74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0387 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0387  hypothetical protein  100 
 
 		 335 aa  647    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0575  hypothetical protein  72.47 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2794  hypothetical protein  72.47 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1752  hypothetical protein  72.47 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2735  hypothetical protein  72.15 
 
 		 348 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2850  hypothetical protein  72.47 
 
 		 348 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2857  hypothetical protein  72.15 
 
 		 348 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4285  hypothetical protein  71.16 
 
 		 347 aa  412  1e-114  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1052  hypothetical protein  71.16 
 
 		 347 aa  410  1e-113  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0582616  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1149  hypothetical protein  70.22 
 
 		 349 aa  407  1e-113  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.520075 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1055  hypothetical protein  70.53 
 
 		 347 aa  409  1e-113  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1769  hypothetical protein  71.88 
 
 		 348 aa  409  1e-113  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1173  hypothetical protein  70.22 
 
 		 352 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0694  hypothetical protein  70.22 
 
 		 352 aa  406  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110273  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2131  hypothetical protein  69.28 
 
 		 343 aa  402  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123953  normal  0.732304 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1177  hypothetical protein  67.19 
 
 		 351 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3410  hypothetical protein  50.17 
 
 		 329 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4903  hypothetical protein  53.75 
 
 		 333 aa  265  1e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10734  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20680  hypothetical protein  47.08 
 
 		 333 aa  264  2e-69  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1776  membrane protein  39.32 
 
 		 343 aa  162  8.000000000000001e-39  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2117  hypothetical protein  39.32 
 
 		 338 aa  162  1e-38  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.836019  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0472  hypothetical protein  34.28 
 
 		 362 aa  134  1.9999999999999998e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1748  hypothetical protein  33.95 
 
 		 338 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00143942  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3872  membrane protein  31.77 
 
 		 329 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4018  membrane protein  34.41 
 
 		 333 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.581162 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1805  hypothetical protein  31.23 
 
 		 332 aa  122  7e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3537  hypothetical protein  34.41 
 
 		 333 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4123  hypothetical protein  35.05 
 
 		 333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.574237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5079  membrane protein  34.07 
 
 		 362 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2064  hypothetical protein  34.37 
 
 		 331 aa  119  6e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.263177 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3396  membrane protein  34.73 
 
 		 333 aa  119  9e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0626  hypothetical protein  31.56 
 
 		 339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0246806 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4469  membrane protein  34.08 
 
 		 333 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  normal  0.606564 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3650  membrane protein  31.68 
 
 		 377 aa  116  6e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1912  hypothetical protein  33.87 
 
 		 333 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2024  hypothetical protein  33.97 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241047  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1766  hypothetical protein  33.97 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0693  hypothetical protein  33.97 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0782  hypothetical protein  33.97 
 
 		 333 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2068  hypothetical protein  33.97 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0449964  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1049  hypothetical protein  33.97 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0263  hypothetical protein  31.37 
 
 		 345 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.611411  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4298  hypothetical protein  31.58 
 
 		 339 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.09392  normal  0.365845 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0487  hypothetical protein  33.44 
 
 		 342 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1906  hypothetical protein  33.44 
 
 		 328 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3329  hypothetical protein  33.44 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306679  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0293  hypothetical protein  33.44 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3018  hypothetical protein  33.44 
 
 		 356 aa  114  3e-24  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2199  membrane protein  33.75 
 
 		 331 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0306  hypothetical protein  33.44 
 
 		 326 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7078  hypothetical protein  33.7 
 
 		 323 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59894 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2075  hypothetical protein  33.44 
 
 		 326 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3761  membrane protein  30.55 
 
 		 377 aa  113  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3452  membrane protein  30.26 
 
 		 397 aa  112  9e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1863  hypothetical protein  30.29 
 
 		 333 aa  110  4.0000000000000004e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7151  membrane protein  32.21 
 
 		 361 aa  109  8.000000000000001e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0976  membrane protein  31.25 
 
 		 370 aa  108  1e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2707  membrane protein  36.29 
 
 		 362 aa  101  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.813899  normal  0.272073 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5051  hypothetical protein  33.22 
 
 		 355 aa  101  1e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4243  hypothetical protein  35.21 
 
 		 290 aa  99  9e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0756  hypothetical protein  34.05 
 
 		 286 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4083  hypothetical protein  31.3 
 
 		 387 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0934508  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4451  hypothetical protein  31.3 
 
 		 387 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3273  membrane protein  33.78 
 
 		 353 aa  96.7  5e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4564  hypothetical protein  31.95 
 
 		 400 aa  94  3e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0122  hypothetical protein  31.27 
 
 		 349 aa  92.8  7e-18  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6336  membrane protein  33.33 
 
 		 358 aa  90.5  4e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2186  hypothetical protein  29.33 
 
 		 340 aa  71.2  0.00000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1831  hypothetical protein  26.47 
 
 		 362 aa  68.9  0.0000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3526  hypothetical protein  28.12 
 
 		 326 aa  62.8  0.000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2922  hypothetical protein  24.26 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.803043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0973  hypothetical protein  25.39 
 
 		 360 aa  55.1  0.000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1653  hypothetical protein  26.54 
 
 		 319 aa  54.3  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0319588  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0338  hypothetical protein  31.51 
 
 		 365 aa  54.3  0.000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.171293 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>