79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mext_4083 on replicon NC_010172
Organism: Methylobacterium extorquens PA1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010172  Mext_4083  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  719    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0934508  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4451  hypothetical protein  98.97 
 
 		 387 aa  714    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4564  hypothetical protein  83.5 
 
 		 400 aa  546  1e-154  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5051  hypothetical protein  64.55 
 
 		 355 aa  379  1e-104  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3273  membrane protein  57.62 
 
 		 353 aa  327  2.0000000000000001e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2707  membrane protein  56.98 
 
 		 362 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.813899  normal  0.272073 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3650  membrane protein  37.57 
 
 		 377 aa  178  1e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3452  membrane protein  36.9 
 
 		 397 aa  176  5e-43  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3761  membrane protein  36.72 
 
 		 377 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7151  membrane protein  41.64 
 
 		 361 aa  173  5e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6336  membrane protein  44.4 
 
 		 358 aa  160  3e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0976  membrane protein  35.84 
 
 		 370 aa  160  3e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2064  hypothetical protein  38.35 
 
 		 331 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.263177 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2199  membrane protein  38.35 
 
 		 331 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1863  hypothetical protein  37.57 
 
 		 333 aa  138  2e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0122  hypothetical protein  35.14 
 
 		 349 aa  128  1.0000000000000001e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1748  hypothetical protein  37.93 
 
 		 338 aa  127  3e-28  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00143942  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0293  hypothetical protein  32.58 
 
 		 356 aa  124  3e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3018  hypothetical protein  32.58 
 
 		 356 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7078  hypothetical protein  35.05 
 
 		 323 aa  124  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59894 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3329  hypothetical protein  32.58 
 
 		 356 aa  124  3e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306679  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2075  hypothetical protein  32.95 
 
 		 326 aa  123  6e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0306  hypothetical protein  32.95 
 
 		 326 aa  123  6e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0263  hypothetical protein  32.49 
 
 		 345 aa  122  8e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.611411  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0487  hypothetical protein  32.3 
 
 		 342 aa  122  8e-27  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5079  membrane protein  34.78 
 
 		 362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1912  hypothetical protein  35.34 
 
 		 333 aa  113  6e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3537  hypothetical protein  35.07 
 
 		 333 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0472  hypothetical protein  34.39 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20680  hypothetical protein  31.25 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3396  membrane protein  35.58 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4123  hypothetical protein  35.58 
 
 		 333 aa  110  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.574237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1776  membrane protein  34.57 
 
 		 343 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2117  hypothetical protein  34.57 
 
 		 338 aa  108  1e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.836019  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4018  membrane protein  34.7 
 
 		 333 aa  107  3e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.581162 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1805  hypothetical protein  36.05 
 
 		 332 aa  106  8e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0756  hypothetical protein  35.96 
 
 		 286 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1049  hypothetical protein  35.96 
 
 		 328 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2024  hypothetical protein  35.96 
 
 		 333 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241047  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1766  hypothetical protein  35.96 
 
 		 328 aa  104  3e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0693  hypothetical protein  35.96 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0782  hypothetical protein  35.96 
 
 		 333 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2068  hypothetical protein  35.96 
 
 		 328 aa  104  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0449964  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4469  membrane protein  33.96 
 
 		 333 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  normal  0.606564 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1906  hypothetical protein  34.32 
 
 		 328 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4903  hypothetical protein  31.54 
 
 		 333 aa  99.8  8e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10734  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1177  hypothetical protein  32.81 
 
 		 351 aa  97.4  4e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1831  hypothetical protein  27.1 
 
 		 362 aa  96.3  7e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4298  hypothetical protein  34.1 
 
 		 339 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.09392  normal  0.365845 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3872  membrane protein  36.36 
 
 		 329 aa  95.5  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0626  hypothetical protein  34.02 
 
 		 339 aa  93.6  6e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0246806 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4243  hypothetical protein  34.55 
 
 		 290 aa  92.8  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3410  hypothetical protein  28.21 
 
 		 329 aa  87.4  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4285  hypothetical protein  29.1 
 
 		 347 aa  86.3  9e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1149  hypothetical protein  28.36 
 
 		 349 aa  82.8  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.520075 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0694  hypothetical protein  29.1 
 
 		 352 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110273  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1173  hypothetical protein  29.1 
 
 		 352 aa  82.8  0.00000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2131  hypothetical protein  30.22 
 
 		 343 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123953  normal  0.732304 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1052  hypothetical protein  27.61 
 
 		 347 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0582616  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0387  hypothetical protein  31.56 
 
 		 335 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1752  hypothetical protein  31.92 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2857  hypothetical protein  31.92 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0575  hypothetical protein  31.92 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2850  hypothetical protein  31.92 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2794  hypothetical protein  31.92 
 
 		 348 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2735  hypothetical protein  31.92 
 
 		 348 aa  70.9  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1769  hypothetical protein  32.18 
 
 		 348 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2186  hypothetical protein  27.81 
 
 		 340 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0338  hypothetical protein  33.33 
 
 		 365 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.171293 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2922  hypothetical protein  27.99 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.803043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1653  hypothetical protein  25.08 
 
 		 319 aa  55.1  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0319588  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1390  hypothetical protein  27.68 
 
 		 412 aa  50.4  0.00005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1022  hypothetical protein  34.38 
 
 		 353 aa  50.4  0.00005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.269523 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3526  hypothetical protein  28.11 
 
 		 326 aa  50.1  0.00006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1134  hypothetical protein  26.05 
 
 		 354 aa  48.5  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0518048  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1516  hypothetical protein  29.46 
 
 		 353 aa  48.5  0.0002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1486  hypothetical protein  33.75 
 
 		 351 aa  47.8  0.0003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2550  hypothetical protein  26.19 
 
 		 347 aa  46.6  0.0007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0973  hypothetical protein  29.76 
 
 		 360 aa  45.1  0.002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>