64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sfum_2922 on replicon NC_008554
Organism: Syntrophobacter fumaroxidans MPOB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008554  Sfum_2922  hypothetical protein  100 
 
 		 338 aa  676    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.803043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2550  hypothetical protein  26.69 
 
 		 347 aa  90.9  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1653  hypothetical protein  26.94 
 
 		 319 aa  76.3  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0319588  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1748  hypothetical protein  23.78 
 
 		 338 aa  75.9  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00143942  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3526  hypothetical protein  29.7 
 
 		 326 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4903  hypothetical protein  29.06 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10734  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20680  hypothetical protein  25.89 
 
 		 333 aa  71.6  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2117  hypothetical protein  26.29 
 
 		 338 aa  67  0.0000000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.836019  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1776  membrane protein  26.29 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000006  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2186  hypothetical protein  27.86 
 
 		 340 aa  65.1  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1805  hypothetical protein  23.96 
 
 		 332 aa  59.7  0.00000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3410  hypothetical protein  25.08 
 
 		 329 aa  58.5  0.0000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2131  hypothetical protein  23.44 
 
 		 343 aa  54.7  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123953  normal  0.732304 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3537  hypothetical protein  25.87 
 
 		 333 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1149  hypothetical protein  25.25 
 
 		 349 aa  54.3  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.520075 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0694  hypothetical protein  25.25 
 
 		 352 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110273  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2707  membrane protein  27.01 
 
 		 362 aa  53.9  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.813899  normal  0.272073 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1173  hypothetical protein  25.25 
 
 		 352 aa  53.9  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4285  hypothetical protein  25.91 
 
 		 347 aa  53.5  0.000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0472  hypothetical protein  25.38 
 
 		 362 aa  53.5  0.000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4018  membrane protein  25.55 
 
 		 333 aa  52.4  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.581162 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4123  hypothetical protein  25.87 
 
 		 333 aa  51.2  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.574237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3650  membrane protein  24.65 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3761  membrane protein  25 
 
 		 377 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3872  membrane protein  24.36 
 
 		 329 aa  51.2  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5079  membrane protein  25.38 
 
 		 362 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1052  hypothetical protein  23.62 
 
 		 347 aa  50.8  0.00003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0582616  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3452  membrane protein  25 
 
 		 397 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2735  hypothetical protein  25.33 
 
 		 348 aa  49.7  0.00007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1055  hypothetical protein  24.92 
 
 		 347 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3396  membrane protein  25.55 
 
 		 333 aa  49.7  0.00007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1769  hypothetical protein  25.33 
 
 		 348 aa  49.7  0.00007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1912  hypothetical protein  24.92 
 
 		 333 aa  49.7  0.00008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2064  hypothetical protein  23.1 
 
 		 331 aa  49.3  0.00009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.263177 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1752  hypothetical protein  25 
 
 		 348 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1177  hypothetical protein  22.05 
 
 		 351 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4451  hypothetical protein  25.23 
 
 		 387 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4083  hypothetical protein  26.87 
 
 		 387 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0934508  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0575  hypothetical protein  25 
 
 		 348 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2794  hypothetical protein  25 
 
 		 348 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2850  hypothetical protein  25 
 
 		 348 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2857  hypothetical protein  25 
 
 		 348 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0626  hypothetical protein  23.1 
 
 		 339 aa  48.5  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0246806 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4564  hypothetical protein  28.36 
 
 		 400 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2199  membrane protein  23.32 
 
 		 331 aa  48.1  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1906  hypothetical protein  25.08 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1022  hypothetical protein  22.46 
 
 		 353 aa  47  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.269523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0338  hypothetical protein  21.3 
 
 		 365 aa  46.6  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.171293 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4298  hypothetical protein  23.03 
 
 		 339 aa  46.2  0.0007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.09392  normal  0.365845 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0306  hypothetical protein  26.73 
 
 		 326 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0487  hypothetical protein  26.73 
 
 		 342 aa  46.2  0.0008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0293  hypothetical protein  26.73 
 
 		 356 aa  46.2  0.0009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0976  membrane protein  25.43 
 
 		 370 aa  45.8  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4469  membrane protein  24.61 
 
 		 333 aa  45.8  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  normal  0.606564 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2075  hypothetical protein  26.1 
 
 		 326 aa  45.1  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4243  hypothetical protein  29.09 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7151  membrane protein  28.1 
 
 		 361 aa  45.4  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7078  hypothetical protein  24.07 
 
 		 323 aa  44.3  0.003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59894 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3018  hypothetical protein  26.1 
 
 		 356 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3329  hypothetical protein  26.1 
 
 		 356 aa  44.7  0.003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306679  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1863  hypothetical protein  27.27 
 
 		 333 aa  43.1  0.006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2024  hypothetical protein  24.62 
 
 		 333 aa  42.7  0.009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241047  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0782  hypothetical protein  24.62 
 
 		 333 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0693  hypothetical protein  24.62 
 
 		 333 aa  42.7  0.01  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>