54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dfer_2550 on replicon NC_013037
Organism: Dyadobacter fermentans DSM 18053



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013037  Dfer_2550  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  700    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2922  hypothetical protein  26.69 
 
 		 338 aa  90.9  3e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.803043  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1653  hypothetical protein  26.24 
 
 		 319 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0319588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3526  hypothetical protein  23.94 
 
 		 326 aa  67  0.0000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1805  hypothetical protein  23.56 
 
 		 332 aa  65.1  0.000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1863  hypothetical protein  25.81 
 
 		 333 aa  61.6  0.00000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2186  hypothetical protein  25.87 
 
 		 340 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4903  hypothetical protein  25.21 
 
 		 333 aa  60.8  0.00000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10734  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1912  hypothetical protein  23.28 
 
 		 333 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2199  membrane protein  22.79 
 
 		 331 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3872  membrane protein  23.28 
 
 		 329 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3410  hypothetical protein  23.08 
 
 		 329 aa  56.6  0.0000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3396  membrane protein  21.97 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4123  hypothetical protein  21.97 
 
 		 333 aa  55.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.574237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3650  membrane protein  25 
 
 		 377 aa  54.7  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1906  hypothetical protein  21.25 
 
 		 328 aa  53.9  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0976  membrane protein  24.9 
 
 		 370 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4018  membrane protein  21.9 
 
 		 333 aa  51.2  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.581162 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0472  hypothetical protein  24.07 
 
 		 362 aa  52  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3018  hypothetical protein  25 
 
 		 356 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4469  membrane protein  22.22 
 
 		 333 aa  50.8  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  normal  0.606564 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3329  hypothetical protein  25 
 
 		 356 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306679  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0306  hypothetical protein  25 
 
 		 326 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0293  hypothetical protein  25 
 
 		 356 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2075  hypothetical protein  25 
 
 		 326 aa  51.2  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0487  hypothetical protein  25 
 
 		 342 aa  51.2  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2064  hypothetical protein  22.46 
 
 		 331 aa  50.4  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.263177 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4298  hypothetical protein  21.79 
 
 		 339 aa  50.1  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.09392  normal  0.365845 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20680  hypothetical protein  22.56 
 
 		 333 aa  50.1  0.00006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0626  hypothetical protein  22.75 
 
 		 339 aa  49.7  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0246806 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3537  hypothetical protein  21.9 
 
 		 333 aa  49.3  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4451  hypothetical protein  26.98 
 
 		 387 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0263  hypothetical protein  21.25 
 
 		 345 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.611411  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3761  membrane protein  22.14 
 
 		 377 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0693  hypothetical protein  20.45 
 
 		 333 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2068  hypothetical protein  20.45 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0449964  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2024  hypothetical protein  20.45 
 
 		 333 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241047  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1766  hypothetical protein  20.45 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0782  hypothetical protein  20.45 
 
 		 333 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1049  hypothetical protein  20.45 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1134  hypothetical protein  23.24 
 
 		 354 aa  47.8  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0518048  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3452  membrane protein  22.14 
 
 		 397 aa  47.4  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4083  hypothetical protein  26.19 
 
 		 387 aa  47  0.0005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0934508  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6336  membrane protein  27.56 
 
 		 358 aa  47  0.0005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0756  hypothetical protein  24.82 
 
 		 286 aa  46.2  0.0008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2117  hypothetical protein  22.98 
 
 		 338 aa  46.2  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.836019  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1776  membrane protein  22.98 
 
 		 343 aa  46.2  0.0008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0338  hypothetical protein  22.88 
 
 		 365 aa  45.8  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.171293 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4243  hypothetical protein  22.05 
 
 		 290 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1516  hypothetical protein  24.81 
 
 		 353 aa  43.9  0.004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7151  membrane protein  25.43 
 
 		 361 aa  43.9  0.004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1748  hypothetical protein  22.26 
 
 		 338 aa  43.9  0.004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00143942  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5079  membrane protein  24.46 
 
 		 362 aa  43.5  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1101  hypothetical protein  26.2 
 
 		 347 aa  43.1  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0490804  normal  0.681904 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>