  48.5  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4462  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.35 
 
 		 614 aa  48.5  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0180001  hitchhiker  0.0000000000824718 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  33.33 
 
 		 650 aa  48.5  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4536  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.35 
 
 		 614 aa  48.5  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.329693  hitchhiker  0.0000000267555 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  33.33 
 
 		 650 aa  48.5  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4372  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.35 
 
 		 614 aa  48.5  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0258695  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6866  TonB-dependent siderophore receptor  21.35 
 
 		 748 aa  48.5  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4341  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  25.35 
 
 		 614 aa  48.5  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.139999  normal  0.582372 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2068  TonB-dependent siderophore receptor  26.54 
 
 		 722 aa  47.8  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.500479  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3960  TonB-dependent receptor, plug  23.6 
 
 		 741 aa  47.8  0.0006  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3867  TonB-dependent receptor, plug  23.6 
 
 		 729 aa  47.8  0.0006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0131  TonB-dependent receptor, plug  25.74 
 
 		 677 aa  47.8  0.0006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.184061  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  25.41 
 
 		 657 aa  47.8  0.0006  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3457  TonB-dependent siderophore receptor  38.24 
 
 		 707 aa  47.4  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.343998  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4064  TonB-dependent siderophore receptor  38.24 
 
 		 707 aa  47.4  0.0009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  31.58 
 
 		 663 aa  47  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  31.58 
 
 		 659 aa  47.4  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  31.58 
 
 		 663 aa  47  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  21.9 
 
 		 648 aa  47  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0576  TonB-dependent receptor plug  28.45 
 
 		 621 aa  47  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02469  ferrisiderophore receptor protein  26.62 
 
 		 695 aa  46.6  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3203  TonB-dependent siderophore receptor  29.63 
 
 		 694 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  31.58 
 
 		 641 aa  47  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  26.57 
 
 		 631 aa  47  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  31.58 
 
 		 663 aa  47  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  31.58 
 
 		 663 aa  47  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  31.58 
 
 		 663 aa  47  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0715  TonB-dependent siderophore receptor  28.46 
 
 		 698 aa  47  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.133381 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  31.58 
 
 		 663 aa  47  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4310  TonB-dependent receptor plug  22.98 
 
 		 737 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5058  TonB-dependent siderophore receptor  29.63 
 
 		 715 aa  46.6  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.00424318  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1231  TonB-dependent receptor  23.12 
 
 		 678 aa  46.2  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0883  ferric enterobactin receptor, putative  27.08 
 
 		 627 aa  46.6  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.277897  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2372  TonB-dependent receptor, plug  24.66 
 
 		 642 aa  45.4  0.003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.286336 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3465  TonB-dependent siderophore receptor  23.97 
 
 		 757 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4000  TonB-dependent siderophore receptor  24.39 
 
 		 722 aa  45.4  0.003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0509  TonB-dependent outer membrane cobalamin receptor  25.93 
 
 		 614 aa  45.4  0.003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.194967  normal  0.193806 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0089  TonB-dependent receptor, plug  22.98 
 
 		 707 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4010  TonB-dependent receptor, plug  25.23 
 
 		 678 aa  45.8  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.481444  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4008  TonB-dependent receptor, plug  23.36 
 
 		 680 aa  45.8  0.003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4376  TonB-dependent siderophore receptor  26.23 
 
 		 706 aa  45.8  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0886158 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4266  TonB-dependent siderophore receptor  26.23 
 
 		 706 aa  45.8  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.569556  normal  0.280378 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0458  TonB-dependent siderophore receptor  24.39 
 
 		 705 aa  45.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4056  TonB-dependent siderophore receptor  23.97 
 
 		 709 aa  45.8  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4450  TonB-dependent receptor plug  22.98 
 
 		 767 aa  45.8  0.003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3916  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 642 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1412  TonB-dependent siderophore receptor family protein  25.97 
 
 		 822 aa  45.1  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2970  TonB-dependent receptor protein  24.54 
 
 		 651 aa  45.1  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.140883  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4452  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 642 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5855  TonB-dependent receptor  24.79 
 
 		 642 aa  45.1  0.004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.699256  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4255  TonB-dependent receptor plug  22.98 
 
 		 749 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0907  TonB-dependent siderophore receptor  27.52 
 
 		 712 aa  44.7  0.005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892024  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2878  TonB-dependent siderophore receptor  26.85 
 
 		 707 aa  45.1  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1502  ferrichrome outer membrane transporter  21.2 
 
 		 729 aa  44.7  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  24.03 
 
 		 613 aa  44.7  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0131  TonB-dependent receptor  25.42 
 
 		 695 aa  44.3  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0690  ferrichrome outer membrane transporter  21.43 
 
 		 747 aa  44.7  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  21.67 
 
 		 746 aa  44.3  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0227  TonB-dependent siderophore receptor  32.43 
 
 		 738 aa  44.3  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4770  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  24.3 
 
 		 623 aa  44.7  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000262019  normal  0.0314633 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0488  TonB-dependent receptor  24.11 
 
 		 682 aa  44.7  0.006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  19.35 
 
 		 695 aa  44.7  0.006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52230  outer membrane receptor FepA  22.84 
 
 		 742 aa  43.9  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.267722 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3716  TonB-dependent receptor, plug  28.89 
 
 		 527 aa  43.9  0.01  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0878035  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>