80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3761 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_3650  membrane protein  90.45 
 
 		 377 aa  655    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3761  membrane protein  100 
 
 		 377 aa  725    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3452  membrane protein  99.47 
 
 		 397 aa  723    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0976  membrane protein  63.4 
 
 		 370 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7151  membrane protein  63.53 
 
 		 361 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6336  membrane protein  66.06 
 
 		 358 aa  369  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1748  hypothetical protein  41.56 
 
 		 338 aa  211  2e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00143942  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1912  hypothetical protein  39.06 
 
 		 333 aa  176  6e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4018  membrane protein  39.06 
 
 		 333 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.581162 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3537  hypothetical protein  39.06 
 
 		 333 aa  173  5e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4469  membrane protein  39.31 
 
 		 333 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  normal  0.606564 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3396  membrane protein  38.75 
 
 		 333 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4123  hypothetical protein  38.75 
 
 		 333 aa  172  9e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.574237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1906  hypothetical protein  39.75 
 
 		 328 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1863  hypothetical protein  37.23 
 
 		 333 aa  169  1e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0782  hypothetical protein  38.49 
 
 		 333 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0693  hypothetical protein  38.49 
 
 		 333 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1766  hypothetical protein  38.49 
 
 		 328 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2068  hypothetical protein  38.49 
 
 		 328 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0449964  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2024  hypothetical protein  38.87 
 
 		 333 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241047  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1049  hypothetical protein  38.87 
 
 		 328 aa  166  8e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3273  membrane protein  41.69 
 
 		 353 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5051  hypothetical protein  37.42 
 
 		 355 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3872  membrane protein  37.97 
 
 		 329 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0756  hypothetical protein  40.46 
 
 		 286 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4298  hypothetical protein  37.46 
 
 		 339 aa  159  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.09392  normal  0.365845 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1805  hypothetical protein  36.76 
 
 		 332 aa  159  9e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4083  hypothetical protein  36.31 
 
 		 387 aa  158  1e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0934508  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0626  hypothetical protein  36.73 
 
 		 339 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0246806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4451  hypothetical protein  36.31 
 
 		 387 aa  157  4e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4564  hypothetical protein  36.08 
 
 		 400 aa  155  1e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2707  membrane protein  45.36 
 
 		 362 aa  151  2e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.813899  normal  0.272073 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2117  hypothetical protein  39.33 
 
 		 338 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.836019  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1776  membrane protein  39.33 
 
 		 343 aa  151  2e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4243  hypothetical protein  38.24 
 
 		 290 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20680  hypothetical protein  32.71 
 
 		 333 aa  142  8e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1831  hypothetical protein  33.13 
 
 		 362 aa  137  4e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2064  hypothetical protein  32.1 
 
 		 331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.263177 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3410  hypothetical protein  32.42 
 
 		 329 aa  134  3e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4903  hypothetical protein  32.13 
 
 		 333 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10734  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2199  membrane protein  32.84 
 
 		 331 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7078  hypothetical protein  34.87 
 
 		 323 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59894 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0122  hypothetical protein  34.14 
 
 		 349 aa  123  5e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3018  hypothetical protein  30.86 
 
 		 356 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3329  hypothetical protein  30.86 
 
 		 356 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306679  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0293  hypothetical protein  30.75 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2075  hypothetical protein  30.86 
 
 		 326 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0487  hypothetical protein  30.75 
 
 		 342 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0263  hypothetical protein  31.21 
 
 		 345 aa  116  6e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.611411  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0306  hypothetical protein  30.75 
 
 		 326 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1177  hypothetical protein  31.79 
 
 		 351 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2131  hypothetical protein  33.44 
 
 		 343 aa  109  6e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123953  normal  0.732304 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0472  hypothetical protein  31.05 
 
 		 362 aa  109  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1055  hypothetical protein  33.12 
 
 		 347 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1149  hypothetical protein  32.7 
 
 		 349 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.520075 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0694  hypothetical protein  32.6 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110273  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1173  hypothetical protein  32.6 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5079  membrane protein  31.05 
 
 		 362 aa  106  8e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1052  hypothetical protein  32.17 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0582616  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4285  hypothetical protein  32.36 
 
 		 347 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1769  hypothetical protein  31.72 
 
 		 348 aa  97.8  3e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1752  hypothetical protein  31.72 
 
 		 348 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0575  hypothetical protein  31.72 
 
 		 348 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2794  hypothetical protein  31.72 
 
 		 348 aa  95.5  2e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2735  hypothetical protein  31.72 
 
 		 348 aa  95.1  2e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2850  hypothetical protein  31.72 
 
 		 348 aa  95.5  2e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2857  hypothetical protein  35.12 
 
 		 348 aa  94.4  3e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0387  hypothetical protein  30.26 
 
 		 335 aa  83.6  0.000000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1653  hypothetical protein  25.65 
 
 		 319 aa  71.2  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0319588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2186  hypothetical protein  26.69 
 
 		 340 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3526  hypothetical protein  27.27 
 
 		 326 aa  64.7  0.000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0973  hypothetical protein  26.67 
 
 		 360 aa  62.8  0.000000009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0338  hypothetical protein  34.31 
 
 		 365 aa  60.8  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.171293 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  19.93 
 
 		 338 aa  54.7  0.000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2922  hypothetical protein  25 
 
 		 338 aa  51.6  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.803043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1134  hypothetical protein  23.71 
 
 		 354 aa  49.3  0.0001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0518048  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2550  hypothetical protein  22.14 
 
 		 347 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1022  hypothetical protein  24.08 
 
 		 353 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.269523 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1486  hypothetical protein  26.09 
 
 		 351 aa  43.5  0.006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2970  hypothetical protein  29.88 
 
 		 342 aa  43.1  0.008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.793955  normal  0.145955 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>