44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1134 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1134  hypothetical protein  100 
 
 		 354 aa  692    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0518048  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0973  hypothetical protein  55.37 
 
 		 360 aa  378  1e-103  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1516  hypothetical protein  54.86 
 
 		 353 aa  373  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1390  hypothetical protein  55.93 
 
 		 412 aa  365  1e-100  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1486  hypothetical protein  56.29 
 
 		 351 aa  332  5e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1022  hypothetical protein  51.45 
 
 		 353 aa  310  2e-83  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.269523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0338  hypothetical protein  28.95 
 
 		 365 aa  143  6e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.171293 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1653  hypothetical protein  28.86 
 
 		 319 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0319588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2186  hypothetical protein  28.25 
 
 		 340 aa  67  0.0000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3526  hypothetical protein  26.55 
 
 		 326 aa  66.2  0.0000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2064  hypothetical protein  27.34 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.263177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0472  hypothetical protein  27.34 
 
 		 362 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805148  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20680  hypothetical protein  26.81 
 
 		 333 aa  58.9  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0487  hypothetical protein  29.43 
 
 		 342 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0293  hypothetical protein  29.43 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3329  hypothetical protein  29.43 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306679  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0263  hypothetical protein  28.28 
 
 		 345 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.611411  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3018  hypothetical protein  29.43 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2199  membrane protein  26.22 
 
 		 331 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5079  membrane protein  27.4 
 
 		 362 aa  57.8  0.0000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3650  membrane protein  23.28 
 
 		 377 aa  56.6  0.0000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0306  hypothetical protein  29.14 
 
 		 326 aa  55.8  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3761  membrane protein  24.07 
 
 		 377 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2075  hypothetical protein  29.14 
 
 		 326 aa  55.8  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3452  membrane protein  24.07 
 
 		 397 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0976  membrane protein  26.18 
 
 		 370 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482306  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1805  hypothetical protein  27.08 
 
 		 332 aa  53.1  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0042  hypothetical protein  22.36 
 
 		 316 aa  53.1  0.000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000066001 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4903  hypothetical protein  39.47 
 
 		 333 aa  51.2  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10734  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4564  hypothetical protein  26.72 
 
 		 400 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4083  hypothetical protein  26.05 
 
 		 387 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0934508  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4451  hypothetical protein  26.05 
 
 		 387 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2550  hypothetical protein  23.24 
 
 		 347 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2117  hypothetical protein  27.44 
 
 		 338 aa  47.8  0.0003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.836019  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1776  membrane protein  27.44 
 
 		 343 aa  47.4  0.0004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6336  membrane protein  29.59 
 
 		 358 aa  47  0.0006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1863  hypothetical protein  31.33 
 
 		 333 aa  46.6  0.0006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1906  hypothetical protein  25.3 
 
 		 328 aa  45.4  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7151  membrane protein  24.73 
 
 		 361 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0122  hypothetical protein  27.27 
 
 		 349 aa  44.7  0.002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0626  hypothetical protein  28.97 
 
 		 339 aa  43.9  0.005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0246806 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4018  membrane protein  28.97 
 
 		 333 aa  43.5  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.581162 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4298  hypothetical protein  28.97 
 
 		 339 aa  42.7  0.009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.09392  normal  0.365845 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3396  membrane protein  31.76 
 
 		 333 aa  42.7  0.01  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>