61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gobs_3430 on replicon NC_013757
Organism: Geodermatophilus obscurus DSM 43160



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  100 
 
 		 783 aa  1433    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  35.3 
 
 		 801 aa  297  6e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  35.61 
 
 		 793 aa  292  2e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  36.56 
 
 		 843 aa  257  8e-67  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3265  hypothetical protein  35.78 
 
 		 859 aa  241  4e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1576  hypothetical protein  35.39 
 
 		 809 aa  224  4.9999999999999996e-57  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.299952  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4032  integral membrane protein  36.94 
 
 		 916 aa  220  7e-56  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7814  hypothetical protein  32.87 
 
 		 854 aa  214  4.9999999999999996e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2505  hypothetical protein  32.99 
 
 		 862 aa  211  4e-53  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.937281  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1204  hypothetical protein  34.05 
 
 		 795 aa  201  5e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5132  hypothetical protein  34.4 
 
 		 803 aa  199  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  35.03 
 
 		 773 aa  197  6e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_36260  hypothetical protein  35.73 
 
 		 872 aa  183  1e-44  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  32.72 
 
 		 792 aa  182  2e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10596  integral membrane protein  33.39 
 
 		 795 aa  172  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  27.88 
 
 		 853 aa  150  1.0000000000000001e-34  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0892  hypothetical protein  33.28 
 
 		 787 aa  145  4e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0229028  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0909  hypothetical protein  33.28 
 
 		 787 aa  145  4e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0898  hypothetical protein  33.1 
 
 		 787 aa  144  5e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.272517  hitchhiker  0.00789103 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  27.23 
 
 		 811 aa  135  3e-30  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3255  hypothetical protein  36.71 
 
 		 313 aa  132  3e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2924  hypothetical protein  32.34 
 
 		 293 aa  88.6  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5628  integral membrane protein-like protein  30.04 
 
 		 442 aa  84.3  0.000000000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.110231  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3856  hypothetical protein  32.26 
 
 		 329 aa  82.8  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213587  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0917  hypothetical protein  30.58 
 
 		 447 aa  79  0.0000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0170  hypothetical protein  30.25 
 
 		 318 aa  60.5  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02480  cation-translocating P-type ATPase with extended N-terminal transmembrane region  34.81 
 
 		 1195 aa  60.1  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4483  hypothetical protein  39.66 
 
 		 392 aa  60.1  0.0000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.325308  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  35.46 
 
 		 345 aa  59.3  0.0000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  33.33 
 
 		 345 aa  55.5  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0352  hypothetical protein  35.54 
 
 		 396 aa  53.9  0.00001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  32.56 
 
 		 346 aa  52.4  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2596  hypothetical protein  31.5 
 
 		 247 aa  52  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4203  hypothetical protein  41.1 
 
 		 374 aa  51.6  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0828  hypothetical protein  32.9 
 
 		 339 aa  51.2  0.00008  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175071  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  22.88 
 
 		 351 aa  50.1  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0458  hypothetical protein  34.13 
 
 		 367 aa  50.8  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.744609 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2627  hypothetical protein  29.81 
 
 		 355 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0802533  normal  0.461146 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1456  hypothetical protein  28.57 
 
 		 851 aa  49.7  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.291506  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4270  hypothetical protein  24.58 
 
 		 370 aa  48.9  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.57819 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1947  hypothetical protein  25 
 
 		 315 aa  48.9  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.789852  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0158  hypothetical protein  32.31 
 
 		 378 aa  48.5  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0251545 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3452  membrane protein  31.23 
 
 		 397 aa  48.9  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3520  hypothetical protein  39.51 
 
 		 339 aa  48.5  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0168  hypothetical protein  32.31 
 
 		 378 aa  48.1  0.0006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0177  hypothetical protein  32.31 
 
 		 378 aa  48.1  0.0006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.89202 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0194  hypothetical protein  31.71 
 
 		 392 aa  48.1  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.327389  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1457  hypothetical protein  30.88 
 
 		 322 aa  48.1  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  decreased coverage  0.000494254  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1230  hypothetical protein  48.08 
 
 		 337 aa  47.4  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000527304 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0580  hypothetical protein  43.64 
 
 		 329 aa  47.4  0.001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.236014  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3761  membrane protein  32.26 
 
 		 377 aa  47.4  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1258  hypothetical protein  26.19 
 
 		 851 aa  47.4  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.0075337  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2438  protein of unknown function DUF470  34.12 
 
 		 862 aa  46.2  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.298386  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1703  hypothetical protein  37.7 
 
 		 335 aa  46.2  0.002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7630  hypothetical protein  33.57 
 
 		 353 aa  45.8  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.509721  normal  0.24257 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10206  transmembrane protein  34.92 
 
 		 427 aa  45.4  0.004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.652566 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2377  hypothetical protein  33.02 
 
 		 362 aa  45.1  0.005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.436987  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  18.83 
 
 		 318 aa  45.1  0.006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2033  transmembrane protein, LpiA-like  40 
 
 		 850 aa  44.7  0.007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.358436  normal  0.36986 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4150  hypothetical protein  40 
 
 		 864 aa  44.7  0.008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.155507  normal  0.123779 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3650  membrane protein  31.39 
 
 		 377 aa  44.3  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0534573 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>