80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avin_20680 on replicon NC_012560
Organism: Azotobacter vinelandii DJ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012560  Avin_20680  hypothetical protein  100 
 
 
333 aa  641    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3410  hypothetical protein  49.68 
 
 
329 aa  277  2e-73  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4903  hypothetical protein  49.84 
 
 
333 aa  271  8.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10734  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1052  hypothetical protein  47.35 
 
 
347 aa  238  9e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0582616  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1055  hypothetical protein  46.93 
 
 
347 aa  234  1.0000000000000001e-60  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4285  hypothetical protein  46.86 
 
 
347 aa  233  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1149  hypothetical protein  47.78 
 
 
349 aa  232  5e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.520075 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1173  hypothetical protein  47.78 
 
 
352 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0694  hypothetical protein  47.78 
 
 
352 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110273  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2131  hypothetical protein  47.47 
 
 
343 aa  231  1e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123953  normal  0.732304 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0575  hypothetical protein  47.76 
 
 
348 aa  228  9e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2850  hypothetical protein  47.76 
 
 
348 aa  228  9e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2794  hypothetical protein  47.76 
 
 
348 aa  228  9e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1752  hypothetical protein  47.76 
 
 
348 aa  228  9e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1769  hypothetical protein  47.57 
 
 
348 aa  226  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2857  hypothetical protein  47.44 
 
 
348 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2735  hypothetical protein  47.44 
 
 
348 aa  226  3e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1177  hypothetical protein  45.69 
 
 
351 aa  220  3e-56  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0387  hypothetical protein  47.08 
 
 
335 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1776  membrane protein  41.67 
 
 
343 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2117  hypothetical protein  41.67 
 
 
338 aa  200  1.9999999999999998e-50  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.836019  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1748  hypothetical protein  37.8 
 
 
338 aa  173  3.9999999999999995e-42  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00143942  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3650  membrane protein  34.58 
 
 
377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0293  hypothetical protein  38.92 
 
 
356 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0306  hypothetical protein  38.92 
 
 
326 aa  160  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3329  hypothetical protein  38.61 
 
 
356 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306679  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2075  hypothetical protein  38.61 
 
 
326 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3018  hypothetical protein  38.61 
 
 
356 aa  160  4e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0487  hypothetical protein  38.61 
 
 
342 aa  160  4e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2064  hypothetical protein  37.42 
 
 
331 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.263177 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0263  hypothetical protein  38.02 
 
 
345 aa  156  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.611411  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2024  hypothetical protein  34.48 
 
 
333 aa  153  5e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241047  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0782  hypothetical protein  34.48 
 
 
333 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0693  hypothetical protein  34.48 
 
 
333 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1049  hypothetical protein  34.48 
 
 
328 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1766  hypothetical protein  34.48 
 
 
328 aa  152  7e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2068  hypothetical protein  34.48 
 
 
328 aa  152  7e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0449964  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1906  hypothetical protein  34.17 
 
 
328 aa  150  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2199  membrane protein  36.71 
 
 
331 aa  150  3e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1912  hypothetical protein  33.23 
 
 
333 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0472  hypothetical protein  39.57 
 
 
362 aa  149  5e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805148  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3761  membrane protein  32.71 
 
 
377 aa  149  6e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3452  membrane protein  32.4 
 
 
397 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4123  hypothetical protein  33.12 
 
 
333 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.574237  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4018  membrane protein  33.33 
 
 
333 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.581162 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3396  membrane protein  32.81 
 
 
333 aa  143  3e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1863  hypothetical protein  34.58 
 
 
333 aa  143  4e-33  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3537  hypothetical protein  33.02 
 
 
333 aa  142  9e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7151  membrane protein  34.64 
 
 
361 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0976  membrane protein  31.97 
 
 
370 aa  140  3e-32  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482306  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4469  membrane protein  33.75 
 
 
333 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  normal  0.606564 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4298  hypothetical protein  32.83 
 
 
339 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.09392  normal  0.365845 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5079  membrane protein  36.86 
 
 
362 aa  138  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3872  membrane protein  33.45 
 
 
329 aa  137  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10202  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1805  hypothetical protein  31.48 
 
 
332 aa  135  8e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6336  membrane protein  34.64 
 
 
358 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0626  hypothetical protein  31.93 
 
 
339 aa  133  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0246806 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7078  hypothetical protein  34.59 
 
 
323 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.59894 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0756  hypothetical protein  32.98 
 
 
286 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0122  hypothetical protein  32.44 
 
 
349 aa  125  1e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4243  hypothetical protein  32.46 
 
 
290 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3273  membrane protein  33.85 
 
 
353 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1831  hypothetical protein  29.34 
 
 
362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5051  hypothetical protein  32.04 
 
 
355 aa  110  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4451  hypothetical protein  30.88 
 
 
387 aa  108  1e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4564  hypothetical protein  31.14 
 
 
400 aa  108  1e-22  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4083  hypothetical protein  30.88 
 
 
387 aa  108  2e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0934508  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2707  membrane protein  36.6 
 
 
362 aa  103  4e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.813899  normal  0.272073 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2922  hypothetical protein  25.96 
 
 
338 aa  73.6  0.000000000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.803043  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0338  hypothetical protein  36.73 
 
 
365 aa  70.9  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.171293 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0973  hypothetical protein  35.19 
 
 
360 aa  66.2  0.0000000007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2186  hypothetical protein  26.89 
 
 
340 aa  63.9  0.000000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3526  hypothetical protein  26.36 
 
 
326 aa  62  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1653  hypothetical protein  26.57 
 
 
319 aa  60.1  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0319588  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1390  hypothetical protein  32.48 
 
 
412 aa  53.9  0.000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1134  hypothetical protein  25.52 
 
 
354 aa  53.5  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0518048  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1516  hypothetical protein  25.7 
 
 
353 aa  53.5  0.000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2550  hypothetical protein  24.25 
 
 
347 aa  52.8  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1692  hypothetical protein  20.3 
 
 
385 aa  50.8  0.00004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1022  hypothetical protein  24.69 
 
 
353 aa  43.9  0.004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.269523 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>