78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene M446_6336 on replicon NC_010511
Organism: Methylobacterium sp. 4-46



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010511  M446_6336  membrane protein  100 
 
 		 358 aa  682    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00319801 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7151  membrane protein  88.34 
 
 		 361 aa  558  1e-158  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0976  membrane protein  66.67 
 
 		 370 aa  433  1e-120  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482306  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3452  membrane protein  62.26 
 
 		 397 aa  422  1e-117  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.147262 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3761  membrane protein  62.26 
 
 		 377 aa  421  1e-117  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3650  membrane protein  64.04 
 
 		 377 aa  412  1e-114  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.0534573 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1748  hypothetical protein  41.01 
 
 		 338 aa  197  3e-49  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00143942  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5051  hypothetical protein  41.28 
 
 		 355 aa  167  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.504721 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4083  hypothetical protein  40.97 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0934508  normal  0.448511 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4451  hypothetical protein  40.97 
 
 		 387 aa  164  3e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1912  hypothetical protein  37.04 
 
 		 333 aa  163  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.68349 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4564  hypothetical protein  42.37 
 
 		 400 aa  162  6e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3537  hypothetical protein  37 
 
 		 333 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4018  membrane protein  36.39 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.581162 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4469  membrane protein  37 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.529576  normal  0.606564 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3396  membrane protein  37.23 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3273  membrane protein  42.71 
 
 		 353 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4123  hypothetical protein  37.23 
 
 		 333 aa  157  2e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.574237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2707  membrane protein  46.88 
 
 		 362 aa  155  1e-36  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.813899  normal  0.272073 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1863  hypothetical protein  36.89 
 
 		 333 aa  154  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1805  hypothetical protein  35 
 
 		 332 aa  152  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13446 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1906  hypothetical protein  37.26 
 
 		 328 aa  151  2e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3872  membrane protein  37.97 
 
 		 329 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.10202  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20680  hypothetical protein  33.23 
 
 		 333 aa  146  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2024  hypothetical protein  35.29 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241047  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0693  hypothetical protein  35.83 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0782  hypothetical protein  35.83 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1776  membrane protein  38.17 
 
 		 343 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2117  hypothetical protein  38.17 
 
 		 338 aa  144  2e-33  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.836019  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1049  hypothetical protein  35.56 
 
 		 328 aa  143  4e-33  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1766  hypothetical protein  36.1 
 
 		 328 aa  143  5e-33  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2068  hypothetical protein  36.1 
 
 		 328 aa  143  5e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0449964  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0626  hypothetical protein  35.35 
 
 		 339 aa  142  7e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0246806 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4298  hypothetical protein  34.71 
 
 		 339 aa  142  8e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.09392  normal  0.365845 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4243  hypothetical protein  38.15 
 
 		 290 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0756  hypothetical protein  39.18 
 
 		 286 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1831  hypothetical protein  34.53 
 
 		 362 aa  135  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2064  hypothetical protein  32.34 
 
 		 331 aa  133  5e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.263177 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2199  membrane protein  33.54 
 
 		 331 aa  129  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4903  hypothetical protein  36.63 
 
 		 333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.10734  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7078  hypothetical protein  34.81 
 
 		 323 aa  127  3e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59894 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0263  hypothetical protein  31.76 
 
 		 345 aa  119  6e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.611411  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3410  hypothetical protein  34.13 
 
 		 329 aa  116  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0122  hypothetical protein  33.87 
 
 		 349 aa  113  5e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3018  hypothetical protein  30.5 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3329  hypothetical protein  30.5 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.306679  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2075  hypothetical protein  30.5 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0293  hypothetical protein  31.09 
 
 		 356 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0306  hypothetical protein  31.09 
 
 		 326 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.155732  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5079  membrane protein  31 
 
 		 362 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.114247  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0487  hypothetical protein  30.77 
 
 		 342 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0472  hypothetical protein  29.52 
 
 		 362 aa  104  2e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.805148  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1177  hypothetical protein  30.53 
 
 		 351 aa  104  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2131  hypothetical protein  33.1 
 
 		 343 aa  92.8  8e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.123953  normal  0.732304 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1173  hypothetical protein  31.25 
 
 		 352 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.333204  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0694  hypothetical protein  31.25 
 
 		 352 aa  91.3  2e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.110273  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1149  hypothetical protein  31.25 
 
 		 349 aa  90.5  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.520075 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1052  hypothetical protein  34.09 
 
 		 347 aa  89.7  7e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0582616  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4285  hypothetical protein  34.48 
 
 		 347 aa  89.7  7e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1055  hypothetical protein  33.99 
 
 		 347 aa  88.6  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1769  hypothetical protein  35.29 
 
 		 348 aa  85.9  0.000000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1752  hypothetical protein  34.9 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.365941  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2794  hypothetical protein  34.9 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0575  hypothetical protein  34.9 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.718045  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2850  hypothetical protein  34.9 
 
 		 348 aa  83.2  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2735  hypothetical protein  34.9 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2857  hypothetical protein  35.54 
 
 		 348 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2186  hypothetical protein  28.62 
 
 		 340 aa  73.2  0.000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0387  hypothetical protein  30.42 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1653  hypothetical protein  26.95 
 
 		 319 aa  66.2  0.0000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0319588  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0338  hypothetical protein  32.7 
 
 		 365 aa  64.3  0.000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.171293 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0973  hypothetical protein  25.45 
 
 		 360 aa  61.6  0.00000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3526  hypothetical protein  26.45 
 
 		 326 aa  54.7  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2550  hypothetical protein  26.52 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1516  hypothetical protein  27.68 
 
 		 353 aa  47.4  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1022  hypothetical protein  25.3 
 
 		 353 aa  47  0.0005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.269523 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1134  hypothetical protein  29.59 
 
 		 354 aa  47  0.0005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0518048  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1744  hypothetical protein  24.42 
 
 		 302 aa  44.3  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>