85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1653 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_1653  hypothetical protein  100 
 
 
319 aa  626  1e-178  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0319588  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3526  hypothetical protein  63.64 
 
 
326 aa  366  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2186  hypothetical protein  51.13 
 
 
340 aa  265  1e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0626  hypothetical protein  27.64 
 
 
339 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0246806 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3537  hypothetical protein  30.6 
 
 
333 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3396  membrane protein  27.74 
 
 
333 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4123  hypothetical protein  27.74 
 
 
333 aa  86.3  6e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.574237  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1912  hypothetical protein  27.74 
 
 
333 aa  86.3  7e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2550  hypothetical protein  27.34 
 
 
347 aa  86.3  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4469  membrane protein  26.95 
 
 
333 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  normal  0.606564 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1906  hypothetical protein  29.57 
 
 
328 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2922  hypothetical protein  28.33 
 
 
338 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.803043  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4298  hypothetical protein  28.12 
 
 
339 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.09392  normal  0.365845 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1134  hypothetical protein  27.49 
 
 
354 aa  83.6  0.000000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0518048  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1805  hypothetical protein  25.81 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3872  membrane protein  30.12 
 
 
329 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10202  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4018  membrane protein  26.54 
 
 
333 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.581162 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1776  membrane protein  31.78 
 
 
343 aa  79.3  0.00000000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2117  hypothetical protein  31.78 
 
 
338 aa  79.3  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.836019  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4243  hypothetical protein  29.86 
 
 
290 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1863  hypothetical protein  28.23 
 
 
333 aa  78.2  0.0000000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0976  membrane protein  27.56 
 
 
370 aa  77.4  0.0000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482306  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2024  hypothetical protein  25.73 
 
 
333 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241047  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0693  hypothetical protein  25.73 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0782  hypothetical protein  25.73 
 
 
333 aa  76.3  0.0000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1748  hypothetical protein  27.88 
 
 
338 aa  75.9  0.0000000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00143942  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3650  membrane protein  26.98 
 
 
377 aa  75.9  0.0000000000009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1766  hypothetical protein  27.27 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2068  hypothetical protein  27.27 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0449964  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1049  hypothetical protein  27.27 
 
 
328 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0756  hypothetical protein  27.27 
 
 
286 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3761  membrane protein  25.65 
 
 
377 aa  73.2  0.000000000006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3452  membrane protein  26.52 
 
 
397 aa  72.8  0.000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2064  hypothetical protein  26.88 
 
 
331 aa  69.7  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.263177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0472  hypothetical protein  28.36 
 
 
362 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805148  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1390  hypothetical protein  28.43 
 
 
412 aa  69.3  0.00000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0293  hypothetical protein  31.34 
 
 
356 aa  68.9  0.00000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1177  hypothetical protein  28.57 
 
 
351 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0306  hypothetical protein  31.34 
 
 
326 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0487  hypothetical protein  31.34 
 
 
342 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1022  hypothetical protein  27.5 
 
 
353 aa  68.9  0.0000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.269523 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3329  hypothetical protein  31.27 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306679  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2199  membrane protein  27.91 
 
 
331 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3018  hypothetical protein  31.27 
 
 
356 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2075  hypothetical protein  31.27 
 
 
326 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5051  hypothetical protein  28.46 
 
 
355 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1516  hypothetical protein  26.37 
 
 
353 aa  66.6  0.0000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7078  hypothetical protein  26.69 
 
 
323 aa  66.2  0.0000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.59894 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7151  membrane protein  27.16 
 
 
361 aa  64.3  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5079  membrane protein  27.61 
 
 
362 aa  64.3  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0263  hypothetical protein  30.62 
 
 
345 aa  64.3  0.000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.611411  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1018  hypothetical protein  21.23 
 
 
338 aa  60.5  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6336  membrane protein  27.63 
 
 
358 aa  60.1  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0973  hypothetical protein  25 
 
 
360 aa  60.1  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0122  hypothetical protein  22.11 
 
 
349 aa  58.9  0.0000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1831  hypothetical protein  22.44 
 
 
362 aa  57  0.0000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20680  hypothetical protein  26.13 
 
 
333 aa  57  0.0000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3410  hypothetical protein  28.57 
 
 
329 aa  56.6  0.0000005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2131  hypothetical protein  25.9 
 
 
343 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123953  normal  0.732304 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4285  hypothetical protein  26.82 
 
 
347 aa  56.6  0.0000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1173  hypothetical protein  27.48 
 
 
352 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1149  hypothetical protein  27.48 
 
 
349 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.520075 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0694  hypothetical protein  27.48 
 
 
352 aa  55.8  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110273  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0338  hypothetical protein  23.95 
 
 
365 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.171293 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1193  hypothetical protein  25.98 
 
 
345 aa  52.8  0.000008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.41231  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1055  hypothetical protein  25.81 
 
 
347 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4903  hypothetical protein  24.04 
 
 
333 aa  51.6  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10734  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1052  hypothetical protein  25.48 
 
 
347 aa  51.6  0.00002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0582616  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1486  hypothetical protein  23.12 
 
 
351 aa  50.8  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3273  membrane protein  26.53 
 
 
353 aa  49.7  0.00008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4083  hypothetical protein  25.08 
 
 
387 aa  48.1  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0934508  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0053  hypothetical protein  22.14 
 
 
340 aa  48.5  0.0002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4564  hypothetical protein  29.17 
 
 
400 aa  47.4  0.0003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1769  hypothetical protein  32.18 
 
 
348 aa  47.4  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2735  hypothetical protein  31.03 
 
 
348 aa  47.4  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0575  hypothetical protein  29.89 
 
 
348 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2857  hypothetical protein  29.89 
 
 
348 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2850  hypothetical protein  29.89 
 
 
348 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2794  hypothetical protein  29.89 
 
 
348 aa  46.6  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1752  hypothetical protein  29.89 
 
 
348 aa  46.6  0.0005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  20.87 
 
 
340 aa  47  0.0005  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4451  hypothetical protein  24.76 
 
 
387 aa  46.2  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2780  hypothetical protein  25 
 
 
333 aa  46.2  0.0007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0770  hypothetical protein  21.05 
 
 
340 aa  45.8  0.001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1148  hypothetical protein  18.92 
 
 
340 aa  42.4  0.01  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>