53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1486 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1486  hypothetical protein  100 
 
 		 351 aa  689    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1390  hypothetical protein  63.64 
 
 		 412 aa  429  1e-119  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1516  hypothetical protein  61.21 
 
 		 353 aa  398  9.999999999999999e-111  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0973  hypothetical protein  59.71 
 
 		 360 aa  399  9.999999999999999e-111  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1134  hypothetical protein  56.29 
 
 		 354 aa  347  2e-94  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0518048  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1022  hypothetical protein  48.55 
 
 		 353 aa  303  3.0000000000000004e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.269523 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0338  hypothetical protein  28.87 
 
 		 365 aa  139  1e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.171293 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2186  hypothetical protein  26.61 
 
 		 340 aa  75.9  0.000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0976  membrane protein  24.92 
 
 		 370 aa  62.4  0.00000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482306  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3761  membrane protein  26.53 
 
 		 377 aa  59.7  0.00000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1653  hypothetical protein  21.78 
 
 		 319 aa  59.3  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0319588  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3452  membrane protein  26.53 
 
 		 397 aa  58.9  0.0000001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3526  hypothetical protein  23.6 
 
 		 326 aa  56.6  0.0000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2064  hypothetical protein  25.61 
 
 		 331 aa  55.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.263177 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3537  hypothetical protein  27.66 
 
 		 333 aa  55.8  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1912  hypothetical protein  28.09 
 
 		 333 aa  55.1  0.000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4018  membrane protein  27.3 
 
 		 333 aa  54.3  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.581162 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4564  hypothetical protein  29.06 
 
 		 400 aa  53.1  0.000006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3650  membrane protein  25.76 
 
 		 377 aa  52  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4451  hypothetical protein  32.14 
 
 		 387 aa  50.8  0.00003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0263  hypothetical protein  25.37 
 
 		 345 aa  51.2  0.00003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.611411  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4083  hypothetical protein  32.14 
 
 		 387 aa  50.8  0.00004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0934508  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5079  membrane protein  32.65 
 
 		 362 aa  49.7  0.00007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0122  hypothetical protein  31.73 
 
 		 349 aa  49.7  0.00008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1906  hypothetical protein  26.69 
 
 		 328 aa  49.7  0.00008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0306  hypothetical protein  25.15 
 
 		 326 aa  48.9  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3329  hypothetical protein  25.07 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306679  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2075  hypothetical protein  25.15 
 
 		 326 aa  49.3  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3018  hypothetical protein  25.07 
 
 		 356 aa  48.9  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7151  membrane protein  25.09 
 
 		 361 aa  48.9  0.0001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4123  hypothetical protein  27.41 
 
 		 333 aa  48.9  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.574237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3396  membrane protein  27.41 
 
 		 333 aa  49.3  0.0001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0487  hypothetical protein  24.93 
 
 		 342 aa  48.1  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0293  hypothetical protein  25.07 
 
 		 356 aa  48.5  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1049  hypothetical protein  26.04 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4243  hypothetical protein  27.59 
 
 		 290 aa  48.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2024  hypothetical protein  26.04 
 
 		 333 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241047  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4469  membrane protein  26.64 
 
 		 333 aa  47.8  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  normal  0.606564 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1766  hypothetical protein  26.04 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0693  hypothetical protein  26.04 
 
 		 333 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0782  hypothetical protein  26.04 
 
 		 333 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0756  hypothetical protein  26.04 
 
 		 286 aa  47.4  0.0003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2068  hypothetical protein  26.04 
 
 		 328 aa  47.8  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0449964  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3872  membrane protein  25 
 
 		 329 aa  47  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0626  hypothetical protein  26.58 
 
 		 339 aa  47  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0246806 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2199  membrane protein  24.9 
 
 		 331 aa  47  0.0006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2922  hypothetical protein  24.38 
 
 		 338 aa  46.6  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.803043  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3273  membrane protein  30.23 
 
 		 353 aa  45.4  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2707  membrane protein  37.5 
 
 		 362 aa  44.7  0.002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.813899  normal  0.272073 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4298  hypothetical protein  26.13 
 
 		 339 aa  45.1  0.002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.09392  normal  0.365845 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0472  hypothetical protein  29.59 
 
 		 362 aa  43.9  0.004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805148  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4903  hypothetical protein  33.33 
 
 		 333 aa  43.9  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10734  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20680  hypothetical protein  23.7 
 
 		 333 aa  42.7  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>