17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1639 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_1639  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  100 
 
 
620 aa  1252    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1604  hypothetical protein  27.88 
 
 
637 aa  182  2e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000507876  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1444  hypothetical protein  26.18 
 
 
642 aa  155  2e-36  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000091004  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0417  hypothetical protein  26.11 
 
 
635 aa  148  3e-34  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.483679  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0560  TonB-dependent receptor, plug  21.95 
 
 
623 aa  49.7  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02166  TonB-dependent outer membrane Receptor  23.95 
 
 
619 aa  49.3  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  27.07 
 
 
614 aa  48.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  28.95 
 
 
702 aa  47.8  0.0006  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1964  TonB-dependent receptor, plug  27.38 
 
 
618 aa  46.6  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0525  B12 family TonB-dependent receptor  21.12 
 
 
641 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1502  TonB-dependent receptor  22 
 
 
613 aa  45.8  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  23.4 
 
 
616 aa  45.8  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0571  TonB-dependent receptor plug  24.07 
 
 
628 aa  44.7  0.006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.487741  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3623  TonB-dependent heme/hemoglobin receptor family protein  24.69 
 
 
669 aa  44.3  0.007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  25.74 
 
 
799 aa  44.3  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0578  TonB-dependent receptor plug  24.37 
 
 
627 aa  43.9  0.009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2648  TonB-dependent receptor  22.15 
 
 
602 aa  43.5  0.01  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>