73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_1831 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011365  Gdia_1831  hypothetical protein  100 
 
 
362 aa  707    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0122  hypothetical protein  39.16 
 
 
349 aa  188  1e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3452  membrane protein  33.13 
 
 
397 aa  137  4e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3761  membrane protein  33.13 
 
 
377 aa  137  4e-31  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3650  membrane protein  32.83 
 
 
377 aa  133  5e-30  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0976  membrane protein  31.83 
 
 
370 aa  129  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482306  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7151  membrane protein  32.93 
 
 
361 aa  127  3e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6336  membrane protein  35.48 
 
 
358 aa  125  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1748  hypothetical protein  32.54 
 
 
338 aa  121  1.9999999999999998e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00143942  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1805  hypothetical protein  28.99 
 
 
332 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2707  membrane protein  35.42 
 
 
362 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.813899  normal  0.272073 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1912  hypothetical protein  28.99 
 
 
333 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3396  membrane protein  30.18 
 
 
333 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4123  hypothetical protein  30.18 
 
 
333 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.574237  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2064  hypothetical protein  30.6 
 
 
331 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.263177 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3410  hypothetical protein  33.07 
 
 
329 aa  110  5e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4018  membrane protein  28.27 
 
 
333 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.581162 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20680  hypothetical protein  29.84 
 
 
333 aa  109  9.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4298  hypothetical protein  29.97 
 
 
339 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.09392  normal  0.365845 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0626  hypothetical protein  28.86 
 
 
339 aa  108  1e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0246806 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3537  hypothetical protein  27.98 
 
 
333 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4469  membrane protein  29.29 
 
 
333 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  normal  0.606564 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2199  membrane protein  31.2 
 
 
331 aa  105  9e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3273  membrane protein  31.53 
 
 
353 aa  102  8e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1776  membrane protein  28.79 
 
 
343 aa  102  1e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0487  hypothetical protein  30.86 
 
 
342 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2024  hypothetical protein  28.27 
 
 
333 aa  102  2e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241047  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0693  hypothetical protein  28.27 
 
 
333 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0306  hypothetical protein  30.86 
 
 
326 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0782  hypothetical protein  28.27 
 
 
333 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0293  hypothetical protein  30.86 
 
 
356 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2117  hypothetical protein  28.79 
 
 
338 aa  101  2e-20  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.836019  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2075  hypothetical protein  30.48 
 
 
326 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3018  hypothetical protein  30.48 
 
 
356 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3329  hypothetical protein  30.48 
 
 
356 aa  100  4e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306679  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1906  hypothetical protein  27.19 
 
 
328 aa  100  5e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1049  hypothetical protein  28.4 
 
 
328 aa  99.8  7e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1766  hypothetical protein  28.4 
 
 
328 aa  99.4  8e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2068  hypothetical protein  28.4 
 
 
328 aa  99.4  8e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0449964  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0756  hypothetical protein  29.5 
 
 
286 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1863  hypothetical protein  31.23 
 
 
333 aa  97.1  4e-19  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3872  membrane protein  27.73 
 
 
329 aa  96.7  6e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10202  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4903  hypothetical protein  29.69 
 
 
333 aa  96.3  7e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10734  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0263  hypothetical protein  30.4 
 
 
345 aa  95.1  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.611411  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5051  hypothetical protein  29.94 
 
 
355 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4451  hypothetical protein  37.7 
 
 
387 aa  94  4e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4083  hypothetical protein  37.7 
 
 
387 aa  93.6  5e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0934508  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4564  hypothetical protein  37.7 
 
 
400 aa  93.2  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0472  hypothetical protein  28.08 
 
 
362 aa  91.7  2e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805148  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7078  hypothetical protein  29.69 
 
 
323 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.59894 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4243  hypothetical protein  29.79 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5079  membrane protein  27.89 
 
 
362 aa  79.3  0.00000000000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1149  hypothetical protein  35.77 
 
 
349 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.520075 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1177  hypothetical protein  37.98 
 
 
351 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4285  hypothetical protein  36.22 
 
 
347 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1055  hypothetical protein  35.94 
 
 
347 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1052  hypothetical protein  35.94 
 
 
347 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0582616  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2857  hypothetical protein  37.29 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0575  hypothetical protein  37.29 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2794  hypothetical protein  37.29 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2850  hypothetical protein  37.29 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2735  hypothetical protein  37.29 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1752  hypothetical protein  37.29 
 
 
348 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0694  hypothetical protein  35.42 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110273  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1173  hypothetical protein  35.42 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1769  hypothetical protein  33.15 
 
 
348 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2131  hypothetical protein  35.43 
 
 
343 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123953  normal  0.732304 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0338  hypothetical protein  30.23 
 
 
365 aa  63.2  0.000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.171293 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0387  hypothetical protein  33.59 
 
 
335 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2186  hypothetical protein  28.78 
 
 
340 aa  55.5  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1653  hypothetical protein  29.03 
 
 
319 aa  52.8  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0319588  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0973  hypothetical protein  30.53 
 
 
360 aa  49.3  0.00009  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3526  hypothetical protein  26.39 
 
 
326 aa  46.2  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>