44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1022 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1022  hypothetical protein  100 
 
 
353 aa  691    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.269523 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1516  hypothetical protein  49.4 
 
 
353 aa  328  6e-89  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1390  hypothetical protein  47.98 
 
 
412 aa  319  6e-86  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0973  hypothetical protein  49.13 
 
 
360 aa  315  9.999999999999999e-85  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1134  hypothetical protein  51.45 
 
 
354 aa  310  2e-83  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0518048  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1486  hypothetical protein  48.55 
 
 
351 aa  290  2e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0338  hypothetical protein  27.74 
 
 
365 aa  132  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.171293 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1653  hypothetical protein  26.48 
 
 
319 aa  79  0.0000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0319588  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2186  hypothetical protein  28.07 
 
 
340 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3526  hypothetical protein  28.21 
 
 
326 aa  74.7  0.000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0263  hypothetical protein  26.57 
 
 
345 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.611411  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2064  hypothetical protein  25.89 
 
 
331 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.263177 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1805  hypothetical protein  26.94 
 
 
332 aa  54.7  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2922  hypothetical protein  22.73 
 
 
338 aa  53.9  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.803043  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1863  hypothetical protein  24.53 
 
 
333 aa  53.5  0.000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20680  hypothetical protein  25 
 
 
333 aa  53.1  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4451  hypothetical protein  35.94 
 
 
387 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0976  membrane protein  24.49 
 
 
370 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482306  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4564  hypothetical protein  32.53 
 
 
400 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2199  membrane protein  25.17 
 
 
331 aa  52  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4083  hypothetical protein  34.38 
 
 
387 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0934508  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2075  hypothetical protein  24.93 
 
 
326 aa  50.1  0.00005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0306  hypothetical protein  25.22 
 
 
326 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3329  hypothetical protein  24.93 
 
 
356 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306679  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0293  hypothetical protein  25.22 
 
 
356 aa  50.1  0.00006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0472  hypothetical protein  28.37 
 
 
362 aa  50.1  0.00006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805148  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3018  hypothetical protein  24.93 
 
 
356 aa  50.1  0.00006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3761  membrane protein  23.73 
 
 
377 aa  49.7  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1628  hypothetical protein  23.37 
 
 
321 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.119039  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7078  hypothetical protein  25.51 
 
 
323 aa  48.9  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.59894 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3452  membrane protein  23.73 
 
 
397 aa  49.3  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2117  hypothetical protein  24.54 
 
 
338 aa  48.9  0.0001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.836019  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1776  membrane protein  24.55 
 
 
343 aa  48.5  0.0002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0487  hypothetical protein  24.93 
 
 
342 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3650  membrane protein  23.59 
 
 
377 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4903  hypothetical protein  24.22 
 
 
333 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10734  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4469  membrane protein  24.49 
 
 
333 aa  45.4  0.001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  normal  0.606564 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1912  hypothetical protein  25.82 
 
 
333 aa  46.2  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5079  membrane protein  26.95 
 
 
362 aa  44.3  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2691  hypothetical protein  31.71 
 
 
335 aa  44.7  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.592258 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4123  hypothetical protein  25.23 
 
 
333 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.574237  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4243  hypothetical protein  25.23 
 
 
290 aa  43.1  0.007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3396  membrane protein  24.18 
 
 
333 aa  43.1  0.008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4018  membrane protein  25.31 
 
 
333 aa  42.7  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.581162 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>