81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4903 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4903  hypothetical protein  100 
 
 		 333 aa  637    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10734  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3410  hypothetical protein  61.59 
 
 		 329 aa  371  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20680  hypothetical protein  50.15 
 
 		 333 aa  305  6e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2735  hypothetical protein  55.17 
 
 		 348 aa  280  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0575  hypothetical protein  54.86 
 
 		 348 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2850  hypothetical protein  54.86 
 
 		 348 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2794  hypothetical protein  54.86 
 
 		 348 aa  279  5e-74  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1752  hypothetical protein  54.86 
 
 		 348 aa  279  5e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2857  hypothetical protein  54.55 
 
 		 348 aa  278  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1769  hypothetical protein  55.06 
 
 		 348 aa  276  5e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2131  hypothetical protein  52.38 
 
 		 343 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123953  normal  0.732304 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1149  hypothetical protein  50.6 
 
 		 349 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.520075 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4285  hypothetical protein  51.86 
 
 		 347 aa  273  3e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1055  hypothetical protein  51.85 
 
 		 347 aa  271  9e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1052  hypothetical protein  51.86 
 
 		 347 aa  271  1e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0582616  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1173  hypothetical protein  50.62 
 
 		 352 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0694  hypothetical protein  50.62 
 
 		 352 aa  269  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110273  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1177  hypothetical protein  48.65 
 
 		 351 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0387  hypothetical protein  53.65 
 
 		 335 aa  226  3e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1776  membrane protein  45.34 
 
 		 343 aa  204  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2117  hypothetical protein  45.34 
 
 		 338 aa  204  2e-51  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.836019  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1748  hypothetical protein  37.61 
 
 		 338 aa  171  2e-41  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00143942  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2064  hypothetical protein  37.5 
 
 		 331 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.263177 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0263  hypothetical protein  36.02 
 
 		 345 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.611411  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2199  membrane protein  38.11 
 
 		 331 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3650  membrane protein  33.95 
 
 		 377 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0976  membrane protein  34.06 
 
 		 370 aa  145  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1805  hypothetical protein  32.04 
 
 		 332 aa  140  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2024  hypothetical protein  33.43 
 
 		 333 aa  139  6e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241047  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0693  hypothetical protein  33.43 
 
 		 333 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0782  hypothetical protein  33.43 
 
 		 333 aa  139  8.999999999999999e-32  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4298  hypothetical protein  34.63 
 
 		 339 aa  138  1e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.09392  normal  0.365845 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3761  membrane protein  32.13 
 
 		 377 aa  138  1e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1766  hypothetical protein  33.84 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1049  hypothetical protein  33.84 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0487  hypothetical protein  34.46 
 
 		 342 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2068  hypothetical protein  33.84 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0449964  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0472  hypothetical protein  37.18 
 
 		 362 aa  138  1e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1906  hypothetical protein  33.86 
 
 		 328 aa  138  1e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0293  hypothetical protein  34.46 
 
 		 356 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0306  hypothetical protein  34.46 
 
 		 326 aa  137  2e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2075  hypothetical protein  34.15 
 
 		 326 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7151  membrane protein  38.27 
 
 		 361 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3452  membrane protein  31.83 
 
 		 397 aa  137  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0626  hypothetical protein  34.63 
 
 		 339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0246806 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3329  hypothetical protein  34.15 
 
 		 356 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306679  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3018  hypothetical protein  34.15 
 
 		 356 aa  137  4e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3872  membrane protein  35.31 
 
 		 329 aa  133  5e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10202  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5079  membrane protein  36.26 
 
 		 362 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4469  membrane protein  33.64 
 
 		 333 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  normal  0.606564 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4018  membrane protein  33.02 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.581162 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3537  hypothetical protein  32.7 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3396  membrane protein  32.19 
 
 		 333 aa  126  6e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1912  hypothetical protein  30.77 
 
 		 333 aa  125  7e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4123  hypothetical protein  32.19 
 
 		 333 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.574237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1863  hypothetical protein  32.34 
 
 		 333 aa  124  3e-27  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6336  membrane protein  36.63 
 
 		 358 aa  119  6e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7078  hypothetical protein  32.73 
 
 		 323 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59894 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0756  hypothetical protein  33.68 
 
 		 286 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0122  hypothetical protein  33.2 
 
 		 349 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4243  hypothetical protein  30.8 
 
 		 290 aa  96.3  6e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1831  hypothetical protein  29.69 
 
 		 362 aa  96.3  6e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4083  hypothetical protein  31.54 
 
 		 387 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0934508  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2707  membrane protein  36.08 
 
 		 362 aa  96.3  7e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.813899  normal  0.272073 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4564  hypothetical protein  32.17 
 
 		 400 aa  95.9  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4451  hypothetical protein  31.54 
 
 		 387 aa  95.1  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3273  membrane protein  36.51 
 
 		 353 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5051  hypothetical protein  32.83 
 
 		 355 aa  92.8  8e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2922  hypothetical protein  28.08 
 
 		 338 aa  84  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.803043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0338  hypothetical protein  32.95 
 
 		 365 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.171293 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2186  hypothetical protein  27.27 
 
 		 340 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2550  hypothetical protein  25.21 
 
 		 347 aa  60.8  0.00000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3526  hypothetical protein  26.34 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1653  hypothetical protein  25.4 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0319588  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1134  hypothetical protein  26.76 
 
 		 354 aa  51.6  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0518048  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1390  hypothetical protein  40.26 
 
 		 412 aa  51.2  0.00003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0973  hypothetical protein  32.08 
 
 		 360 aa  48.9  0.0001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1692  hypothetical protein  21.71 
 
 		 385 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1486  hypothetical protein  33.33 
 
 		 351 aa  44.3  0.003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1022  hypothetical protein  23.36 
 
 		 353 aa  43.9  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.269523 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1516  hypothetical protein  31.58 
 
 		 353 aa  43.1  0.007  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>