More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0509 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0509  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 359 aa  745    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000294869  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0244  Radical SAM domain protein  26.48 
 
 		 342 aa  100  4e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0305821  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1807  radical SAM domain-containing protein  25.48 
 
 		 363 aa  90.9  3e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2586  radical SAM domain-containing protein  24.55 
 
 		 318 aa  89.4  9e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0586  radical SAM family protein  27.13 
 
 		 350 aa  85.1  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  26.13 
 
 		 390 aa  84  0.000000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1099  radical SAM domain-containing protein  25.42 
 
 		 501 aa  82  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2159  radical SAM domain-containing protein  25.8 
 
 		 330 aa  80.9  0.00000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0939338  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  25.89 
 
 		 479 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  29.41 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1255  Radical SAM domain protein  26.03 
 
 		 330 aa  77  0.0000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.411599  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1309  radical SAM family protein  23.91 
 
 		 357 aa  76.3  0.0000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4323  radical SAM family protein  23.37 
 
 		 373 aa  75.5  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0913  Radical SAM domain protein  25.08 
 
 		 361 aa  74.7  0.000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.525618  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3559  radical SAM domain-containing protein  25.4 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.152847  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1256  Radical SAM domain protein  26.16 
 
 		 330 aa  74.3  0.000000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3173  putative nitrite reductase heme biosynthesis J protein  30.11 
 
 		 404 aa  72.8  0.000000000009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.992211 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0324  Radical SAM domain protein  22.85 
 
 		 480 aa  72.4  0.00000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0755362  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0879  radical SAM domain-containing protein  27.59 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.11149  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0690  Radical SAM domain protein  23.56 
 
 		 496 aa  70.9  0.00000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0912  Radical SAM domain protein  28.42 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000005  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.492815  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3130  radical SAM domain-containing protein  29.05 
 
 		 404 aa  69.7  0.00000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2079  Radical SAM domain protein  23.37 
 
 		 333 aa  68.9  0.0000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000100022 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  25.77 
 
 		 326 aa  69.3  0.0000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12330  predicted Fe-S oxidoreductase  24 
 
 		 561 aa  68.9  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  25.17 
 
 		 360 aa  69.3  0.0000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1793  metallo cofactor biosynthesis protein  27.18 
 
 		 399 aa  68.2  0.0000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.91522  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  23.29 
 
 		 323 aa  68.2  0.0000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1914  Radical SAM domain protein  26.21 
 
 		 376 aa  67.8  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1245  radical SAM family protein  25 
 
 		 335 aa  67.8  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.394622 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2391  Radical SAM domain protein  29.05 
 
 		 397 aa  67.8  0.0000000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1247  radical SAM family protein  26.67 
 
 		 355 aa  67  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.421544 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2626  Radical SAM domain protein  25.51 
 
 		 381 aa  66.6  0.0000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.024935 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0122  Radical SAM domain protein  25.32 
 
 		 344 aa  66.2  0.0000000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1951  radical SAM family Fe-S protein  23.1 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0506  radical SAM domain-containing protein  23.55 
 
 		 355 aa  66.2  0.0000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3350  Radical SAM domain protein  26.16 
 
 		 332 aa  66.2  0.0000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1135  radical SAM domain-containing protein  24.73 
 
 		 325 aa  65.9  0.000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1128  Radical SAM domain protein  23.55 
 
 		 327 aa  65.9  0.000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.823251 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0919  radical SAM domain-containing protein  24.62 
 
 		 338 aa  65.1  0.000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  26.19 
 
 		 565 aa  65.1  0.000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0289  Radical SAM domain protein  28.42 
 
 		 394 aa  65.1  0.000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.815066  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3261  radical SAM family protein  25 
 
 		 379 aa  64.3  0.000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3415  Radical SAM domain protein  23.01 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2921  radical SAM domain-containing protein  23.45 
 
 		 324 aa  64.3  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.925202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2688  Radical SAM domain protein  23.01 
 
 		 423 aa  64.3  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2953  Radical SAM domain protein  27.14 
 
 		 439 aa  63.9  0.000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11630  predicted Fe-S oxidoreductase  25.11 
 
 		 397 aa  63.9  0.000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.790216 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1953  Radical SAM domain protein  29.84 
 
 		 394 aa  63.9  0.000000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.66123 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1906  radical SAM domain-containing protein  27.15 
 
 		 406 aa  63.9  0.000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.9961 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  26.1 
 
 		 380 aa  63.5  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1711  Radical SAM domain protein  27.15 
 
 		 406 aa  63.5  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.219592  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1347  radical SAM domain-containing protein  24.24 
 
 		 384 aa  63.5  0.000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4227  putative heme biosynthesis protein  27.47 
 
 		 410 aa  63.2  0.000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.363592  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.73 
 
 		 298 aa  63.2  0.000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3058  radical SAM domain-containing protein  25.77 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.795834  normal  0.23867 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4322  radical SAM family protein  23.21 
 
 		 359 aa  62.8  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.564384  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  22.39 
 
 		 428 aa  62.8  0.000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1223  radical SAM domain-containing protein  26.3 
 
 		 358 aa  62.8  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0147811  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1506  Radical SAM domain protein  25.36 
 
 		 333 aa  62  0.00000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.241767 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  25.94 
 
 		 330 aa  62.4  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  26.25 
 
 		 481 aa  62.4  0.00000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2128  radical SAM domain-containing protein  24.49 
 
 		 405 aa  62  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.194536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0393  metallo cofactor biosynthesis protein  26.02 
 
 		 393 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2575  Elongator protein 3/MiaB/NifB  26.6 
 
 		 394 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2955  Radical SAM domain protein  30.5 
 
 		 475 aa  61.2  0.00000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.807752  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  25.89 
 
 		 457 aa  61.6  0.00000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  30.43 
 
 		 387 aa  62  0.00000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0958  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 		 356 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  30.43 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1335  hypothetical protein  31.71 
 
 		 363 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.861062 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0071  Elongator protein 3/MiaB/NifB  25.34 
 
 		 399 aa  61.2  0.00000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.180935  normal  0.590405 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.88 
 
 		 335 aa  60.8  0.00000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4564  molybdenum cofactor synthesis-like  26.2 
 
 		 340 aa  60.8  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1913  Radical SAM domain protein  24.74 
 
 		 364 aa  60.5  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1767  radical SAM domain-containing protein  22.67 
 
 		 333 aa  60.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.186252  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1559  Radical SAM domain protein  31.65 
 
 		 327 aa  60.5  0.00000004  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2126  radical SAM domain-containing protein  26.88 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.117429  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1782  Radical SAM domain protein  30.41 
 
 		 404 aa  60.5  0.00000005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4492  Radical SAM domain protein  22.41 
 
 		 460 aa  60.5  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.153991  normal  0.0565392 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2244  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  34.48 
 
 		 326 aa  60.1  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.555933  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2861  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.16 
 
 		 329 aa  60.1  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.228383  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3060  radical SAM domain-containing protein  24.6 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.738512  normal  0.173999 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2836  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.51 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1434  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.51 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1236  radical SAM family Fe-S protein  23.67 
 
 		 397 aa  59.7  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2922  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.51 
 
 		 326 aa  59.7  0.00000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.347624  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3056  radical SAM domain-containing protein  27.37 
 
 		 393 aa  59.7  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.228039 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  22.37 
 
 		 323 aa  59.7  0.00000008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1345  radical SAM domain-containing protein  28.37 
 
 		 394 aa  59.3  0.00000009  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.736537  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2423  radical SAM family protein  24.19 
 
 		 473 aa  59.3  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000017109  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2100  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.9 
 
 		 334 aa  59.3  0.00000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0691  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 		 333 aa  59.7  0.00000009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0804  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.7 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00174086  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0511  radical SAM domain-containing protein  27.96 
 
 		 366 aa  59.3  0.0000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00485755  decreased coverage  0.00020138 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0896  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.37 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0829  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.6 
 
 		 314 aa  59.3  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00765  hypothetical protein  40.7 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0844  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  40.7 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0987442  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0837  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.46 
 
 		 329 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>