75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rmet_3410 on replicon NC_007973
Organism: Cupriavidus metallidurans CH34



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007973  Rmet_3410  hypothetical protein  100 
 
 		 329 aa  634    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4903  hypothetical protein  61.59 
 
 		 333 aa  353  2e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10734  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20680  hypothetical protein  49.07 
 
 		 333 aa  275  5e-73  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1769  hypothetical protein  52.6 
 
 		 348 aa  266  2.9999999999999995e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1052  hypothetical protein  51.57 
 
 		 347 aa  266  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0582616  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1752  hypothetical protein  51.95 
 
 		 348 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2850  hypothetical protein  51.95 
 
 		 348 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2735  hypothetical protein  52.27 
 
 		 348 aa  265  1e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2794  hypothetical protein  51.95 
 
 		 348 aa  264  1e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4285  hypothetical protein  50.95 
 
 		 347 aa  265  1e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0575  hypothetical protein  51.95 
 
 		 348 aa  264  1e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2857  hypothetical protein  51.62 
 
 		 348 aa  263  4e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1055  hypothetical protein  51.09 
 
 		 347 aa  262  6e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1149  hypothetical protein  50.32 
 
 		 349 aa  260  2e-68  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.520075 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2131  hypothetical protein  50 
 
 		 343 aa  258  9e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123953  normal  0.732304 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1173  hypothetical protein  49.84 
 
 		 352 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0694  hypothetical protein  49.84 
 
 		 352 aa  256  3e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110273  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1177  hypothetical protein  45.87 
 
 		 351 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0387  hypothetical protein  48.92 
 
 		 335 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2117  hypothetical protein  42.16 
 
 		 338 aa  189  5.999999999999999e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.836019  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1776  membrane protein  42.16 
 
 		 343 aa  189  8e-47  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0263  hypothetical protein  38.12 
 
 		 345 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.611411  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1748  hypothetical protein  36.92 
 
 		 338 aa  145  9e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00143942  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0976  membrane protein  33.54 
 
 		 370 aa  144  1e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3650  membrane protein  32.72 
 
 		 377 aa  144  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0487  hypothetical protein  35.22 
 
 		 342 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2064  hypothetical protein  36.73 
 
 		 331 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.263177 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0293  hypothetical protein  35.22 
 
 		 356 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0306  hypothetical protein  35.22 
 
 		 326 aa  144  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3329  hypothetical protein  34.93 
 
 		 356 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306679  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3018  hypothetical protein  34.93 
 
 		 356 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2075  hypothetical protein  34.93 
 
 		 326 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0472  hypothetical protein  36.02 
 
 		 362 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805148  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3761  membrane protein  32.42 
 
 		 377 aa  139  4.999999999999999e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3452  membrane protein  32.42 
 
 		 397 aa  139  6e-32  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2199  membrane protein  36.42 
 
 		 331 aa  136  5e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1912  hypothetical protein  34.06 
 
 		 333 aa  132  9e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7078  hypothetical protein  35.42 
 
 		 323 aa  130  3e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59894 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4298  hypothetical protein  33.24 
 
 		 339 aa  129  8.000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.09392  normal  0.365845 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0626  hypothetical protein  33.24 
 
 		 339 aa  129  9.000000000000001e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0246806 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1805  hypothetical protein  31.42 
 
 		 332 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1906  hypothetical protein  34.05 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1049  hypothetical protein  34.37 
 
 		 328 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2024  hypothetical protein  34.37 
 
 		 333 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241047  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3396  membrane protein  32.82 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1766  hypothetical protein  34.37 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4469  membrane protein  33.85 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  normal  0.606564 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2068  hypothetical protein  34.37 
 
 		 328 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0449964  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0693  hypothetical protein  34.37 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0782  hypothetical protein  34.37 
 
 		 333 aa  127  3e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5079  membrane protein  36.57 
 
 		 362 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3537  hypothetical protein  32.3 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4018  membrane protein  32.61 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.581162 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4123  hypothetical protein  32.51 
 
 		 333 aa  125  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.574237  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1863  hypothetical protein  30.79 
 
 		 333 aa  120  3.9999999999999996e-26  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7151  membrane protein  33.23 
 
 		 361 aa  119  9e-26  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3872  membrane protein  32.39 
 
 		 329 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10202  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1831  hypothetical protein  33.07 
 
 		 362 aa  110  3e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0756  hypothetical protein  34.49 
 
 		 286 aa  109  5e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6336  membrane protein  34.81 
 
 		 358 aa  106  5e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2707  membrane protein  36.02 
 
 		 362 aa  103  5e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.813899  normal  0.272073 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3273  membrane protein  36.43 
 
 		 353 aa  102  6e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0122  hypothetical protein  32.81 
 
 		 349 aa  99.8  6e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4243  hypothetical protein  31.99 
 
 		 290 aa  95.9  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5051  hypothetical protein  32.07 
 
 		 355 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4083  hypothetical protein  27.76 
 
 		 387 aa  81.3  0.00000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0934508  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4451  hypothetical protein  27.76 
 
 		 387 aa  80.1  0.00000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4564  hypothetical protein  40 
 
 		 400 aa  74.7  0.000000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3526  hypothetical protein  28.74 
 
 		 326 aa  66.6  0.0000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2922  hypothetical protein  25.08 
 
 		 338 aa  63.9  0.000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.803043  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0338  hypothetical protein  36.21 
 
 		 365 aa  59.7  0.00000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.171293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2550  hypothetical protein  23.08 
 
 		 347 aa  56.6  0.0000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1653  hypothetical protein  27.85 
 
 		 319 aa  54.7  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0319588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2186  hypothetical protein  28.52 
 
 		 340 aa  52.4  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0973  hypothetical protein  32.61 
 
 		 360 aa  44.7  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>