22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sdel_0417 on replicon NC_013512
Organism: Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013512  Sdel_0417  hypothetical protein  100 
 
 		 635 aa  1284    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.483679  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1604  hypothetical protein  29.25 
 
 		 637 aa  255  2.0000000000000002e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000507876  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1444  hypothetical protein  25.52 
 
 		 642 aa  176  9.999999999999999e-43  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000091004  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1639  Outer membrane cobalamin receptor protein-like  26.5 
 
 		 620 aa  155  2e-36  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2751  TonB domain-containing protein  22.34 
 
 		 641 aa  77.4  0.0000000000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.421886  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4602  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 699 aa  57  0.0000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.696133  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4468  TonB-dependent receptor  26.67 
 
 		 671 aa  57.4  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0659683  normal  0.254173 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_33130  TonB-dependent vitamin B12 receptor  24.05 
 
 		 1023 aa  54.3  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3850  TonB-dependent receptor  23.08 
 
 		 671 aa  50.8  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.302325  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1115  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 705 aa  50.4  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  23.74 
 
 		 617 aa  48.9  0.0003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_47800  putative tonB-dependent receptor  24.1 
 
 		 616 aa  47.8  0.0007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.173562  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0635  TonB-dependent receptor, plug  24.66 
 
 		 706 aa  47.4  0.0008  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0552  TonB-dependent receptor, plug  21.82 
 
 		 653 aa  47.4  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0628  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 688 aa  47  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2952  TonB-dependent receptor  21.94 
 
 		 645 aa  47  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.771516  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0790  TonB-dependent receptor  24.68 
 
 		 614 aa  46.2  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.270148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  24.22 
 
 		 633 aa  45.8  0.002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3556  TonB-dependent receptor plug  26.47 
 
 		 634 aa  44.3  0.007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000211979  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  23.38 
 
 		 649 aa  43.9  0.008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2815  TonB-dependent receptor  26.09 
 
 		 619 aa  43.9  0.009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.186668  normal  0.478128 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0812  TonB-dependent receptor plug  25.23 
 
 		 659 aa  43.9  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.183722  normal  0.24775 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>